255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1881 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1881  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
306 aa  624  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1009  2-dehydropantoate 2-reductase  54.93 
 
 
307 aa  335  7e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3747  2-dehydropantoate 2-reductase  40.07 
 
 
293 aa  208  7e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684201  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2570  2-dehydropantoate 2-reductase  38.38 
 
 
296 aa  202  7e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00232131  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3966  2-dehydropantoate 2-reductase  39.73 
 
 
294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3662  2-dehydropantoate 2-reductase  38.85 
 
 
295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000935391  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3935  2-dehydropantoate 2-reductase  38.85 
 
 
295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.665009 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3679  2-dehydropantoate 2-reductase  39.06 
 
 
296 aa  196  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.953522  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3771  2-dehydropantoate 2-reductase  39.39 
 
 
296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4059  2-dehydropantoate 2-reductase  39.39 
 
 
294 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00247246  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4021  2-dehydropantoate 2-reductase  38.87 
 
 
296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3973  2-dehydropantoate 2-reductase  39.39 
 
 
296 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000131427  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1220  2-dehydropantoate 2-reductase  37.38 
 
 
296 aa  189  7e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00748883  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  32.05 
 
 
296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1362  2-dehydropantoate 2-reductase  31.83 
 
 
294 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  35.79 
 
 
302 aa  119  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  34.08 
 
 
310 aa  117  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0942  2-dehydropantoate 2-reductase  29.41 
 
 
299 aa  112  9e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3648  2-dehydropantoate 2-reductase  30.84 
 
 
319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0849606  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4968  2-dehydropantoate 2-reductase  31.72 
 
 
303 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0816  2-dehydropantoate 2-reductase  29.31 
 
 
320 aa  103  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0768  2-dehydropantoate 2-reductase  31.8 
 
 
324 aa  103  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000150905  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0730  2-dehydropantoate 2-reductase  30.13 
 
 
322 aa  102  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2889  2-dehydropantoate 2-reductase  30.36 
 
 
302 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  32.36 
 
 
309 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0383  2-dehydropantoate 2-reductase  34.85 
 
 
280 aa  102  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  35.23 
 
 
294 aa  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0193  2-dehydropantoate 2-reductase  29.14 
 
 
285 aa  101  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0380974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57160  2-dehydropantoate 2-reductase  31.1 
 
 
303 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1083  2-dehydropantoate 2-reductase  28.71 
 
 
303 aa  99.4  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208134 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002696  2-dehydropantoate 2-reductase  27.83 
 
 
296 aa  99.4  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3248  2-dehydropantoate 2-reductase  28.05 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3080  2-dehydropantoate 2-reductase  31.02 
 
 
306 aa  98.6  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.850912  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3106  2-dehydropantoate 2-reductase  28.05 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3068  2-dehydropantoate 2-reductase  28.05 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02768  2-dehydropantoate 2-reductase  31.8 
 
 
313 aa  98.2  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0377  2-dehydropantoate 2-reductase  28.3 
 
 
316 aa  97.4  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3726  2-dehydropantoate 2-reductase  30.45 
 
 
312 aa  96.7  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3535  2-dehydropantoate 2-reductase  31.19 
 
 
311 aa  96.7  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40675  hitchhiker  0.0000949952 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3276  2-dehydropantoate 2-reductase  30.69 
 
 
302 aa  96.3  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  30.16 
 
 
305 aa  95.9  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1100  2-dehydropantoate 2-reductase  32.57 
 
 
302 aa  95.5  9e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0140808  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1786  2-dehydropantoate 2-reductase  31.16 
 
 
278 aa  95.5  9e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.43842 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2895  2-dehydropantoate 2-reductase  30.36 
 
 
306 aa  94.4  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0400281  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3603  2-dehydropantoate 2-reductase  30.87 
 
 
311 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10586  2-dehydropantoate 2-reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06390)  28.9 
 
