279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2889 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2889  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
302 aa  625  1e-178  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3080  2-dehydropantoate 2-reductase  78.43 
 
 
306 aa  496  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.850912  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3276  2-dehydropantoate 2-reductase  74.17 
 
 
302 aa  474  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1035  2-dehydropantoate 2-reductase  74.5 
 
 
302 aa  474  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.324105  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3068  2-dehydropantoate 2-reductase  63.7 
 
 
303 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3106  2-dehydropantoate 2-reductase  63.7 
 
 
303 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3248  2-dehydropantoate 2-reductase  63.7 
 
 
303 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1083  2-dehydropantoate 2-reductase  61.39 
 
 
303 aa  395  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208134 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00373  2-dehydropantoate 2-reductase  59.41 
 
 
303 aa  364  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3184  2-dehydropantoate 2-reductase  59.41 
 
 
303 aa  365  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.547188  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00377  hypothetical protein  59.41 
 
 
303 aa  364  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3208  2-dehydropantoate 2-reductase  59.41 
 
 
303 aa  365  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000640508 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0347  2-dehydropantoate 2-reductase  59.74 
 
 
303 aa  367  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0473  2-dehydropantoate 2-reductase  58.75 
 
 
303 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0461  2-dehydropantoate 2-reductase  59.41 
 
 
303 aa  363  1e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0457  2-dehydropantoate 2-reductase  59.41 
 
 
303 aa  364  1e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0497  2-dehydropantoate 2-reductase  59.08 
 
 
303 aa  363  3e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0494  2-dehydropantoate 2-reductase  58.42 
 
 
303 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0536  2-dehydropantoate 2-reductase  58.42 
 
 
303 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127784  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0475  2-dehydropantoate 2-reductase  58.42 
 
 
303 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0481  2-dehydropantoate 2-reductase  58.42 
 
 
303 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.378498 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0509  2-dehydropantoate 2-reductase  58.75 
 
 
303 aa  360  2e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.632143  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0892  2-dehydropantoate 2-reductase  58.36 
 
 
303 aa  358  4e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.868359  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0272  2-dehydropantoate 2-reductase  47.75 
 
 
289 aa  287  2e-76  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002696  2-dehydropantoate 2-reductase  39.53 
 
 
296 aa  222  7e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03288  2-dehydropantoate 2-reductase  39.8 
 
 
296 aa  212  4.9999999999999996e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  39.53 
 
 
296 aa  211  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0942  2-dehydropantoate 2-reductase  37.67 
 
 
299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3445  2-dehydropantoate 2-reductase  36.12 
 
 
310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137485  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3817  2-dehydropantoate 2-reductase  37.7 
 
 
327 aa  159  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3603  2-dehydropantoate 2-reductase  34.87 
 
 
311 aa  155  8e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0768  2-dehydropantoate 2-reductase  35.14 
 
 
324 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000150905  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3535  2-dehydropantoate 2-reductase  34.21 
 
 
311 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40675  hitchhiker  0.0000949952 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3158  2-dehydropantoate 2-reductase  34.87 
 
 
326 aa  153  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0708  2-dehydropantoate 2-reductase  33.99 
 
 
311 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3116  2-dehydropantoate 2-reductase  34.52 
 
 
343 aa  152  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0780  2-dehydropantoate 2-reductase  35.5 
 
 
327 aa  151  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.977069  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3726  2-dehydropantoate 2-reductase  34.31 
 
 
312 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0809  2-dehydropantoate 2-reductase  34.87 
 
 
326 aa  149  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0816  2-dehydropantoate 2-reductase  33 
 
 
320 aa  147  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3648  2-dehydropantoate 2-reductase  34.09 
 
 
319 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0849606  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57160  2-dehydropantoate 2-reductase  34.15 
 
 
303 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1362  2-dehydropantoate 2-reductase  32.79 
 
 
294 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4373  2-dehydropantoate 2-reductase  34.88 
 
 
305 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0586836 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1351  2-dehydropantoate 2-reductase  34.71 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.144072 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4422  2-dehydropantoate 2-reductase  35.99 
 
