More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0193 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0193  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 285 aa  580  1.0000000000000001e-165  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0380974  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  32.98 
 
 		 294 aa  149  6e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  34.55 
 
 		 309 aa  135  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  31.23 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1100  2-dehydropantoate 2-reductase  33.21 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0140808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  29.41 
 
 		 310 aa  125  9e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  31.65 
 
 		 314 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  31.84 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2147  2-dehydropantoate 2-reductase  29.64 
 
 		 303 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0296  2-dehydropantoate 2-reductase  31.32 
 
 		 309 aa  112  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.961677  normal  0.11487 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  31.27 
 
 		 301 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  31.41 
 
 		 315 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  31.29 
 
 		 315 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  30.95 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  29.35 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  32.89 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  28.99 
 
 		 316 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  28.99 
 
 		 316 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1095  2-dehydropantoate 2-reductase  35.12 
 
 		 312 aa  105  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.82934  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  29.82 
 
 		 316 aa  105  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  29.26 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  27.9 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  29.05 
 
 		 353 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  28.16 
 
 		 345 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  29.2 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0383  2-dehydropantoate 2-reductase  31.06 
 
 		 280 aa  102  6e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1351  2-dehydropantoate 2-reductase  29.63 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.144072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4968  2-dehydropantoate 2-reductase  32.72 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  27.54 
 
 		 319 aa  101  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4373  2-dehydropantoate 2-reductase  29.63 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586836 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  27.08 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  27.74 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57160  2-dehydropantoate 2-reductase  33.09 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4088  2-dehydropantoate 2-reductase  30.18 
 
 		 306 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.77552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  29.5 
 
 		 312 aa  99.8  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  29.69 
 
 		 324 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  27.94 
 
 		 295 aa  99  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1477  ketopantoate reductase  28.83 
 
 		 337 aa  98.6  9e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1519  2-dehydropantoate 2-reductase  27.6 
 
 		 309 aa  98.2  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.982841  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  29.96 
 
 		 316 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  27.65 
 
 		 346 aa  98.6  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  29.78 
 
 		 305 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.774811  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  28.41 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1786  2-dehydropantoate 2-reductase  31.95 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.43842 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  29.79 
 
 		 324 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  29.78 
 
 		 336 aa  97.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  29.96 
 
 		 316 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2262  2-dehydropantoate 2-reductase  28.52 
 
 		 299 aa  97.4  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  31.51 
 
 		 296 aa  96.3  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  26.3 
 
 		 298 aa  96.3  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  26.63 
 
 		 332 aa  96.3  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  29.76 
 
 		 323 aa  96.3  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2032  2-dehydropantoate 2-reductase  29.41 
 
 		 315 aa  95.9  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  27.86 
 
 		 332 aa  95.5  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  29.35 
 
 		 316 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  28.21 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  27.44 
 
 		 341 aa  93.6  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1698  2-dehydropantoate 2-reductase  28.68 
 
 		 306 aa  93.6  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.656315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1881  2-dehydropantoate 2-reductase  29.43 
 
 		 306 aa  93.2  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  27.54 
 
 		 318 aa  93.2  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4530  2-dehydropantoate 2-reductase  26.78 
 
 		 355 aa  93.2  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.247613 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  29.74 
 
 		 305 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  30.41 
 
 		 333 aa  92.4  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  26.69 
 
 		 317 aa  92.4  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  26.91 
 
 		 301 aa  92.4  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0892  2-dehydropantoate 2-reductase  28.68 
 
 		 303 aa  92.4  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.868359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0557  ketopantoate reductase ApbA/PanE  27.11 
 
 		 334 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.302954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  25.91 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1083  2-dehydropantoate 2-reductase  28.89 
 
 		 303 aa  91.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208134 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2570  2-dehydropantoate 2-reductase  28.78 
 
 		 296 aa  91.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00232131  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  26.81 
 
 		 325 aa  92  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002696  2-dehydropantoate 2-reductase  31.06 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0816  2-dehydropantoate 2-reductase  31.34 
 
 		 320 aa  92  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  27.46 
 
 		 324 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1673  ketopantoate reductase ApbA/PanE  27.11 
 
 		 334 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0533  ketopantoate reductase ApbA/PanE  26.81 
 
 		 334 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1695  ketopantoate reductase ApbA/PanE-like protein  27.11 
 
 		 334 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  26.98 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  28.91 
 
 		 309 aa  90.9  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1723  ketopantoate reductase ApbA/PanE  27.11 
 
 		 334 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.711694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1739  ketopantoate reductase ApbA/PanE  27.11 
 
 		 334 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4394  2-dehydropantoate 2-reductase  28.26 
 
 		 306 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.68453  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  27.41 
 
 		 307 aa  90.1  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4021  2-dehydropantoate 2-reductase  28.15 
 
 		 296 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3068  2-dehydropantoate 2-reductase  27.99 
 
 		 303 aa  89  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3106  2-dehydropantoate 2-reductase  27.99 
 
 		 303 aa  89  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3248  2-dehydropantoate 2-reductase  27.99 
 
 		 303 aa  89  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  28.32 
 
 		 335 aa  89  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0942  2-dehydropantoate 2-reductase  27.99 
 
 		 299 aa  89  9e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  28.42 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  26.57 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0509  2-dehydropantoate 2-reductase  28.78 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.632143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0536  2-dehydropantoate 2-reductase  29.24 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0475  2-dehydropantoate 2-reductase  29.24 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0494  2-dehydropantoate 2-reductase  29.24 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0481  2-dehydropantoate 2-reductase  29.24 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.378498 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0473  2-dehydropantoate 2-reductase  29.24 
 
 		 303 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1293  2-dehydropantoate 2-reductase  24.92 
 
 		 312 aa  87.4  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.519384  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  24.57 
 
 		 326 aa  87.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3184  2-dehydropantoate 2-reductase  28.78 
 
 		 303 aa  87  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.547188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>