More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2489 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2489  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  100 
 
 		 282 aa  577  1e-164  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  57.24 
 
 		 285 aa  321  9.000000000000001e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0593  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  52.13 
 
 		 285 aa  296  2e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3055  rhodanese-like protein  51.61 
 
 		 279 aa  280  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.403851  normal  0.0127336 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6785  Rhodanese domain protein  50.71 
 
 		 289 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0412413  hitchhiker  0.0000256266 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1239  Rhodanese domain protein  51.26 
 
 		 284 aa  271  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.954881  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2831  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  50.36 
 
 		 289 aa  269  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4099  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  49.3 
 
 		 284 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3212  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  50.57 
 
 		 299 aa  268  7e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389078  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2226  thiosulfate sulfurtransferase protein  50 
 
 		 296 aa  267  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2038  Rhodanese domain protein  52.83 
 
 		 295 aa  267  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2431  Rhodanese domain protein  52.45 
 
 		 295 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0305  Rhodanese domain protein  47.37 
 
 		 285 aa  265  5.999999999999999e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4824  rhodanese domain-containing protein  49.64 
 
 		 289 aa  265  7e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0196782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3246  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.5 
 
 		 289 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0068458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2620  rhodanese-like protein  48.87 
 
 		 285 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0325  rhodanese domain-containing protein  48.57 
 
 		 289 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0877  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  50 
 
 		 287 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0847  rhodanese domain-containing protein  48.57 
 
 		 289 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2539  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.57 
 
 		 289 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920072  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32980  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase protein  49.3 
 
 		 284 aa  260  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2397  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.57 
 
 		 289 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0359  rhodanese domain-containing protein  48.57 
 
 		 289 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1507  rhodanese domain-containing protein  48.57 
 
 		 289 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1701  rhodanese domain-containing protein  48.57 
 
 		 289 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0610  rhodanese domain-containing protein  48.21 
 
 		 289 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4992  rhodanese domain-containing protein  46.59 
 
 		 284 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0347  rhodanese domain-containing protein  46.24 
 
 		 284 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.772652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5168  rhodanese domain-containing protein  47.14 
 
 		 284 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3772  rhodanese domain-containing protein  47.5 
 
 		 289 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0206148 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3952  rhodanese domain-containing protein  46.98 
 
 		 290 aa  256  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47500  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.25 
 
 		 284 aa  254  8e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2636  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  50.38 
 
 		 292 aa  254  9e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.488566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3367  rhodanese domain-containing protein  48.21 
 
 		 312 aa  252  4.0000000000000004e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5118  rhodanese domain protein  45.88 
 
 		 284 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0952  Rhodanese domain protein  48.01 
 
 		 284 aa  251  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63885  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4490  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.93 
 
 		 289 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3875  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.93 
 
 		 289 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.403807 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3652  rhodanese domain-containing protein  48.93 
 
 		 289 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2237  rhodanese domain-containing protein  45.92 
 
 		 304 aa  249  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.814145  normal  0.0284823 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2215  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.57 
 
 		 289 aa  246  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1319  Rhodanese domain protein  48.87 
 
 		 300 aa  241  7e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.147779  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0420  rhodanese-like domain protein  44.88 
 
 		 285 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3485  rhodanese domain-containing protein  46.07 
 
 		 278 aa  239  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1708  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.44 
 
 		 276 aa  239  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1326  Rhodanese domain protein  46.85 
 
 		 283 aa  238  5.999999999999999e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0377463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5343  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.09 
 
 		 284 aa  237  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  45.04 
 
 		 288 aa  236  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2010  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.48 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0121868  hitchhiker  0.0031153 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  44.77 
 
 		 278 aa  236  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00777  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.54 
 
 		 290 aa  235  7e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0224116  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1566  Rhodanese domain protein  43.77 
 
 		 302 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1769  rhodanese domain-containing protein  45.77 
 
 		 284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000405789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4756  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.46 
 
 		 284 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0846963 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0177  Rhodanese domain-containing protein  46.43 
 
 		 278 aa  232  5e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000691288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3278  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.22 
 
 		 330 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.33 
 
 		 300 aa  228  6e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0951  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.81 
 
 		 299 aa  228  8e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1426  Rhodanese domain protein  44 
 
 		 276 aa  227  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.630889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2427  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.82 
 
 		 280 aa  227  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.244086 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1033  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.81 
 
 		 310 aa  227  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0667917 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2880  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.48 
 
 		 289 aa  226  3e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518579  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1496  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.57 
 
 		 300 aa  226  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  43.37 
 
 		 291 aa  226  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27500  rhodanese-related sulfurtransferase  47.31 
 
 		 280 aa  223  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0764  Rhodanese domain protein  42.4 
 
 		 281 aa  223  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2346  rhodanese domain-containing protein  42.59 
 
 		 272 aa  223  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1745  rhodanese-like domain protein  38.49 
 
 		 277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000561696  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1872  Rhodanese domain protein  40.37 
 
 		 274 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.494935  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1705  rhodanese-like domain-containing protein  38.13 
 
 		 277 aa  218  6e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165982  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1846  Rhodanese domain protein  40.37 
 
 		 274 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1483  rhodanese-like domain-containing protein  37.41 
 
 		 277 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1455  thiosulfate sulfurtransferase  37.41 
 
 		 277 aa  217  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1599  rhodanese-like domain-containing protein  37.41 
 
 		 277 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.317702  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1669  rhodanese-like domain protein  37.41 
 
 		 277 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1048  Rhodanese domain protein  40.61 
 
 		 281 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1860  Rhodanese domain protein  45.2 
 
 		 282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0293763  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2381  rhodanese domain-containing protein  44.93 
 
 		 275 aa  215  7e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7064  thiosulfate sulfurtransferase  45.85 
 
 		 270 aa  215  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1455  thiosulfate sulfurtransferase  37.05 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1779  rhodanese-like protein  40.07 
 
 		 272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0268693  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1634  rhodanese-like domain protein  37.05 
 
 		 277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0494002  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3646  Rhodanese domain protein  40.89 
 
 		 276 aa  211  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2019  ketopantoate reductase ApbA/PanE  46.15 
 
 		 627 aa  209  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1498  rhodanese domain-containing protein  37.05 
 
 		 277 aa  209  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125768  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0159  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.18 
 
 		 292 aa  210  3e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2918  thiosulfate sulfurtransferase  45.23 
 
 		 276 aa  209  5e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1466  Rhodanese domain protein  47.35 
 
 		 282 aa  208  8e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0394652  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0556  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.01 
 
 		 276 aa  207  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.593662 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3711  rhodanese-like domain protein  37.05 
 
 		 277 aa  206  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.584837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2395  Rhodanese domain protein  39.93 
 
 		 282 aa  206  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1631  Rhodanese domain protein  43.26 
 
 		 291 aa  205  7e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00167409  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1310  rhodanese domain-containing protein  35.77 
 
 		 276 aa  203  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.965267  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1421  rhodanese domain-containing protein  46.24 
 
 		 288 aa  202  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  decreased coverage  0.00000340615 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2623  rhodanese domain-containing protein  37.01 
 
 		 283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1776  Rhodanese domain protein  44.06 
 
 		 301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06480  rhodanese-related sulfurtransferase  43.85 
 
 		 310 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1776  Rhodanese domain protein  43.07 
 
 		 335 aa  195  7e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305984  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0354  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.73 
 
 		 285 aa  193  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3069  Rhodanese domain protein  43.2 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.597651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>