More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002696 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002696  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 296 aa  615  1e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03288  2-dehydropantoate 2-reductase  76.35 
 
 		 296 aa  472  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  55.59 
 
 		 296 aa  343  2e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0942  2-dehydropantoate 2-reductase  51.7 
 
 		 299 aa  290  2e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1083  2-dehydropantoate 2-reductase  40.94 
 
 		 303 aa  228  9e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208134 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2889  2-dehydropantoate 2-reductase  39.53 
 
 		 302 aa  222  6e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3080  2-dehydropantoate 2-reductase  40.26 
 
 		 306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.850912  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3276  2-dehydropantoate 2-reductase  42.14 
 
 		 302 aa  217  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00373  2-dehydropantoate 2-reductase  39.6 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3184  2-dehydropantoate 2-reductase  39.6 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.547188  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0509  2-dehydropantoate 2-reductase  39.6 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.632143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3208  2-dehydropantoate 2-reductase  39.6 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000640508 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00377  hypothetical protein  39.6 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0457  2-dehydropantoate 2-reductase  39.6 
 
 		 303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0497  2-dehydropantoate 2-reductase  39.6 
 
 		 303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1035  2-dehydropantoate 2-reductase  41.28 
 
 		 302 aa  215  7e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.324105  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0461  2-dehydropantoate 2-reductase  39.26 
 
 		 303 aa  215  8e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0347  2-dehydropantoate 2-reductase  39.06 
 
 		 303 aa  214  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0892  2-dehydropantoate 2-reductase  40.94 
 
 		 303 aa  214  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.868359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0473  2-dehydropantoate 2-reductase  37.92 
 
 		 303 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0536  2-dehydropantoate 2-reductase  38.05 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0475  2-dehydropantoate 2-reductase  38.05 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0481  2-dehydropantoate 2-reductase  38.05 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.378498 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0494  2-dehydropantoate 2-reductase  38.05 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2262  2-dehydropantoate 2-reductase  40.55 
 
 		 299 aa  210  3e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1362  2-dehydropantoate 2-reductase  39.53 
 
 		 294 aa  208  9e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3068  2-dehydropantoate 2-reductase  37.25 
 
 		 303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3106  2-dehydropantoate 2-reductase  37.25 
 
 		 303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3248  2-dehydropantoate 2-reductase  37.25 
 
 		 303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3726  2-dehydropantoate 2-reductase  37.79 
 
 		 312 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0816  2-dehydropantoate 2-reductase  37.01 
 
 		 320 aa  195  7e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3116  2-dehydropantoate 2-reductase  37.66 
 
 		 343 aa  194  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3603  2-dehydropantoate 2-reductase  36.93 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3158  2-dehydropantoate 2-reductase  38.69 
 
 		 326 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0708  2-dehydropantoate 2-reductase  37.13 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3535  2-dehydropantoate 2-reductase  37.46 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40675  hitchhiker  0.0000949952 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3445  2-dehydropantoate 2-reductase  36.67 
 
 		 310 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0809  2-dehydropantoate 2-reductase  38.24 
 
 		 326 aa  188  8e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0272  2-dehydropantoate 2-reductase  34.13 
 
 		 289 aa  187  2e-46  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0780  2-dehydropantoate 2-reductase  37.13 
 
 		 327 aa  186  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.977069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2895  2-dehydropantoate 2-reductase  40.33 
 
 		 306 aa  185  7e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0400281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0768  2-dehydropantoate 2-reductase  36.31 
 
 		 324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000150905  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3817  2-dehydropantoate 2-reductase  37.91 
 
 		 327 aa  183  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1095  2-dehydropantoate 2-reductase  39.91 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.82934  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4088  2-dehydropantoate 2-reductase  34.13 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.77552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3648  2-dehydropantoate 2-reductase  34.09 
 
 		 319 aa  169  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0849606  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2559  2-dehydropantoate 2-reductase  38.13 
 
 		 300 aa  166  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.195971 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4394  2-dehydropantoate 2-reductase  33.56 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.68453  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4422  2-dehydropantoate 2-reductase  34.13 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4373  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586836 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02768  2-dehydropantoate 2-reductase  33.55 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1351  2-dehydropantoate 2-reductase  32.99 
 
 		 305 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.144072 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0730  2-dehydropantoate 2-reductase  36.07 
 
 		 322 aa  156  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0937  2-dehydropantoate 2-reductase  33.68 
 
 		 303 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57160  2-dehydropantoate 2-reductase  31.74 
 
 		 303 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  32.65 
 
 		 305 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.774811  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  32.76 
 
 		 305 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13400  2-dehydropantoate 2-reductase  31.06 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4968  2-dehydropantoate 2-reductase  30.82 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  34 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3966  2-dehydropantoate 2-reductase  29.39 
 
 		 294 aa  122  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3973  2-dehydropantoate 2-reductase  29.39 
 
 		 296 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000131427  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3747  2-dehydropantoate 2-reductase  30.82 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684201  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2147  2-dehydropantoate 2-reductase  30.07 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  27.51 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  27.67 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  27.83 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3662  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 295 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000935391  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3679  2-dehydropantoate 2-reductase  28.03 
 
 		 296 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.953522  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1220  2-dehydropantoate 2-reductase  28.99 
 
 		 296 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00748883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3935  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 295 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.665009 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3771  2-dehydropantoate 2-reductase  28.34 
 
 		 296 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  26.64 
 
 		 313 aa  116  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4059  2-dehydropantoate 2-reductase  28.34 
 
 		 294 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00247246  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  27.21 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  28.2 
 
 		 299 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4021  2-dehydropantoate 2-reductase  28.34 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0462  2-dehydropantoate 2-reductase  27.33 
 
 		 303 aa  109  5e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  25.57 
 
 		 317 aa  108  9.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  26.67 
 
 		 298 aa  106  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  28.38 
 
 		 295 aa  106  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2570  2-dehydropantoate 2-reductase  29.57 
 
 		 296 aa  106  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00232131  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2470  2-dehydropantoate 2-reductase  25.59 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2518  2-dehydropantoate 2-reductase  25.59 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254196  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  28.3 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2032  2-dehydropantoate 2-reductase  27.72 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1009  2-dehydropantoate 2-reductase  30.94 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  26.62 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2022  2-dehydropantoate 2-reductase  25.08 
 
 		 310 aa  99.8  5e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0377  2-dehydropantoate 2-reductase  27.05 
 
 		 316 aa  99.8  5e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  25.33 
 
 		 305 aa  99  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  25.41 
 
 		 301 aa  99  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  25.58 
 
 		 345 aa  97.8  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  25.65 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  26.44 
 
 		 325 aa  97.4  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54699  2-dehydropantoate 2-reductase (Ketopantoate reductase) (KPA reductase) (KPR)  29.12 
 
 		 357 aa  97.4  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  27.96 
 
 		 302 aa  97.1  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 		 305 aa  95.9  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  27.6 
 
 		 296 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.748115 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>