More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3361 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 325 aa  647    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3234  2-dehydropantoate 2-reductase  84 
 
 		 325 aa  546  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3558  2-dehydropantoate 2-reductase  83.38 
 
 		 325 aa  545  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  64.81 
 
 		 326 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1724  2-dehydropantoate 2-reductase  61.11 
 
 		 331 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  63.58 
 
 		 326 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  63.27 
 
 		 326 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  59.63 
 
 		 331 aa  351  1e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  55.56 
 
 		 327 aa  340  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1224  2-dehydropantoate 2-reductase  55.86 
 
 		 327 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318793 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5382  2-dehydropantoate 2-reductase  56.17 
 
 		 327 aa  339  4e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324063  normal  0.227406 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1796  2-dehydropantoate 2-reductase  56.63 
 
 		 341 aa  338  9e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275897 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0197  2-dehydropantoate 2-reductase  57.1 
 
 		 324 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0234  2-dehydropantoate 2-reductase  58.77 
 
 		 325 aa  336  3.9999999999999995e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0153  2-dehydropantoate 2-reductase  61.34 
 
 		 351 aa  335  5e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0135  2-dehydropantoate 2-reductase  56.79 
 
 		 324 aa  332  4e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1345  2-dehydropantoate 2-reductase  52.78 
 
 		 332 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162184  normal  0.0787128 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5228  2-dehydropantoate 2-reductase  51.85 
 
 		 332 aa  305  7e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6152  2-dehydropantoate 2-reductase  51.52 
 
 		 332 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1927  2-dehydropantoate 2-reductase  51.52 
 
 		 332 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193569  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1950  2-dehydropantoate 2-reductase  50.91 
 
 		 332 aa  299  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0818482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1915  2-dehydropantoate 2-reductase  50.93 
 
 		 332 aa  296  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2487  2-dehydropantoate 2-reductase  52.16 
 
 		 329 aa  295  9e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1471  2-dehydropantoate 2-reductase  51.54 
 
 		 329 aa  292  6e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1964  2-dehydropantoate 2-reductase  51.54 
 
 		 329 aa  292  6e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.734659  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1238  2-dehydropantoate 2-reductase  51.54 
 
 		 329 aa  292  6e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3341  2-dehydropantoate 2-reductase  51.54 
 
 		 324 aa  291  7e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2115  2-dehydropantoate 2-reductase  51.54 
 
 		 329 aa  289  4e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1845  2-dehydropantoate 2-reductase  49.69 
 
 		 332 aa  289  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.995272  normal  0.0110748 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2371  2-dehydropantoate 2-reductase  50.61 
 
 		 333 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2330  2-dehydropantoate 2-reductase  50 
 
 		 337 aa  285  7e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.787912  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  46.71 
 
 		 324 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  46.89 
 
 		 332 aa  266  5e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  46.77 
 
 		 332 aa  263  4e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  44.06 
 
 		 333 aa  259  3e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  42.9 
 
 		 353 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  43.71 
 
 		 326 aa  249  4e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  46.13 
 
 		 324 aa  248  8e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  41.1 
 
 		 326 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  41.36 
 
 		 324 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  41.67 
 
 		 324 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  41.49 
 
 		 346 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  42.24 
 
 		 335 aa  241  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  42.55 
 
 		 335 aa  240  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  42.55 
 
 		 335 aa  240  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  43.08 
 
 		 325 aa  239  5.999999999999999e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  41.98 
 
 		 336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  42.26 
 
 		 336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  41.93 
 
 		 337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  39.81 
 
 		 325 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  42.37 
 
 		 335 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  41.23 
 
 		 323 aa  230  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  39.56 
 
 		 342 aa  229  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  40.32 
 
 		 335 aa  229  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  40.32 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  38.87 
 
 		 325 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1558  2-dehydropantoate 2-reductase  44.19 
 
 		 447 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1818  2-dehydropantoate 2-reductase  36.79 
 
 		 327 aa  211  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3657  ketopantoate reductase ApbA/PanE  45.56 
 
 		 223 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7671 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  37.7 
 
 		 339 aa  200  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00418767  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3888  2-dehydropantoate 2-reductase  38.44 
 
 		 324 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0769062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1471  2-dehydropantoate 2-reductase  40.13 
 
 		 334 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4110  2-dehydropantoate 2-reductase  36.54 
 
 		 336 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal  0.957383 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45590  hypothetical protein  35.22 
 
 		 359 aa  168  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03720  2-dehydropantoate 2-reductase  33.02 
 
 		 314 aa  119  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  32.09 
 
 		 312 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  31.69 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  31.72 
 
 		 316 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  31.72 
 
 		 316 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  32.1 
 
 		 307 aa  109  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2699  2-dehydropantoate 2-reductase  34.2 
 
 		 322 aa  109  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  30.03 
 
 		 335 aa  109  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1979  2-dehydropantoate 2-reductase  29.18 
 
 		 313 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0057409  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  32.1 
 
 		 307 aa  109  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  28.04 
 
 		 312 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2981  2-dehydropantoate 2-reductase  28.26 
 
 		 319 aa  108  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  32.7 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  31.07 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  29.15 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  31.07 
 
 		 315 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  29.68 
 
 		 316 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3118  2-dehydropantoate 2-reductase  30.98 
 
 		 312 aa  102  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  28.79 
 
 		 329 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  29.68 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  29.28 
 
 		 302 aa  99.4  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  31.08 
 
 		 300 aa  99  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  31.86 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  30.74 
 
 		 341 aa  97.4  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3162  2-dehydropantoate 2-reductase  29.75 
 
 		 312 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  28.8 
 
 		 316 aa  96.7  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  31.07 
 
 		 323 aa  96.3  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  30.48 
 
 		 311 aa  96.3  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  31.39 
 
 		 316 aa  96.3  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  29.94 
 
 		 302 aa  95.9  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2936  2-dehydropantoate 2-reductase  29.14 
 
 		 312 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178942 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0552  2-dehydropantoate 2-reductase  28.53 
 
 		 319 aa  95.5  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 		 319 aa  94.4  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  28.66 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  28.67 
 
 		 309 aa  94  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  28.79 
 
 		 314 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>