More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1786 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1786  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 278 aa  549  1e-155  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.43842 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0383  2-dehydropantoate 2-reductase  57.25 
 
 		 280 aa  326  3e-88  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2003  2-dehydropantoate 2-reductase  51.62 
 
 		 280 aa  275  4e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0313  2-dehydropantoate 2-reductase  47.5 
 
 		 282 aa  267  1e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0390953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1363  2-dehydropantoate 2-reductase  49.29 
 
 		 283 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00078431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  32.78 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  36.54 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  28.28 
 
 		 319 aa  106  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  28.28 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  30.48 
 
 		 296 aa  102  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  32.54 
 
 		 313 aa  101  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  28.39 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  29.59 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  29.66 
 
 		 298 aa  99.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  27.05 
 
 		 300 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3158  2-dehydropantoate 2-reductase  30.74 
 
 		 326 aa  98.6  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  26.44 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2874  2-dehydropantoate 2-reductase  29.45 
 
 		 336 aa  98.2  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0193  2-dehydropantoate 2-reductase  31.95 
 
 		 285 aa  97.4  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0380974  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0462  2-dehydropantoate 2-reductase  29.15 
 
 		 303 aa  97.4  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  32.04 
 
 		 302 aa  97.4  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3648  2-dehydropantoate 2-reductase  29.22 
 
 		 319 aa  96.3  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0849606  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  27.43 
 
 		 299 aa  95.9  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0809  2-dehydropantoate 2-reductase  30.1 
 
 		 326 aa  96.3  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  27.4 
 
 		 301 aa  95.9  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3817  2-dehydropantoate 2-reductase  28.8 
 
 		 327 aa  95.5  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  26.25 
 
 		 345 aa  95.5  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  29.55 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3445  2-dehydropantoate 2-reductase  30.23 
 
 		 310 aa  94.4  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0942  2-dehydropantoate 2-reductase  29.69 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  26.97 
 
 		 325 aa  92.4  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  26.44 
 
 		 301 aa  92  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2382  2-dehydropantoate 2-reductase  31.58 
 
 		 314 aa  91.7  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4968  2-dehydropantoate 2-reductase  29.97 
 
 		 303 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  26.87 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0780  2-dehydropantoate 2-reductase  29.34 
 
 		 327 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.977069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2865  2-dehydropantoate 2-reductase  28.1 
 
 		 311 aa  90.1  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1100  2-dehydropantoate 2-reductase  27.93 
 
 		 302 aa  89.7  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0140808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  28.28 
 
 		 329 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1115  2-dehydropantoate 2-reductase  28.52 
 
 		 309 aa  89.4  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.275273  normal  0.917906 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1881  2-dehydropantoate 2-reductase  30.5 
 
 		 306 aa  88.6  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0816  2-dehydropantoate 2-reductase  27.18 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  28 
 
 		 307 aa  88.2  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3116  2-dehydropantoate 2-reductase  29.67 
 
 		 343 aa  86.7  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  26.58 
 
 		 316 aa  86.7  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  25.5 
 
 		 305 aa  85.9  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1009  2-dehydropantoate 2-reductase  31.56 
 
 		 307 aa  85.9  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2559  2-dehydropantoate 2-reductase  30.98 
 
 		 300 aa  85.9  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.195971 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57160  2-dehydropantoate 2-reductase  29.97 
 
 		 303 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  26.81 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  26.16 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2858  2-dehydropantoate 2-reductase  28.62 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0509  2-dehydropantoate 2-reductase  30.67 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.632143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0497  2-dehydropantoate 2-reductase  30.67 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  25.52 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  29.37 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00373  2-dehydropantoate 2-reductase  30.67 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3184  2-dehydropantoate 2-reductase  30.67 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.547188  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00377  hypothetical protein  30.67 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0457  2-dehydropantoate 2-reductase  30.67 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0892  2-dehydropantoate 2-reductase  28.12 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.868359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1855  2-dehydropantoate 2-reductase  28.16 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3208  2-dehydropantoate 2-reductase  30.67 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000640508 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0839  2-dehydropantoate 2-reductase  27.33 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0708  2-dehydropantoate 2-reductase  27.88 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1362  2-dehydropantoate 2-reductase  28.62 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0347  2-dehydropantoate 2-reductase  29.73 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1698  2-dehydropantoate 2-reductase  28.05 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.656315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1519  2-dehydropantoate 2-reductase  27.12 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.982841  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0461  2-dehydropantoate 2-reductase  30.22 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  24.35 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0768  2-dehydropantoate 2-reductase  25.32 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000150905  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  25.49 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  27.12 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02768  2-dehydropantoate 2-reductase  28.08 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002696  2-dehydropantoate 2-reductase  29.07 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3535  2-dehydropantoate 2-reductase  27.65 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40675  hitchhiker  0.0000949952 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  28.33 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1422  2-dehydropantoate 2-reductase  28.9 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3726  2-dehydropantoate 2-reductase  27.69 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3603  2-dehydropantoate 2-reductase  27.72 
 
 		 311 aa  79  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0536  2-dehydropantoate 2-reductase  26.28 
 
 		 303 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0481  2-dehydropantoate 2-reductase  26.28 
 
 		 303 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.378498 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0475  2-dehydropantoate 2-reductase  26.28 
 
 		 303 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0494  2-dehydropantoate 2-reductase  26.28 
 
 		 303 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0473  2-dehydropantoate 2-reductase  26.28 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  25.5 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3747  2-dehydropantoate 2-reductase  26.62 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684201  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  31.73 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3276  2-dehydropantoate 2-reductase  27.55 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  25.5 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03288  2-dehydropantoate 2-reductase  28.42 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  26.12 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3106  2-dehydropantoate 2-reductase  26.74 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2895  2-dehydropantoate 2-reductase  29.43 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0400281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3248  2-dehydropantoate 2-reductase  26.74 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3068  2-dehydropantoate 2-reductase  26.74 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  25.1 
 
 		 307 aa  75.9  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1351  2-dehydropantoate 2-reductase  30.89 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  28.05 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>