More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2382 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2382  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 314 aa  624  1e-178  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0791  2-dehydropantoate 2-reductase  47.33 
 
 		 303 aa  265  5e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1698  2-dehydropantoate 2-reductase  40.67 
 
 		 306 aa  247  1e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.656315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1115  2-dehydropantoate 2-reductase  45.51 
 
 		 309 aa  243  1.9999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.275273  normal  0.917906 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1519  2-dehydropantoate 2-reductase  38.21 
 
 		 309 aa  238  1e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.982841  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  39.33 
 
 		 302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0377  2-dehydropantoate 2-reductase  29.45 
 
 		 316 aa  142  7e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  31.82 
 
 		 316 aa  136  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  31.25 
 
 		 315 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  28.34 
 
 		 318 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  33.97 
 
 		 301 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  27.1 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  33.65 
 
 		 301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  33.44 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  31.48 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  32.48 
 
 		 309 aa  109  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1855  2-dehydropantoate 2-reductase  30.41 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  32.59 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  33.44 
 
 		 299 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2858  2-dehydropantoate 2-reductase  31.39 
 
 		 322 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  33.85 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0383  2-dehydropantoate 2-reductase  36.42 
 
 		 280 aa  106  4e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  33.44 
 
 		 319 aa  106  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1422  2-dehydropantoate 2-reductase  30.74 
 
 		 322 aa  106  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  32.67 
 
 		 294 aa  103  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  31.95 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  32.47 
 
 		 299 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  32.92 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  32.79 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  30.99 
 
 		 298 aa  99.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  29.69 
 
 		 302 aa  99.4  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  31.73 
 
 		 300 aa  99  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  29.58 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1351  2-dehydropantoate 2-reductase  28.9 
 
 		 307 aa  97.8  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  31.33 
 
 		 302 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  27.71 
 
 		 311 aa  95.9  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1786  2-dehydropantoate 2-reductase  28.81 
 
 		 278 aa  95.9  9e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.43842 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  28.21 
 
 		 310 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  25.97 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  31.83 
 
 		 345 aa  94.7  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  31.13 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1790  2-dehydropantoate 2-reductase  32.22 
 
 		 332 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1677  2-dehydropantoate 2-reductase  31.15 
 
 		 319 aa  91.7  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  30.68 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  26.6 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  25.65 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  26.6 
 
 		 305 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2022  2-dehydropantoate 2-reductase  27.32 
 
 		 310 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  29.92 
 
 		 307 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1285  2-dehydropantoate 2-reductase  25.48 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  27.76 
 
 		 314 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1719  2-dehydropantoate 2-reductase  32.35 
 
 		 312 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11731  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  26.6 
 
 		 305 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2874  2-dehydropantoate 2-reductase  31.46 
 
 		 336 aa  90.5  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  29.58 
 
 		 306 aa  90.1  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  26.6 
 
 		 305 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  28.44 
 
 		 329 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  29.68 
 
 		 335 aa  89.4  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02678  2-dehydropantoate 2-reductase  28.48 
 
 		 339 aa  89  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.321227  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  31.48 
 
 		 325 aa  89  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2951  2-dehydropantoate 2-reductase  26.6 
 
 		 305 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1100  2-dehydropantoate 2-reductase  33.11 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0140808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2518  2-dehydropantoate 2-reductase  27.76 
 
 		 311 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254196  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2470  2-dehydropantoate 2-reductase  27.76 
 
 		 311 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0600  2-dehydropantoate 2-reductase  27.74 
 
 		 314 aa  87.4  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000137771  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0349  2-dehydropantoate 2-reductase  26.11 
 
 		 321 aa  87  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2052  2-dehydropantoate 2-reductase  30.63 
 
 		 344 aa  86.3  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  30.55 
 
 		 302 aa  85.9  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1405  2-dehydropantoate 2-reductase  27.51 
 
 		 307 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1293  2-dehydropantoate 2-reductase  25.08 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.519384  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2159  2-dehydropantoate 2-reductase  38.46 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1477  ketopantoate reductase  25.2 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1766  2-dehydropantoate 2-reductase  32.12 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.411691  hitchhiker  0.000000000967397 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  29.37 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1445  2-dehydropantoate 2-reductase  25.53 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.219462  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2482  2-dehydropantoate 2-reductase  30.84 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.386001  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0095  2-dehydropantoate 2-reductase  30.84 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0453394  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0889  2-dehydropantoate 2-reductase  30.84 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.298016  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5912  2-dehydropantoate 2-reductase  27.13 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  32.97 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0348  2-dehydropantoate 2-reductase  30.84 
 
 		 313 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  27.59 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0647  2-dehydropantoate 2-reductase  30.53 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00836625  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2981  2-dehydropantoate 2-reductase  26.21 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  29.84 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  29.84 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0833  2-dehydropantoate 2-reductase  29.03 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476059 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2605  2-dehydropantoate 2-reductase  27.78 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  28.04 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  28.21 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1051  2-dehydropantoate 2-reductase  30.84 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  29.55 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  28.01 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  26.96 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  28.25 
 
 		 316 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03188  2-dehydropantoate 2-reductase  30.84 
 
 		 338 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0126  2-dehydropantoate 2-reductase  22.8 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00267865  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  27.5 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2629  2-dehydropantoate 2-reductase  28.18 
 
 		 314 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>