More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5051 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
325 aa  643    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  76.16 
 
 
345 aa  430  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  71.67 
 
 
298 aa  407  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  73.91 
 
 
319 aa  401  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  72.94 
 
 
319 aa  401  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  63.64 
 
 
295 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  62 
 
 
305 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  61.09 
 
 
313 aa  350  3e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  62.54 
 
 
299 aa  348  7e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  62.79 
 
 
317 aa  347  1e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  56.57 
 
 
301 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  57 
 
 
300 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  55.44 
 
 
299 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  58.6 
 
 
296 aa  290  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  50.5 
 
 
301 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  50.5 
 
 
301 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  36.3 
 
 
311 aa  205  7e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  36.6 
 
 
316 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  36.6 
 
 
316 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  37.83 
 
 
316 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  37.83 
 
 
316 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  37.17 
 
 
316 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  35.96 
 
 
315 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  36.39 
 
 
313 aa  153  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  35.96 
 
 
315 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  36.04 
 
 
312 aa  149  5e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  37.83 
 
 
316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  34.81 
 
 
341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  34.75 
 
 
335 aa  143  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  35.74 
 
 
315 aa  142  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  35.06 
 
 
307 aa  142  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  36.21 
 
 
323 aa  142  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 
306 aa  141  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  34.33 
 
 
306 aa  139  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  30.23 
 
 
305 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  30.23 
 
 
305 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  30.23 
 
 
305 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  29.97 
 
 
329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  31.97 
 
 
309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  29.9 
 
 
305 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02678  2-dehydropantoate 2-reductase  29.28 
 
 
339 aa  130  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.321227  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0377  2-dehydropantoate 2-reductase  28.66 
 
 
316 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2518  2-dehydropantoate 2-reductase  29.35 
 
 
311 aa  129  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254196  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2470  2-dehydropantoate 2-reductase  29.35 
 
 
311 aa  129  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2951  2-dehydropantoate 2-reductase  29.9 
 
 
305 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  35.23 
 
 
307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  32.56 
 
 
318 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  31.79 
 
 
309 aa  124  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  34.9 
 
 
307 aa  123  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  33.66 
 
 
294 aa  123  5e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 
311 aa  122  9e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1100  2-dehydropantoate 2-reductase  37.58 
 
 
302 aa  121  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0140808  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  33.44 
 
 
310 aa  122  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 
310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  34.67 
 
 
302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03188  2-dehydropantoate 2-reductase  32 
 
 
338 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  34.93 
 
 
315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  29.1 
 
 
302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  31.02 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  28.99 
 
 
324 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  32.33 
 
 
296 aa  117  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  32.15 
 
 
314 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2865  2-dehydropantoate 2-reductase  28.9 
 
 
311 aa  116  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  31.13 
 
 
324 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1519  2-dehydropantoate 2-reductase  27.55 
 
 
309 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.982841  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  31.1 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  26.15 
 
 
318 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1293  2-dehydropantoate 2-reductase  25.42 
 
 
312 aa  114  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.519384  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1698  2-dehydropantoate 2-reductase  26.95 
 
 
306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.656315  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2858  2-dehydropantoate 2-reductase  28.75 
 
 
322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  28.66 
 
 
309 aa  113  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  28.66 
 
 
309 aa  113  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0296  2-dehydropantoate 2-reductase  34 
 
 
309 aa  112  7.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.961677  normal  0.11487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  28.94 
 
 
312 aa  112  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1979  2-dehydropantoate 2-reductase  27.51 
 
 
313 aa  112  9e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0057409  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1422  2-dehydropantoate 2-reductase  28.75 
 
 
322 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0382  2-dehydropantoate 2-reductase  34.92 
 
 
351 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0791  2-dehydropantoate 2-reductase  32.05 
 
 
303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  28.61 
 
 
335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  29.49 
 
 
302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  28.61 
 
 
335 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41900  2-dehydropantoate 2-reductase  29.56 
 
 
315 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  28.61 
 
 
335 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2408  2-dehydropantoate 2-reductase  34.35 
 
 
306 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0790989 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4857  2-dehydropantoate 2-reductase  31.8 
 
 
337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3780  2-dehydropantoate 2-reductase  31.8 
 
 
337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.146686  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  27.69 
 
 
324 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  29.06 
 
 
339 aa  109  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00418767  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  28.01 
 
 
353 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  26.45 
 
 
316 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2605  2-dehydropantoate 2-reductase  32.92 
 
 
314 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  28.96 
 
 
307 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  33.23 
 
 
331 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  28.75 
 
 
326 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2981  2-dehydropantoate 2-reductase  24.68 
 
 
319 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.3758  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  27.83 
 
 
335 aa  106  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1855  2-dehydropantoate 2-reductase  25.57 
 
 
316 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  27.18 
 
 
326 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  28.48 
 
 
312 aa  106  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1445  2-dehydropantoate 2-reductase  24.13 
 
 
312 aa  106  5e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.219462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>