 
424 aa  94  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2262  2-dehydropantoate 2-reductase  27.36 
 
 
299 aa  94  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0780  2-dehydropantoate 2-reductase  30.61 
 
 
327 aa  93.6  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.977069  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2032  2-dehydropantoate 2-reductase  27.74 
 
 
315 aa  93.2  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0708  2-dehydropantoate 2-reductase  30.55 
 
 
311 aa  93.2  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0296  2-dehydropantoate 2-reductase  31.51 
 
 
309 aa  92.4  8e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.961677  normal  0.11487 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  29.89 
 
 
305 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03288  2-dehydropantoate 2-reductase  28.06 
 
 
296 aa  92  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0126  2-dehydropantoate 2-reductase  28.42 
 
 
318 aa  91.7  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00267865  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  32.06 
 
 
294 aa  92  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3817  2-dehydropantoate 2-reductase  33.64 
 
 
327 aa  91.3  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3116  2-dehydropantoate 2-reductase  29.73 
 
 
343 aa  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2003  2-dehydropantoate 2-reductase  34.69 
 
 
280 aa  91.3  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3445  2-dehydropantoate 2-reductase  30.82 
 
 
310 aa  89.7  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137485  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3158  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 
326 aa  90.1  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0536  2-dehydropantoate 2-reductase  29.37 
 
 
303 aa  89.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127784  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0494  2-dehydropantoate 2-reductase  29.37 
 
 
303 aa  89.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0475  2-dehydropantoate 2-reductase  29.37 
 
 
303 aa  89.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0473  2-dehydropantoate 2-reductase  29.37 
 
 
303 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0481  2-dehydropantoate 2-reductase  29.37 
 
 
303 aa  89.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.378498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0809  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 
326 aa  89.4  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1035  2-dehydropantoate 2-reductase  29.37 
 
 
302 aa  89  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.324105  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  29.15 
 
 
300 aa  89  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1351  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 
305 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.144072 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0937  2-dehydropantoate 2-reductase  31.36 
 
 
303 aa  89  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4373  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 
305 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0586836 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0509  2-dehydropantoate 2-reductase  29.24 
 
 
303 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.632143  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  28.75 
 
 
313 aa  87.8  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  27.8 
 
 
295 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  27.91 
 
 
299 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0313  2-dehydropantoate 2-reductase  34.35 
 
 
282 aa  86.7  5e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0390953  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3184  2-dehydropantoate 2-reductase  29.24 
 
 
303 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.547188  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3208  2-dehydropantoate 2-reductase  29.24 
 
 
303 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000640508 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0347  2-dehydropantoate 2-reductase  29.24 
 
 
303 aa  86.3  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00373  2-dehydropantoate 2-reductase  29.24 
 
 
303 aa  85.9  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  27.12 
 
 
313 aa  85.9  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  28.92 
 
 
305 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.774811  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00377  hypothetical protein  29.24 
 
 
303 aa  85.9  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4088  2-dehydropantoate 2-reductase  29.62 
 
 
306 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.77552  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0497  2-dehydropantoate 2-reductase  29.24 
 
 
303 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0457  2-dehydropantoate 2-reductase  28.33 
 
 
303 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0461  2-dehydropantoate 2-reductase  29.24 
 
 
303 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  27.48 
 
 
317 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1363  2-dehydropantoate 2-reductase  33.79 
 
 
283 aa  84  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00078431  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  29.97 
 
 
319 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  24.61 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13400  2-dehydropantoate 2-reductase  31.07 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0892  2-dehydropantoate 2-reductase  28.15 
 
 
303 aa  82.4  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.868359  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4422  2-dehydropantoate 2-reductase  29.27 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  28.28 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1519  2-dehydropantoate 2-reductase  25.08 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.982841  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  29.28 
 
 
319 aa  80.5  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  25.91 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  28.77 
 
 
307 aa  79.7  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  24.84 
 
 
318 aa  79  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>