More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1950 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_6152  2-dehydropantoate 2-reductase  98.8 
 
 
332 aa  647    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1950  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
332 aa  654    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0818482  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1927  2-dehydropantoate 2-reductase  98.8 
 
 
332 aa  647    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193569  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5228  2-dehydropantoate 2-reductase  96.08 
 
 
332 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1915  2-dehydropantoate 2-reductase  92.77 
 
 
332 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1845  2-dehydropantoate 2-reductase  91.57 
 
 
332 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.995272  normal  0.0110748 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1345  2-dehydropantoate 2-reductase  90.66 
 
 
332 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162184  normal  0.0787128 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1471  2-dehydropantoate 2-reductase  73.46 
 
 
329 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2487  2-dehydropantoate 2-reductase  73.46 
 
 
329 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1238  2-dehydropantoate 2-reductase  73.46 
 
 
329 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1964  2-dehydropantoate 2-reductase  73.46 
 
 
329 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.734659  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3341  2-dehydropantoate 2-reductase  73.15 
 
 
324 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2115  2-dehydropantoate 2-reductase  74.38 
 
 
329 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2330  2-dehydropantoate 2-reductase  71.99 
 
 
337 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.787912  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2371  2-dehydropantoate 2-reductase  72.87 
 
 
333 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  53.85 
 
 
331 aa  318  6e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3234  2-dehydropantoate 2-reductase  52.13 
 
 
325 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3558  2-dehydropantoate 2-reductase  51.52 
 
 
325 aa  312  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  51.52 
 
 
325 aa  310  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  50.93 
 
 
326 aa  305  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  50.62 
 
 
326 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  50.31 
 
 
326 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  45.68 
 
 
327 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5382  2-dehydropantoate 2-reductase  47.84 
 
 
327 aa  289  6e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324063  normal  0.227406 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1224  2-dehydropantoate 2-reductase  47.53 
 
 
327 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.318793 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1796  2-dehydropantoate 2-reductase  46.49 
 
 
341 aa  286  5e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.275897 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0135  2-dehydropantoate 2-reductase  48.7 
 
 
324 aa  285  9e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878184  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1724  2-dehydropantoate 2-reductase  44.14 
 
 
331 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0197  2-dehydropantoate 2-reductase  46.43 
 
 
324 aa  272  6e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431306  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0153  2-dehydropantoate 2-reductase  48.1 
 
 
351 aa  265  7e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0234  2-dehydropantoate 2-reductase  47.73 
 
 
325 aa  265  8e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  43.89 
 
 
324 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  40.62 
 
 
353 aa  249  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  44.14 
 
 
324 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  42.45 
 
 
335 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  42.59 
 
 
337 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  40.88 
 
 
325 aa  242  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  43.93 
 
 
323 aa  239  4e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  40.43 
 
 
346 aa  239  5e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  40.8 
 
 
324 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  40.49 
 
 
324 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  40.82 
 
 
333 aa  235  8e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  39.75 
 
 
332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  40.43 
 
 
325 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  41.46 
 
 
336 aa  233  5e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  40.62 
 
 
325 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  41.4 
 
 
335 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  38.8 
 
 
332 aa  227  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  40.32 
 
 
326 aa  227  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  40.31 
 
 
325 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  39.02 
 
 
326 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  40.56 
 
 
342 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  39.13 
 
 
336 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  41.27 
 
 
335 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  41.27 
 
 
335 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  40.95 
 
 
335 aa  219  6e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  38.31 
 
 
339 aa  212  7e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00418767  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4110  2-dehydropantoate 2-reductase  40.5 
 
 
336 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal  0.957383 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1558  2-dehydropantoate 2-reductase  41.85 
 
 
447 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1818  2-dehydropantoate 2-reductase  33.44 
 
 
327 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1471  2-dehydropantoate 2-reductase  34.92 
 
 
334 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45590  hypothetical protein  35.87 
 
 
359 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3657  ketopantoate reductase ApbA/PanE  48.31 
 
 
223 aa  166  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7671 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3888  2-dehydropantoate 2-reductase  37.85 
 
 
324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0769062  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03720  2-dehydropantoate 2-reductase  32.81 
 
 
314 aa  119  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2699  2-dehydropantoate 2-reductase  35.6 
 
 
322 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122985  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  29.39 
 
 
329 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  31.83 
 
 
316 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  31.83 
 
 
316 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  30.23 
 
 
315 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  28.66 
 
 
316 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 
302 aa  94.4  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  30.23 
 
 
315 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1422  2-dehydropantoate 2-reductase  27.69 
 
 
322 aa  94  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2858  2-dehydropantoate 2-reductase  27.69 
 
 
322 aa  94  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  29.56 
 
 
316 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1979  2-dehydropantoate 2-reductase  28.12 
 
 
313 aa  92  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0057409  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  29.05 
 
 
319 aa  92  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  30.74 
 
 
315 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  29.05 
 
 
319 aa  90.5  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  28.75 
 
 
312 aa  89  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  27.24 
 
 
309 aa  89  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2991  2-dehydropantoate 2-reductase  31.19 
 
 
337 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.1296  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  30.55 
 
 
341 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  26.89 
 
 
335 aa  87.4  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  29.56 
 
 
307 aa  87  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 
300 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  31.83 
 
 
316 aa  86.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 
299 aa  86.3  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  29.26 
 
 
316 aa  86.3  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  27.81 
 
 
302 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  27.1 
 
 
311 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  28.97 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  27.22 
 
 
306 aa  82.8  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  28.97 
 
 
307 aa  82.8  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1688  2-dehydropantoate 2-reductase  27.56 
 
 
351 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.754321  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  28.97 
 
 
307 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2219  2-dehydropantoate 2-reductase  33.98 
 
 
335 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205933  normal  0.043559 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3892  2-dehydropantoate 2-reductase  29.05 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  28.12 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>