More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1400 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
345 aa  681    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  72.58 
 
 
298 aa  418  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  75.59 
 
 
319 aa  411  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  76.35 
 
 
319 aa  410  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  76.45 
 
 
325 aa  401  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  69.54 
 
 
313 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  66.67 
 
 
317 aa  393  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  66.89 
 
 
295 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  63.73 
 
 
299 aa  358  5e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  60.53 
 
 
305 aa  345  7e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  57.77 
 
 
300 aa  335  7e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  57.09 
 
 
301 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  56.27 
 
 
299 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  55.89 
 
 
301 aa  309  5e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  55.89 
 
 
301 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  60.42 
 
 
296 aa  293  3e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  40.59 
 
 
311 aa  231  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  38.54 
 
 
313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  36.18 
 
 
316 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  38.44 
 
 
316 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  38.44 
 
 
316 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  36.84 
 
 
316 aa  153  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  36.18 
 
 
316 aa  153  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  36.89 
 
 
307 aa  150  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  36.84 
 
 
315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  36.69 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  36.51 
 
 
315 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  33.45 
 
 
306 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  34.57 
 
 
335 aa  144  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  32.25 
 
 
305 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  32.25 
 
 
305 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  35.56 
 
 
312 aa  142  7e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  32.25 
 
 
305 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  34.54 
 
 
341 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  38.44 
 
 
316 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  35.11 
 
 
307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  31.92 
 
 
305 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  36.39 
 
 
315 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  35.86 
 
 
323 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2951  2-dehydropantoate 2-reductase  31.92 
 
 
305 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  35.39 
 
 
306 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  33.44 
 
 
314 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  33.66 
 
 
309 aa  135  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  34.08 
 
 
310 aa  134  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  31.37 
 
 
329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  31.67 
 
 
309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  33.23 
 
 
331 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02678  2-dehydropantoate 2-reductase  29.45 
 
 
339 aa  127  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.321227  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  32.47 
 
 
318 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  32.8 
 
 
310 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1796  2-dehydropantoate 2-reductase  32 
 
 
341 aa  123  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.275897 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  28.8 
 
 
318 aa  122  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  30.33 
 
 
302 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2629  2-dehydropantoate 2-reductase  34.6 
 
 
314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2500  2-dehydropantoate 2-reductase  33.65 
 
 
314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.637616 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  30.09 
 
 
342 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  32.81 
 
 
324 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  33.56 
 
 
294 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  28.12 
 
 
316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2605  2-dehydropantoate 2-reductase  33.02 
 
 
314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  28.93 
 
 
353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  31.63 
 
 
336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  30.28 
 
 
346 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  29.56 
 
 
324 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0382  2-dehydropantoate 2-reductase  34.37 
 
 
351 aa  116  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  29.86 
 
 
311 aa  116  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1100  2-dehydropantoate 2-reductase  35.5 
 
 
302 aa  116  6e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0140808  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2865  2-dehydropantoate 2-reductase  29.15 
 
 
311 aa  116  6.9999999999999995e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  30.36 
 
 
296 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2858  2-dehydropantoate 2-reductase  30.43 
 
 
322 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0383  2-dehydropantoate 2-reductase  33 
 
 
280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  28.67 
 
 
302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0707  2-dehydropantoate 2-reductase  35.05 
 
 
310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102156  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2408  2-dehydropantoate 2-reductase  33.98 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0790989 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  31.25 
 
 
333 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  30.77 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2470  2-dehydropantoate 2-reductase  27.56 
 
 
311 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  28.62 
 
 
312 aa  114  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  31 
 
 
325 aa  114  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2518  2-dehydropantoate 2-reductase  27.56 
 
 
311 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254196  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  33.02 
 
 
325 aa  113  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1422  2-dehydropantoate 2-reductase  30.12 
 
 
322 aa  113  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  31.03 
 
 
312 aa  113  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  28.12 
 
 
326 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0377  2-dehydropantoate 2-reductase  26.58 
 
 
316 aa  112  9e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5912  2-dehydropantoate 2-reductase  32.38 
 
 
314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  28.93 
 
 
324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 
302 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1724  2-dehydropantoate 2-reductase  29.08 
 
 
331 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1688  2-dehydropantoate 2-reductase  29.67 
 
 
351 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.754321  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  29.91 
 
 
327 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1115  2-dehydropantoate 2-reductase  31.76 
 
 
309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.275273  normal  0.917906 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2074  2-dehydropantoate 2-reductase  29.77 
 
 
323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.136591  normal  0.0111283 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0791  2-dehydropantoate 2-reductase  33.44 
 
 
303 aa  109  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  29.38 
 
 
325 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  27.96 
 
 
305 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  29.69 
 
 
325 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1970  2-dehydropantoate 2-reductase  33.02 
 
 
314 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181266  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  31.08 
 
 
332 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  31.08 
 
 
315 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>