More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2159 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_2159  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 312 aa  610  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1790  2-dehydropantoate 2-reductase  90.48 
 
 		 332 aa  498  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1719  2-dehydropantoate 2-reductase  90.14 
 
 		 312 aa  498  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11731  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  46.98 
 
 		 307 aa  261  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0839  2-dehydropantoate 2-reductase  46.33 
 
 		 307 aa  257  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2865  2-dehydropantoate 2-reductase  47.18 
 
 		 311 aa  248  7e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3165  2-dehydropantoate 2-reductase  38.41 
 
 		 305 aa  199  5e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  33.07 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  33.67 
 
 		 301 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  31.52 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  33.21 
 
 		 316 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  33.21 
 
 		 316 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  32.27 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  31.06 
 
 		 316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  34.63 
 
 		 341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  33.11 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  34.24 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  25.59 
 
 		 311 aa  106  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  33.19 
 
 		 315 aa  105  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4927  2-dehydropantoate 2-reductase  32.3 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332007  normal  0.934837 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  33.62 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  31.09 
 
 		 307 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  30.71 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  30.85 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  29.43 
 
 		 309 aa  100  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  31.09 
 
 		 335 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  29.71 
 
 		 318 aa  98.2  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  31.25 
 
 		 315 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  32.69 
 
 		 324 aa  97.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  31.25 
 
 		 315 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  32.03 
 
 		 335 aa  96.3  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  28.42 
 
 		 302 aa  96.3  6e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  32.69 
 
 		 300 aa  95.9  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  32.7 
 
 		 323 aa  95.9  8e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  28.41 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  29.93 
 
 		 313 aa  94  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  30.77 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  28.23 
 
 		 306 aa  93.6  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  33.02 
 
 		 307 aa  93.2  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1964  2-dehydropantoate 2-reductase  23.86 
 
 		 314 aa  92  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00305796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1877  2-dehydropantoate 2-reductase  25.35 
 
 		 314 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  36.42 
 
 		 313 aa  91.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  27.99 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  25.95 
 
 		 307 aa  91.7  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1746  2-dehydropantoate 2-reductase  25.7 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1884  2-dehydropantoate 2-reductase  25.7 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1738  2-dehydropantoate 2-reductase  24.91 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0314725  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  34.19 
 
 		 312 aa  91.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  29.26 
 
 		 333 aa  90.9  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1918  2-dehydropantoate 2-reductase  24.65 
 
 		 314 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000931177 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0197  2-dehydropantoate 2-reductase  29.79 
 
 		 324 aa  90.9  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0135  2-dehydropantoate 2-reductase  28.42 
 
 		 324 aa  90.9  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  28.85 
 
 		 309 aa  90.1  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1696  2-dehydropantoate 2-reductase  24.21 
 
 		 314 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231571  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  32.04 
 
 		 324 aa  89.7  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3467  2-dehydropantoate 2-reductase  24.65 
 
 		 314 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000905297  hitchhiker  8.32908e-18 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  29.34 
 
 		 335 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  29.34 
 
 		 335 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  29.39 
 
 		 336 aa  89  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  29.65 
 
 		 335 aa  89  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1991  2-dehydropantoate 2-reductase  24.3 
 
 		 314 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1796  2-dehydropantoate 2-reductase  29.66 
 
 		 341 aa  88.6  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275897 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  29.45 
 
 		 346 aa  88.6  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  28.73 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0791  2-dehydropantoate 2-reductase  28.99 
 
 		 303 aa  87  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  27.24 
 
 		 329 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  34.04 
 
 		 315 aa  86.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  28.95 
 
 		 298 aa  86.3  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1405  2-dehydropantoate 2-reductase  26.04 
 
 		 307 aa  85.9  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0462  2-dehydropantoate 2-reductase  28.91 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  30.12 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  30.19 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  29.01 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  29.04 
 
 		 335 aa  84  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2382  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  31.16 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1351  2-dehydropantoate 2-reductase  30.1 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.144072 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2669  2-dehydropantoate 2-reductase  28.42 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0588922  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1115  2-dehydropantoate 2-reductase  27.74 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.275273  normal  0.917906 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  28.39 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  28.76 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.774811  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  30.29 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  30.47 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  29.04 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  29.19 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1100  2-dehydropantoate 2-reductase  35.86 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0140808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3888  2-dehydropantoate 2-reductase  31.73 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0769062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0600  2-dehydropantoate 2-reductase  24.66 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000137771  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  27.43 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  30.5 
 
 		 331 aa  80.1  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4373  2-dehydropantoate 2-reductase  28.23 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586836 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  28.86 
 
 		 345 aa  79.3  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1471  2-dehydropantoate 2-reductase  29.8 
 
 		 334 aa  79.3  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  27.59 
 
 		 326 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0377  2-dehydropantoate 2-reductase  22.92 
 
 		 316 aa  79  0.00000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1855  2-dehydropantoate 2-reductase  24.39 
 
 		 316 aa  79  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  29.17 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  23.79 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  30.57 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>