More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1818 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1818  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 327 aa  676    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45590  hypothetical protein  50.78 
 
 		 359 aa  310  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  35.85 
 
 		 326 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  35.85 
 
 		 326 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  35.85 
 
 		 326 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  36.79 
 
 		 325 aa  211  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  36.22 
 
 		 327 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5382  2-dehydropantoate 2-reductase  34.59 
 
 		 327 aa  210  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324063  normal  0.227406 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  37.42 
 
 		 323 aa  207  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1224  2-dehydropantoate 2-reductase  33.86 
 
 		 327 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318793 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  33.84 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3234  2-dehydropantoate 2-reductase  34.91 
 
 		 325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  34.5 
 
 		 324 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1796  2-dehydropantoate 2-reductase  33.13 
 
 		 341 aa  199  6e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275897 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0135  2-dehydropantoate 2-reductase  35.53 
 
 		 324 aa  199  6e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3558  2-dehydropantoate 2-reductase  34.59 
 
 		 325 aa  199  7e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  35.55 
 
 		 342 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  35.67 
 
 		 353 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  35.35 
 
 		 325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  35.35 
 
 		 335 aa  196  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0197  2-dehydropantoate 2-reductase  36.84 
 
 		 324 aa  196  6e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  33.84 
 
 		 332 aa  195  8.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  33.55 
 
 		 324 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  37.62 
 
 		 333 aa  194  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1845  2-dehydropantoate 2-reductase  34.6 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.995272  normal  0.0110748 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  34.6 
 
 		 326 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5228  2-dehydropantoate 2-reductase  33.44 
 
 		 332 aa  192  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  33.76 
 
 		 325 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6152  2-dehydropantoate 2-reductase  33.76 
 
 		 332 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1915  2-dehydropantoate 2-reductase  34.92 
 
 		 332 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  33.96 
 
 		 326 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1927  2-dehydropantoate 2-reductase  33.76 
 
 		 332 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193569  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3341  2-dehydropantoate 2-reductase  33.12 
 
 		 324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  35.71 
 
 		 332 aa  189  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1950  2-dehydropantoate 2-reductase  33.44 
 
 		 332 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0818482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  33.44 
 
 		 325 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1345  2-dehydropantoate 2-reductase  33.44 
 
 		 332 aa  188  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162184  normal  0.0787128 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1724  2-dehydropantoate 2-reductase  33.75 
 
 		 331 aa  188  9e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1471  2-dehydropantoate 2-reductase  33.12 
 
 		 329 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  32.39 
 
 		 324 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1964  2-dehydropantoate 2-reductase  33.12 
 
 		 329 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.734659  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1238  2-dehydropantoate 2-reductase  33.12 
 
 		 329 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  32.8 
 
 		 346 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  33.78 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2487  2-dehydropantoate 2-reductase  33.12 
 
 		 329 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  33.77 
 
 		 335 aa  186  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0234  2-dehydropantoate 2-reductase  33.75 
 
 		 325 aa  183  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2115  2-dehydropantoate 2-reductase  33.12 
 
 		 329 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2371  2-dehydropantoate 2-reductase  32.38 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 		 324 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  33.12 
 
 		 339 aa  180  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00418767  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2330  2-dehydropantoate 2-reductase  31.97 
 
 		 337 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.787912  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  31.8 
 
 		 337 aa  172  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4110  2-dehydropantoate 2-reductase  31.16 
 
 		 336 aa  170  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal  0.957383 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  31.48 
 
 		 336 aa  166  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  30.84 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3888  2-dehydropantoate 2-reductase  33.98 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0769062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0153  2-dehydropantoate 2-reductase  32.47 
 
 		 351 aa  163  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  30.84 
 
 		 335 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  30.84 
 
 		 335 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1471  2-dehydropantoate 2-reductase  33.02 
 
 		 334 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  31.37 
 
 		 336 aa  155  9e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1558  2-dehydropantoate 2-reductase  31.23 
 
 		 447 aa  149  7e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2699  2-dehydropantoate 2-reductase  34.67 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  29.65 
 
 		 302 aa  113  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  31.9 
 
 		 312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3657  ketopantoate reductase ApbA/PanE  35.98 
 
 		 223 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7671 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  29.93 
 
 		 312 aa  109  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  28.18 
 
 		 311 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  27.76 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  25.31 
 
 		 335 aa  106  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  27.24 
 
 		 315 aa  106  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  27.13 
 
 		 318 aa  105  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  28.93 
 
 		 315 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  27.04 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  26.23 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  26.71 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  28.62 
 
 		 315 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  25.65 
 
 		 316 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  26.17 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  26.28 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  25.64 
 
 		 341 aa  96.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  29.07 
 
 		 323 aa  95.9  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  27.36 
 
 		 311 aa  95.9  8e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  24.92 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3118  2-dehydropantoate 2-reductase  26.69 
 
 		 312 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  24.92 
 
 		 307 aa  94  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  28.47 
 
 		 312 aa  92.8  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.399113 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0743  ketopantoate reductase ApbA/PanE  26.1 
 
 		 311 aa  92.8  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4423  2-dehydropantoate 2-reductase  25.76 
 
 		 311 aa  92.4  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.852681 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  27.94 
 
 		 316 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  27.94 
 
 		 316 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  25.55 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6167  2-dehydropantoate 2-reductase  26.37 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  27.52 
 
 		 302 aa  90.5  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2518  2-dehydropantoate 2-reductase  24.47 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254196  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2470  2-dehydropantoate 2-reductase  24.47 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2669  2-dehydropantoate 2-reductase  24.66 
 
 		 310 aa  90.1  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0588922  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1893  2-dehydropantoate 2-reductase  30.65 
 
 		 310 aa  89.4  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00746651  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0294  2-dehydropantoate 2-reductase  25.15 
 
 		 307 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.220777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>