217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4029 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_4029  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
328 aa  635    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3116  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  56.57 
 
 
339 aa  329  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4304  2-dehydropantoate 2-reductase  54.29 
 
 
340 aa  260  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0937432  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2019  ketopantoate reductase ApbA/PanE  48.52 
 
 
627 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2415  ketopantoate reductase ApbA/PanE-like  48.94 
 
 
687 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.427729  normal  0.379727 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5177  Ketopantoate reductase  40.38 
 
 
333 aa  207  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  32.28 
 
 
299 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  31.31 
 
 
301 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  30.89 
 
 
300 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0382  2-dehydropantoate 2-reductase  33.43 
 
 
351 aa  89.4  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  32.71 
 
 
319 aa  88.2  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  33.87 
 
 
345 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  32.58 
 
 
319 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  30.45 
 
 
332 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  28.48 
 
 
324 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  31.71 
 
 
313 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  31.61 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  29.23 
 
 
315 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  27.18 
 
 
302 aa  80.1  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1115  2-dehydropantoate 2-reductase  27.44 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.275273  normal  0.917906 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  28.31 
 
 
324 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  26.11 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  26.03 
 
 
309 aa  79  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  30.22 
 
 
316 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  31.72 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  28.35 
 
 
315 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  29.04 
 
 
332 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  28.66 
 
 
333 aa  75.9  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  28.22 
 
 
298 aa  75.5  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  29.81 
 
 
316 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  29.81 
 
 
316 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  32.59 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  30 
 
 
323 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  28.48 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  29.14 
 
 
316 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  28.27 
 
 
326 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  31.09 
 
 
324 aa  73.6  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1698  2-dehydropantoate 2-reductase  23.42 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.656315  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  32.15 
 
 
317 aa  72.4  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5585  2-dehydropantoate 2-reductase  30.46 
 
 
298 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6133  2-dehydropantoate 2-reductase  29.41 
 
 
298 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5949  2-dehydropantoate 2-reductase  30.46 
 
 
298 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688574  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0791  2-dehydropantoate 2-reductase  27.48 
 
 
303 aa  72.4  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2289  2-dehydropantoate 2-reductase  27.51 
 
 
296 aa  70.1  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.974409  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  27.91 
 
 
353 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3892  2-dehydropantoate 2-reductase  29.43 
 
 
310 aa  69.7  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  27.67 
 
 
342 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4927  2-dehydropantoate 2-reductase  30.59 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332007  normal  0.934837 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6450  2-dehydropantoate 2-reductase  29.61 
 
 
298 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1469  2-dehydropantoate 2-reductase  29.77 
 
 
296 aa  68.9  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  29.47 
 
 
341 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  31.19 
 
 
325 aa  68.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6421  2-dehydropantoate 2-reductase  28.43 
 
 
298 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  26.67 
 
 
326 aa  67.4  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  32.72 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  29.68 
 
 
302 aa  67.4  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  31.38 
 
 
324 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  26.38 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1519  2-dehydropantoate 2-reductase  23.66 
 
 
309 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.982841  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  28.29 
 
 
335 aa  66.2  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  28.12 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  29.5 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  28.53 
 
 
346 aa  66.2  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  28.53 
 
 
305 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  26.67 
 
 
325 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  28.16 
 
 
335 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  26.48 
 
 
325 aa  65.1  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  29.43 
 
 
307 aa  64.3  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2022  2-dehydropantoate 2-reductase  25.62 
 
 
310 aa  63.5  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  29.43 
 
 
307 aa  63.9  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  29.17 
 
 
310 aa  63.9  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  29.17 
 
 
314 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1867  2-dehydropantoate 2-reductase  24.92 
 
 
318 aa  63.5  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2951  2-dehydropantoate 2-reductase  28.53 
 
 
305 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  30.06 
 
 
309 aa  63.2  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02678  2-dehydropantoate 2-reductase  24.18 
 
 
339 aa  63.2  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.321227  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  28.53 
 
 
305 aa  62.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2967  2-dehydropantoate 2-reductase  28.21 
 
 
311 aa  62.8  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  30.45 
 
 
307 aa  62.8  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  28.53 
 
 
305 aa  62.8  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  28.53 
 
 
305 aa  62.4  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0296  2-dehydropantoate 2-reductase  30.73 
 
 
309 aa  62.4  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.961677  normal  0.11487 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  32.46 
 
 
296 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1558  2-dehydropantoate 2-reductase  33.19 
 
 
447 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  29.08 
 
 
327 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  28.09 
 
 
301 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4496  2-dehydropantoate 2-reductase  28.01 
 
 
298 aa  62  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.650422  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  29.66 
 
 
331 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  28.64 
 
 
325 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2052  2-dehydropantoate 2-reductase  27.41 
 
 
344 aa  60.8  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  28.18 
 
 
325 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34380  ketopantoate reductase  35.71 
 
 
368 aa  60.5  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0495871  normal  0.346815 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3174  2-dehydropantoate 2-reductase  27.42 
 
 
296 aa  60.1  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00987338  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5770  2-dehydropantoate 2-reductase  26.34 
 
 
307 aa  60.1  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  27.78 
 
 
301 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1445  2-dehydropantoate 2-reductase  24.68 
 
 
312 aa  60.1  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.219462  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3558  2-dehydropantoate 2-reductase  28.13 
 
 
325 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5382  2-dehydropantoate 2-reductase  28.83 
 
 
327 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324063  normal  0.227406 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1224  2-dehydropantoate 2-reductase  29.57 
 
 
327 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.318793 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  23.73 
 
 
307 aa  59.3  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>