More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2019 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2415  ketopantoate reductase ApbA/PanE-like  67.96 
 
 		 687 aa  788    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.427729  normal  0.379727 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2019  ketopantoate reductase ApbA/PanE  100 
 
 		 627 aa  1201    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2596  Rhodanese domain protein  66.43 
 
 		 282 aa  323  6e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.126951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2635  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  58.78 
 
 		 278 aa  303  5.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.273027  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4306  Rhodanese domain protein  60.36 
 
 		 272 aa  301  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.913868  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29210  rhodanese-related sulfurtransferase  59.23 
 
 		 297 aa  294  3e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7064  thiosulfate sulfurtransferase  59.35 
 
 		 270 aa  293  6e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0677  Rhodanese domain protein  65.43 
 
 		 299 aa  290  4e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2381  rhodanese domain-containing protein  60.54 
 
 		 275 aa  289  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2370  Rhodanese domain protein  62.95 
 
 		 298 aa  288  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000188451 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3069  Rhodanese domain protein  63.16 
 
 		 277 aa  286  5.999999999999999e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1631  Rhodanese domain protein  59.86 
 
 		 291 aa  282  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00167409  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1860  Rhodanese domain protein  58.57 
 
 		 282 aa  282  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0293763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0631  Rhodanese domain protein  51.38 
 
 		 305 aa  278  2e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0797433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4149  Rhodanese domain protein  58.6 
 
 		 283 aa  275  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27500  rhodanese-related sulfurtransferase  54.93 
 
 		 280 aa  274  4.0000000000000004e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2918  thiosulfate sulfurtransferase  58.53 
 
 		 276 aa  265  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1466  Rhodanese domain protein  54.77 
 
 		 282 aa  262  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0394652  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1460  rhodanese domain-containing protein  54.06 
 
 		 288 aa  250  5e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.058733  normal  0.145252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1776  Rhodanese domain protein  53.1 
 
 		 301 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5322  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  52.45 
 
 		 281 aa  248  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.710111 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07810  rhodanese-related sulfurtransferase  54.37 
 
 		 375 aa  248  3e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1417  thiosulfate sulfurtransferase  49.12 
 
 		 289 aa  246  9.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1421  rhodanese domain-containing protein  53.71 
 
 		 288 aa  244  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  decreased coverage  0.00000340615 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1452  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  54.17 
 
 		 282 aa  238  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3116  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  44.15 
 
 		 339 aa  238  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5604  Rhodanese domain protein  49.29 
 
 		 287 aa  232  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4029  2-dehydropantoate 2-reductase  49.19 
 
 		 328 aa  232  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  49.29 
 
 		 288 aa  231  4e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06480  rhodanese-related sulfurtransferase  50.35 
 
 		 310 aa  229  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 291 aa  224  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4806  thiosulfate sulfurtransferase  52.63 
 
 		 279 aa  223  8e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404932  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0305  Rhodanese domain protein  45.02 
 
 		 285 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4720  thiosulfate sulfurtransferase  53.24 
 
 		 270 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.190744  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12314  thiosulfate sulfurtransferase sseB  48.95 
 
 		 284 aa  218  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4550  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  48.39 
 
 		 419 aa  217  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.757162 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5105  thiosulfate sulfurtransferase  54.32 
 
 		 269 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.384708  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4099  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.91 
 
 		 284 aa  211  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1769  rhodanese domain-containing protein  50.19 
 
 		 284 aa  209  8e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000405789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2489  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.15 
 
 		 282 aa  209  9e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3246  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.83 
 
 		 289 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0068458 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4824  rhodanese domain-containing protein  47.37 
 
 		 289 aa  208  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0196782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2636  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.71 
 
 		 292 aa  207  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.488566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3367  rhodanese domain-containing protein  47.62 
 
 		 312 aa  207  6e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47500  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.16 
 
 		 284 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5177  Ketopantoate reductase  40.06 
 
 		 333 aa  204  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2831  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.42 
 
