More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2486 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
319 aa  635    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  98.12 
 
 
319 aa  617  1e-176  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  76.35 
 
 
345 aa  426  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  74.49 
 
 
325 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  67.46 
 
 
298 aa  374  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  63.51 
 
 
295 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  63.91 
 
 
313 aa  347  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  63.12 
 
 
317 aa  336  2.9999999999999997e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  61.69 
 
 
299 aa  333  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  57.58 
 
 
300 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  56.57 
 
 
299 aa  328  8e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  59.21 
 
 
305 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  56.08 
 
 
301 aa  325  7e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  56 
 
 
301 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  55.67 
 
 
301 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  60.42 
 
 
296 aa  295  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  40.26 
 
 
311 aa  219  6e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  39.19 
 
 
307 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  39.53 
 
 
307 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  38.28 
 
 
313 aa  153  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  36.05 
 
 
315 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  35.42 
 
 
315 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  34.06 
 
 
307 aa  143  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  34.15 
 
 
306 aa  142  7e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  35.86 
 
 
316 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  31.49 
 
 
305 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  36.54 
 
 
315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  31.49 
 
 
305 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  31.49 
 
 
305 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  35.18 
 
 
316 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  31.17 
 
 
305 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  37.22 
 
 
310 aa  137  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2951  2-dehydropantoate 2-reductase  31.17 
 
 
305 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  34.47 
 
 
335 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  34.08 
 
 
312 aa  133  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  33.86 
 
 
316 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  35.13 
 
 
316 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  35.13 
 
 
316 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02678  2-dehydropantoate 2-reductase  29.85 
 
 
339 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.321227  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  33.88 
 
 
309 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  34.29 
 
 
314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  30.13 
 
 
302 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  30.65 
 
 
309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  29.66 
 
 
302 aa  126  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  35.83 
 
 
294 aa  125  8.000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  32.12 
 
 
306 aa  125  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  28.75 
 
 
318 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03188  2-dehydropantoate 2-reductase  32.83 
 
 
338 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  32.42 
 
 
341 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  32.79 
 
 
318 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1796  2-dehydropantoate 2-reductase  32.1 
 
 
341 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.275897 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  32.01 
 
 
309 aa  124  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  35.97 
 
 
302 aa  122  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  33.76 
 
 
310 aa  122  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  30.03 
 
 
329 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  30.32 
 
 
309 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2518  2-dehydropantoate 2-reductase  28.34 
 
 
311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254196  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2470  2-dehydropantoate 2-reductase  28.34 
 
 
311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1445  2-dehydropantoate 2-reductase  27.51 
 
 
312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.219462  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1100  2-dehydropantoate 2-reductase  37.75 
 
 
302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0140808  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  27.91 
 
 
324 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  34.48 
 
 
316 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  31.49 
 
 
312 aa  119  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  28.21 
 
 
342 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  32.9 
 
 
323 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  32.68 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  30.19 
 
 
353 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0382  2-dehydropantoate 2-reductase  34.98 
 
 
351 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2865  2-dehydropantoate 2-reductase  30.03 
 
 
311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  31.13 
 
 
324 aa  116  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  32.61 
 
 
315 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1351  2-dehydropantoate 2-reductase  28.33 
 
 
307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0377  2-dehydropantoate 2-reductase  25.32 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  31.12 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  29.69 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  27.76 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1786  2-dehydropantoate 2-reductase  29.25 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.43842 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  31.02 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1293  2-dehydropantoate 2-reductase  24.6 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.519384  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  28.2 
 
 
312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  27.8 
 
 
316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  30.96 
 
 
331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  26.57 
 
 
305 aa  113  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  29.38 
 
 
335 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2858  2-dehydropantoate 2-reductase  27.74 
 
 
322 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  29.38 
 
 
335 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4737  2-dehydropantoate 2-reductase  36.91 
 
 
330 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  27.13 
 
 
326 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1979  2-dehydropantoate 2-reductase  27.3 
 
 
313 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0057409  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2022  2-dehydropantoate 2-reductase  27.8 
 
 
310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2500  2-dehydropantoate 2-reductase  33.85 
 
 
314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.637616 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  29.15 
 
 
335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0791  2-dehydropantoate 2-reductase  32.26 
 
 
303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1698  2-dehydropantoate 2-reductase  26.56 
 
 
306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.656315  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  25.41 
 
 
307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  29.39 
 
 
326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1115  2-dehydropantoate 2-reductase  32.81 
 
 
309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.275273  normal  0.917906 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1688  2-dehydropantoate 2-reductase  30.86 
 
 
351 aa  110  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.754321  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  27.76 
 
 
346 aa  109  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  29.14 
 
 
335 aa  109  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.484695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>