 
305 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  34.38 
 
 
305 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.774811  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4968  2-dehydropantoate 2-reductase  33.44 
 
 
303 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  34.38 
 
 
305 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1095  2-dehydropantoate 2-reductase  30.43 
 
 
312 aa  136  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.82934  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2262  2-dehydropantoate 2-reductase  32.76 
 
 
299 aa  135  8e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0937  2-dehydropantoate 2-reductase  35.29 
 
 
303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4088  2-dehydropantoate 2-reductase  36.01 
 
 
306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.77552  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13400  2-dehydropantoate 2-reductase  33.9 
 
 
297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2895  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 
306 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0400281  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4394  2-dehydropantoate 2-reductase  34.01 
 
 
306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.68453  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02768  2-dehydropantoate 2-reductase  31.39 
 
 
313 aa  127  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2559  2-dehydropantoate 2-reductase  34.77 
 
 
300 aa  124  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.195971 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  33.12 
 
 
294 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0730  2-dehydropantoate 2-reductase  33.55 
 
 
322 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4059  2-dehydropantoate 2-reductase  29.67 
 
 
294 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00247246  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3771  2-dehydropantoate 2-reductase  29.67 
 
 
296 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3662  2-dehydropantoate 2-reductase  29.1 
 
 
295 aa  109  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000935391  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3935  2-dehydropantoate 2-reductase  29.1 
 
 
295 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.665009 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3973  2-dehydropantoate 2-reductase  28.67 
 
 
296 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000131427  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4021  2-dehydropantoate 2-reductase  29.51 
 
 
296 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3747  2-dehydropantoate 2-reductase  29.14 
 
 
293 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684201  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3966  2-dehydropantoate 2-reductase  28.33 
 
 
294 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3679  2-dehydropantoate 2-reductase  28.33 
 
 
296 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.953522  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  31.6 
 
 
302 aa  105  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  30.23 
 
 
310 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1220  2-dehydropantoate 2-reductase  28.52 
 
 
296 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00748883  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2570  2-dehydropantoate 2-reductase  28.11 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00232131  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1881  2-dehydropantoate 2-reductase  31.76 
 
 
306 aa  93.2  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2003  2-dehydropantoate 2-reductase  27.84 
 
 
280 aa  92.8  6e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2032  2-dehydropantoate 2-reductase  27.83 
 
 
315 aa  90.1  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  26.6 
 
 
318 aa  89.4  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0462  2-dehydropantoate 2-reductase  27.61 
 
 
303 aa  87.8  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1009  2-dehydropantoate 2-reductase  29.6 
 
 
307 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2518  2-dehydropantoate 2-reductase  25.08 
 
 
311 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254196  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2470  2-dehydropantoate 2-reductase  25.08 
 
 
311 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54699  2-dehydropantoate 2-reductase (Ketopantoate reductase) (KPA reductase) (KPR)  28.36 
 
 
357 aa  83.2  0.000000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  26.32 
 
 
302 aa  82.8  0.000000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  26.76 
 
 
300 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  26.51 
 
 
299 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0383  2-dehydropantoate 2-reductase  27.7 
 
 
280 aa  82  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  24.08 
 
 
316 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1100  2-dehydropantoate 2-reductase  29.57 
 
 
302 aa  79.3  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0140808  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2147  2-dehydropantoate 2-reductase  32.6 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  24.62 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  25.74 
 
 
311 aa  78.6  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10586  2-dehydropantoate 2-reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06390)  28.89 
 
 
424 aa  77  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0791  2-dehydropantoate 2-reductase  28.62 
 
 
303 aa  77  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  28.34 
 
 
305 aa  76.6  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  29.04 
 
 
312 aa  76.3  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2874  2-dehydropantoate 2-reductase  35.06 
 
 
336 aa  75.5  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1786  2-dehydropantoate 2-reductase  25.5 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.43842 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  23.17 
 
 
313 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 
313 aa  73.9  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  24.84 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>