 		 289 aa  204  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0177  Rhodanese domain-containing protein  44.17 
 
 		 278 aa  202  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000691288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3952  rhodanese domain-containing protein  45.42 
 
 		 290 aa  201  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2620  rhodanese-like protein  45.3 
 
 		 285 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0952  Rhodanese domain protein  46.27 
 
 		 284 aa  201  5e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63885  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6785  Rhodanese domain protein  44.91 
 
 		 289 aa  201  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0412413  hitchhiker  0.0000256266 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3772  rhodanese domain-containing protein  46.13 
 
 		 289 aa  200  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0206148 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0420  rhodanese-like domain protein  44.6 
 
 		 285 aa  200  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0610  rhodanese domain-containing protein  43.51 
 
 		 289 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4304  2-dehydropantoate 2-reductase  46.73 
 
 		 340 aa  199  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0937432  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32980  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase protein  48.25 
 
 		 284 aa  199  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0325  rhodanese domain-containing protein  43.16 
 
 		 289 aa  198  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0847  rhodanese domain-containing protein  43.16 
 
 		 289 aa  198  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2397  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.16 
 
 		 289 aa  198  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0359  rhodanese domain-containing protein  43.16 
 
 		 289 aa  198  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1507  rhodanese domain-containing protein  43.16 
 
 		 289 aa  198  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1701  rhodanese domain-containing protein  43.16 
 
 		 289 aa  198  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2539  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.16 
 
 		 289 aa  198  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920072  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3789  Rhodanese domain protein  45.97 
 
 		 301 aa  197  5.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0279123  normal  0.459796 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  47.01 
 
 		 285 aa  196  9e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4756  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.52 
 
 		 284 aa  196  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0846963 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2215  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.83 
 
 		 289 aa  196  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1326  Rhodanese domain protein  45.66 
 
 		 283 aa  196  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0377463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2431  Rhodanese domain protein  43.3 
 
 		 295 aa  195  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4490  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.48 
 
 		 289 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3652  rhodanese domain-containing protein  46.48 
 
 		 289 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3875  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.48 
 
 		 289 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.403807 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2038  Rhodanese domain protein  43.3 
 
 		 295 aa  194  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5118  rhodanese domain protein  46.86 
 
 		 284 aa  193  8e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4992  rhodanese domain-containing protein  47.06 
 
 		 284 aa  193  8e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0354  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.73 
 
 		 285 aa  192  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5168  rhodanese domain-containing protein  45.71 
 
 		 284 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3212  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.24 
 
 		 299 aa  191  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0347  rhodanese domain-containing protein  46.01 
 
 		 284 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.772652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2523  rhodanese-like protein  51.43 
 
 		 266 aa  191  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2568  rhodanese domain-containing protein  51.43 
 
 		 266 aa  191  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0877  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.78 
 
 		 287 aa  190  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0593  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.61 
 
 		 285 aa  190  8e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2560  rhodanese domain-containing protein  50.82 
 
 		 266 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5343  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.04 
 
 		 284 aa  187  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1426  Rhodanese domain protein  38.08 
 
 		 276 aa  185  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.630889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1496  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.13 
 
 		 300 aa  185  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2226  thiosulfate sulfurtransferase protein  41.58 
 
 		 296 aa  183  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1776  Rhodanese domain protein  46.77 
 
 		 335 aa  180  7e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305984  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1048  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 		 281 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7246  rhodanese-related sulfurtransferase  42.53 
 
 		 279 aa  177  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0149117  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  38.87 
 
 		 278 aa  177  5e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1708  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.28 
 
 		 276 aa  176  9e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1319  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 		 300 aa  176  9e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.147779  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00777  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.62 
 
 		 290 aa  174  3.9999999999999995e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0224116  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.47 
 
 		 300 aa  174  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3051  Rhodanese domain protein  44.7 
 
 		 272 aa  173  6.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0410601  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2427  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.32 
 
 		 280 aa  173  7.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.244086 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1095  Rhodanese domain protein  36.92 
 
 		 271 aa  172  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>