More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2981 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2981  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
319 aa  657    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.3758  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1293  2-dehydropantoate 2-reductase  72.67 
 
 
312 aa  481  1e-135  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.519384  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1979  2-dehydropantoate 2-reductase  54.07 
 
 
313 aa  340  2e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0057409  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  42.38 
 
 
302 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  42.3 
 
 
305 aa  237  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  42.11 
 
 
302 aa  236  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1766  2-dehydropantoate 2-reductase  43.14 
 
 
315 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.411691  hitchhiker  0.000000000967397 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2276  2-dehydropantoate 2-reductase  40.92 
 
 
323 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00122842  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3445  2-dehydropantoate 2-reductase  41.22 
 
 
349 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00422056  hitchhiker  0.00254132 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2325  2-dehydropantoate 2-reductase  40.88 
 
 
315 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.79299  hitchhiker  0.0000420215 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  38.96 
 
 
312 aa  226  4e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1926  2-dehydropantoate 2-reductase  40.88 
 
 
315 aa  225  8e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000062548  hitchhiker  0.000000000000153659 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4006  2-dehydropantoate 2-reductase  42.57 
 
 
317 aa  225  9e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143749  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2074  2-dehydropantoate 2-reductase  40.67 
 
 
323 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.136591  normal  0.0111283 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41900  2-dehydropantoate 2-reductase  39.87 
 
 
315 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3556  2-dehydropantoate 2-reductase  40.74 
 
 
315 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  37.84 
 
 
311 aa  211  1e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2549  2-dehydropantoate 2-reductase  38.51 
 
 
317 aa  202  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0215033  hitchhiker  0.00000000817655 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  31.48 
 
 
312 aa  172  5e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0552  2-dehydropantoate 2-reductase  34.19 
 
 
319 aa  164  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39578  predicted protein  27.74 
 
 
414 aa  132  9e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  30.39 
 
 
318 aa  122  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  25.48 
 
 
299 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  30.87 
 
 
329 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  24.44 
 
 
300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  26.23 
 
 
333 aa  110  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  28.26 
 
 
325 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  25.48 
 
 
301 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  27.68 
 
 
324 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0294  2-dehydropantoate 2-reductase  28.71 
 
 
307 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.220777  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  25.56 
 
 
298 aa  106  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3558  2-dehydropantoate 2-reductase  29.21 
 
 
325 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3234  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 
325 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  24.84 
 
 
335 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  24.84 
 
 
335 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  24.84 
 
 
335 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2967  2-dehydropantoate 2-reductase  28.43 
 
 
311 aa  99.4  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0186  2-dehydropantoate 2-reductase  24.51 
 
 
306 aa  99  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4423  2-dehydropantoate 2-reductase  25.97 
 
 
311 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.852681 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  25.84 
 
 
331 aa  97.1  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0743  ketopantoate reductase ApbA/PanE  27.39 
 
 
311 aa  96.3  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786977  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 
311 aa  96.3  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02389  ketopantoate reductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14497)  26.15 
 
 
426 aa  96.3  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10126  2-dehydropantoate 2-reductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00740)  25 
 
 
367 aa  96.3  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00458095  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3781  2-dehydropantoate 2-reductase  25.91 
 
 
312 aa  95.5  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0449567 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1861  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 
317 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  25.25 
 
 
315 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  24.39 
 
 
337 aa  93.2  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  23.05 
 
 
306 aa  92.8  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  25.54 
 
 
332 aa  92.8  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  25.34 
 
 
325 aa  92.8  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  25.54 
 
 
307 aa  92.8  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  25.54 
 
 
307 aa  92.8  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1405  2-dehydropantoate 2-reductase  23.93 
 
 
307 aa  92.4  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  23.62 
 
 
345 aa  91.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 
315 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  26.77 
 
 
309 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  23.97 
 
 
319 aa  91.3  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  22.48 
 
 
317 aa  90.5  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  25.9 
 
 
305 aa  90.5  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0839  2-dehydropantoate 2-reductase  27.64 
 
 
307 aa  90.5  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  26.69 
 
 
325 aa  89.7  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  25.66 
 
 
315 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  25.68 
 
 
326 aa  89.4  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0882  2-dehydropantoate 2-reductase  25.33 
 
 
315 aa  89.4  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.277426 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  23.15 
 
 
295 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  24.22 
 
 
335 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  25.16 
 
 
313 aa  87.8  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  23.63 
 
 
319 aa  88.2  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3545  2-dehydropantoate 2-reductase  25.66 
 
 
315 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4822  2-dehydropantoate 2-reductase  25.66 
 
 
315 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  22.9 
 
 
299 aa  87  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3888  2-dehydropantoate 2-reductase  26.23 
 
 
324 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0769062  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  24.37 
 
 
336 aa  86.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  21.82 
 
 
313 aa  86.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  26.86 
 
 
341 aa  86.7  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 
316 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 
316 aa  86.7  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  26.6 
 
 
307 aa  86.3  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  26.46 
 
 
324 aa  85.9  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  24.7 
 
 
336 aa  85.5  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  24.31 
 
 
332 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 
306 aa  85.1  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4927  2-dehydropantoate 2-reductase  27.18 
 
 
306 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332007  normal  0.934837 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  22.68 
 
 
314 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  25.16 
 
 
346 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0193  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 
285 aa  84.3  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0380974  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4203  2-dehydropantoate 2-reductase  24.92 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.379422  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  23 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0600  2-dehydropantoate 2-reductase  24.67 
 
 
314 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000137771  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  25.86 
 
 
316 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  24.91 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2487  2-dehydropantoate 2-reductase  26.54 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  22.76 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1796  2-dehydropantoate 2-reductase  26.06 
 
 
341 aa  83.2  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.275897 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  25.49 
 
 
312 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.399113 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5770  2-dehydropantoate 2-reductase  23.89 
 
 
307 aa  82.8  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3341  2-dehydropantoate 2-reductase  26.54 
 
 
324 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1471  2-dehydropantoate 2-reductase  26.54 
 
 
329 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1964  2-dehydropantoate 2-reductase  26.54 
 
 
329 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.734659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>