285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3603 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_3603  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
311 aa  634    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3535  2-dehydropantoate 2-reductase  95.5 
 
 
311 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40675  hitchhiker  0.0000949952 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0708  2-dehydropantoate 2-reductase  95.18 
 
 
311 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3726  2-dehydropantoate 2-reductase  93.27 
 
 
312 aa  594  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0816  2-dehydropantoate 2-reductase  66.45 
 
 
320 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3158  2-dehydropantoate 2-reductase  63.67 
 
 
326 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0809  2-dehydropantoate 2-reductase  63.67 
 
 
326 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0780  2-dehydropantoate 2-reductase  61.71 
 
 
327 aa  382  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.977069  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3817  2-dehydropantoate 2-reductase  63.38 
 
 
327 aa  380  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3445  2-dehydropantoate 2-reductase  51.8 
 
 
310 aa  299  5e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137485  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3648  2-dehydropantoate 2-reductase  51.14 
 
 
319 aa  295  7e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0849606  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0768  2-dehydropantoate 2-reductase  51.94 
 
 
324 aa  287  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000150905  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2895  2-dehydropantoate 2-reductase  51.78 
 
 
306 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0400281  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3116  2-dehydropantoate 2-reductase  50.32 
 
 
343 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0730  2-dehydropantoate 2-reductase  47.9 
 
 
322 aa  259  4e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2559  2-dehydropantoate 2-reductase  48.15 
 
 
300 aa  226  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.195971 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03288  2-dehydropantoate 2-reductase  39.41 
 
 
296 aa  199  5e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002696  2-dehydropantoate 2-reductase  36.93 
 
 
296 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  38.11 
 
 
296 aa  182  6e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1362  2-dehydropantoate 2-reductase  37.58 
 
 
294 aa  168  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3276  2-dehydropantoate 2-reductase  37.46 
 
 
302 aa  158  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2889  2-dehydropantoate 2-reductase  34.87 
 
 
302 aa  155  8e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1083  2-dehydropantoate 2-reductase  36.1 
 
 
303 aa  151  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208134 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0942  2-dehydropantoate 2-reductase  36.13 
 
 
299 aa  151  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1035  2-dehydropantoate 2-reductase  36.84 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.324105  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3080  2-dehydropantoate 2-reductase  35.71 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.850912  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0497  2-dehydropantoate 2-reductase  35.46 
 
 
303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0509  2-dehydropantoate 2-reductase  35.46 
 
 
303 aa  146  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.632143  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3184  2-dehydropantoate 2-reductase  35.46 
 
 
303 aa  145  6e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.547188  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3208  2-dehydropantoate 2-reductase  35.46 
 
 
303 aa  145  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000640508 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00373  2-dehydropantoate 2-reductase  35.46 
 
 
303 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00377  hypothetical protein  35.46 
 
 
303 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0461  2-dehydropantoate 2-reductase  35.46 
 
 
303 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0457  2-dehydropantoate 2-reductase  35.46 
 
 
303 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3106  2-dehydropantoate 2-reductase  34.92 
 
 
303 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3248  2-dehydropantoate 2-reductase  34.92 
 
 
303 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3068  2-dehydropantoate 2-reductase  34.92 
 
 
303 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0347  2-dehydropantoate 2-reductase  35.14 
 
 
303 aa  142  5e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0494  2-dehydropantoate 2-reductase  35.08 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0475  2-dehydropantoate 2-reductase  35.08 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4394  2-dehydropantoate 2-reductase  33.99 
 
 
306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.68453  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0481  2-dehydropantoate 2-reductase  35.08 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.378498 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0536  2-dehydropantoate 2-reductase  35.08 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127784  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0473  2-dehydropantoate 2-reductase  35.62 
 
 
303 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0892  2-dehydropantoate 2-reductase  33.54 
 
 
303 aa  139  7e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.868359  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02768  2-dehydropantoate 2-reductase  34.48 
 
 
313 aa  138  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4422  2-dehydropantoate 2-reductase  33.56 
 
 
305 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2262  2-dehydropantoate 2-reductase  32.67 
 
 
299 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4088  2-dehydropantoate 2-reductase  34.36 
 
 
306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.77552  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1095  2-dehydropantoate 2-reductase  30.17 
 
 
312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.82934  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4373  2-dehydropantoate 2-reductase  33.22 
 
 
305 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0586836 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0272  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 
289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 
305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1351  2-dehydropantoate 2-reductase  32.53 
 
 
305 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.144072 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57160  2-dehydropantoate 2-reductase  33 
 
 
303 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  32.87 
 
 
305 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.774811  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13400  2-dehydropantoate 2-reductase  33.22 
 
 
297 aa  127  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4968  2-dehydropantoate 2-reductase  33 
 
 
303 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  33.64 
 
 
309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  31.03 
 
 
294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0937  2-dehydropantoate 2-reductase  36.18 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  31.49 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  32.2 
 
 
310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2032  2-dehydropantoate 2-reductase  28.81 
 
 
315 aa  109  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0462  2-dehydropantoate 2-reductase  29.65 
 
 
303 aa  103  4e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3966  2-dehydropantoate 2-reductase  27.16 
 
 
294 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3973  2-dehydropantoate 2-reductase  27.04 
 
 
296 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000131427  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3771  2-dehydropantoate 2-reductase  27.9 
 
 
296 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4059  2-dehydropantoate 2-reductase  27.99 
 
 
294 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00247246  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  30.63 
 
 
294 aa  99.4  7e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2147  2-dehydropantoate 2-reductase  30.98 
 
 
303 aa  99.4  8e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3662  2-dehydropantoate 2-reductase  27.67 
 
 
295 aa  98.6  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000935391  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3935  2-dehydropantoate 2-reductase  27.67 
 
 
295 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.665009 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3679  2-dehydropantoate 2-reductase  27.27 
 
 
296 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.953522  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  28.8 
 
 
295 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3747  2-dehydropantoate 2-reductase  27.78 
 
 
293 aa  96.7  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684201  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2570  2-dehydropantoate 2-reductase  27.89 
 
 
296 aa  95.5  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00232131  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  27.57 
 
 
305 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  33.1 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1009  2-dehydropantoate 2-reductase  31.58 
 
 
307 aa  94  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  28.03 
 
 
313 aa  93.6  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1881  2-dehydropantoate 2-reductase  33.62 
 
 
306 aa  92.8  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0383  2-dehydropantoate 2-reductase  29.28 
 
 
280 aa  91.7  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1100  2-dehydropantoate 2-reductase  36.45 
 
 
302 aa  91.7  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0140808  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4021  2-dehydropantoate 2-reductase  27.01 
 
 
296 aa  92  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  27.45 
 
 
305 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2951  2-dehydropantoate 2-reductase  27.06 
 
 
305 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1220  2-dehydropantoate 2-reductase  26.52 
 
 
296 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00748883  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  27.24 
 
 
305 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  27.3 
 
 
305 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  29.71 
 
 
305 aa  90.5  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  28.89 
 
 
345 aa  89.7  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  28.06 
 
 
317 aa  89.7  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  29.11 
 
 
319 aa  88.6  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  29.43 
 
 
319 aa  88.6  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  29.43 
 
 
299 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  26.29 
 
 
307 aa  88.2  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2003  2-dehydropantoate 2-reductase  31.06 
 
 
280 aa  87.8  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54699  2-dehydropantoate 2-reductase (Ketopantoate reductase) (KPA reductase) (KPR)  27.97 
 
 
357 aa  87  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  28.04 
 
 
301 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>