More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1216 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 325 aa  659    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  79.32 
 
 		 324 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  75.31 
 
 		 324 aa  485  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  64.51 
 
 		 325 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  63.69 
 
 		 353 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  63.35 
 
 		 335 aa  436  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  64.15 
 
 		 342 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  60.92 
 
 		 324 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  60.62 
 
 		 324 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  62.73 
 
 		 325 aa  418  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  61.11 
 
 		 346 aa  420  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  62.11 
 
 		 325 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  60.24 
 
 		 326 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1558  2-dehydropantoate 2-reductase  79.28 
 
 		 447 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  57.98 
 
 		 323 aa  389  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  55.86 
 
 		 336 aa  365  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  57.94 
 
 		 333 aa  361  1e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  55.17 
 
 		 332 aa  356  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  54.04 
 
 		 326 aa  355  5.999999999999999e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  53.11 
 
 		 332 aa  354  8.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  54.35 
 
 		 335 aa  348  5e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  56.11 
 
 		 335 aa  348  1e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  54.8 
 
 		 335 aa  344  1e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  54.8 
 
 		 335 aa  344  1e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  53.73 
 
 		 337 aa  338  5.9999999999999996e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  53.07 
 
 		 336 aa  333  3e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  50.95 
 
 		 339 aa  317  2e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00418767  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  44.62 
 
 		 327 aa  277  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  44.62 
 
 		 326 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5382  2-dehydropantoate 2-reductase  45.54 
 
 		 327 aa  275  7e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324063  normal  0.227406 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4110  2-dehydropantoate 2-reductase  46.86 
 
 		 336 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal  0.957383 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  44 
 
 		 326 aa  272  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  43.69 
 
 		 326 aa  272  7e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1724  2-dehydropantoate 2-reductase  42.77 
 
 		 331 aa  269  4e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1224  2-dehydropantoate 2-reductase  44.92 
 
 		 327 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318793 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0197  2-dehydropantoate 2-reductase  45.54 
 
 		 324 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  44.16 
 
 		 331 aa  264  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3234  2-dehydropantoate 2-reductase  45.54 
 
 		 325 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3558  2-dehydropantoate 2-reductase  45.23 
 
 		 325 aa  262  6e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0135  2-dehydropantoate 2-reductase  44.31 
 
 		 324 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3341  2-dehydropantoate 2-reductase  43.21 
 
 		 324 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1964  2-dehydropantoate 2-reductase  42.9 
 
 		 329 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.734659  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1471  2-dehydropantoate 2-reductase  42.9 
 
 		 329 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1238  2-dehydropantoate 2-reductase  42.9 
 
 		 329 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2487  2-dehydropantoate 2-reductase  42.9 
 
 		 329 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  43.08 
 
 		 325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2371  2-dehydropantoate 2-reductase  42.38 
 
 		 333 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0234  2-dehydropantoate 2-reductase  44.17 
 
 		 325 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1345  2-dehydropantoate 2-reductase  41.98 
 
 		 332 aa  250  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162184  normal  0.0787128 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2330  2-dehydropantoate 2-reductase  41.87 
 
 		 337 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.787912  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1471  2-dehydropantoate 2-reductase  44.83 
 
 		 334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1845  2-dehydropantoate 2-reductase  41.05 
 
 		 332 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.995272  normal  0.0110748 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1796  2-dehydropantoate 2-reductase  40.91 
 
 		 341 aa  243  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275897 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1915  2-dehydropantoate 2-reductase  41.36 
 
 		 332 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5228  2-dehydropantoate 2-reductase  40.43 
 
 		 332 aa  240  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2115  2-dehydropantoate 2-reductase  41.05 
 
 		 329 aa  239  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6152  2-dehydropantoate 2-reductase  40.43 
 
 		 332 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1927  2-dehydropantoate 2-reductase  40.43 
 
 		 332 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193569  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1950  2-dehydropantoate 2-reductase  40.43 
 
 		 332 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0818482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0153  2-dehydropantoate 2-reductase  39.05 
 
 		 351 aa  209  8e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45590  hypothetical protein  37.81 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1818  2-dehydropantoate 2-reductase  33.02 
 
 		 327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3888  2-dehydropantoate 2-reductase  32.4 
 
 		 324 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0769062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3657  ketopantoate reductase ApbA/PanE  42.25 
 
 		 223 aa  149  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7671 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  31.29 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  32.6 
 
 		 300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  30.82 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  31.94 
 
 		 306 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  31.15 
 
 		 309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03720  2-dehydropantoate 2-reductase  31.35 
 
 		 314 aa  116  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  29.69 
 
 		 305 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  31.48 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  31.17 
 
 		 316 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  31.11 
 
 		 312 aa  113  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  30.31 
 
 		 315 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  27.99 
 
 		 302 aa  112  9e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0294  2-dehydropantoate 2-reductase  26.96 
 
 		 307 aa  112  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.220777  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  27.99 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  30.34 
 
 		 335 aa  109  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  29.69 
 
 		 315 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  30.63 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  30.03 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  30.03 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  30.63 
 
 		 341 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  29.97 
 
 		 307 aa  106  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  28.42 
 
 		 311 aa  106  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6167  2-dehydropantoate 2-reductase  29.45 
 
 		 314 aa  105  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  29.25 
 
 		 298 aa  105  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  31.01 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2699  2-dehydropantoate 2-reductase  30.55 
 
 		 322 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122985  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  28.88 
 
 		 312 aa  105  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  29.66 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  32.08 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  30 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  29.05 
 
 		 311 aa  104  3e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  28.09 
 
 		 314 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  29.28 
 
 		 318 aa  103  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  28.53 
 
 		 319 aa  102  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  27.67 
 
 		 319 aa  99.8  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  29.63 
 
 		 312 aa  99.8  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>