More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6152 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1950  2-dehydropantoate 2-reductase  98.8 
 
 		 332 aa  647    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0818482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6152  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 332 aa  653    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1927  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 332 aa  653    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193569  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5228  2-dehydropantoate 2-reductase  97.29 
 
 		 332 aa  617  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1915  2-dehydropantoate 2-reductase  93.07 
 
 		 332 aa  584  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1345  2-dehydropantoate 2-reductase  91.27 
 
 		 332 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162184  normal  0.0787128 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1845  2-dehydropantoate 2-reductase  91.27 
 
 		 332 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.995272  normal  0.0110748 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2487  2-dehydropantoate 2-reductase  74.38 
 
 		 329 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3341  2-dehydropantoate 2-reductase  74.07 
 
 		 324 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1471  2-dehydropantoate 2-reductase  74.38 
 
 		 329 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1238  2-dehydropantoate 2-reductase  74.38 
 
 		 329 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1964  2-dehydropantoate 2-reductase  74.38 
 
 		 329 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.734659  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2115  2-dehydropantoate 2-reductase  75.31 
 
 		 329 aa  461  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2371  2-dehydropantoate 2-reductase  73.78 
 
 		 333 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2330  2-dehydropantoate 2-reductase  72.89 
 
 		 337 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.787912  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  53.54 
 
 		 331 aa  317  1e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3234  2-dehydropantoate 2-reductase  52.44 
 
 		 325 aa  315  6e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3558  2-dehydropantoate 2-reductase  51.83 
 
 		 325 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  51.83 
 
 		 325 aa  311  7.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  51.54 
 
 		 326 aa  308  9e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  51.23 
 
 		 326 aa  307  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  50.93 
 
 		 326 aa  302  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  46.3 
 
 		 327 aa  293  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5382  2-dehydropantoate 2-reductase  48.15 
 
 		 327 aa  291  9e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324063  normal  0.227406 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1224  2-dehydropantoate 2-reductase  47.84 
 
 		 327 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318793 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1796  2-dehydropantoate 2-reductase  47.08 
 
 		 341 aa  288  8e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275897 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0135  2-dehydropantoate 2-reductase  49.03 
 
 		 324 aa  288  1e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1724  2-dehydropantoate 2-reductase  44.75 
 
 		 331 aa  276  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0197  2-dehydropantoate 2-reductase  46.43 
 
 		 324 aa  273  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0234  2-dehydropantoate 2-reductase  48.05 
 
 		 325 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0153  2-dehydropantoate 2-reductase  48.1 
 
 		 351 aa  263  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  44.2 
 
 		 324 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  44.44 
 
 		 324 aa  249  5e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  40.31 
 
 		 353 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  42.45 
 
 		 335 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  42.59 
 
 		 337 aa  246  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  40.88 
 
 		 325 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  40.43 
 
 		 346 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  43.93 
 
 		 323 aa  239  4e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  40.49 
 
 		 324 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  41.46 
 
 		 333 aa  237  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  40.18 
 
 		 324 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  39.75 
 
 		 332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  40.43 
 
 		 325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  40.62 
 
 		 325 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  41.46 
 
 		 336 aa  232  6e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  40.31 
 
 		 325 aa  228  8e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  40.63 
 
 		 326 aa  228  8e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  41.4 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  38.8 
 
 		 332 aa  227  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  39.02 
 
 		 326 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  40.25 
 
 		 342 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  39.13 
 
 		 336 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  41.27 
 
 		 335 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  41.27 
 
 		 335 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  40.95 
 
 		 335 aa  219  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  38.31 
 
 		 339 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00418767  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4110  2-dehydropantoate 2-reductase  41.43 
 
 		 336 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal  0.957383 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1558  2-dehydropantoate 2-reductase  42.22 
 
 		 447 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1818  2-dehydropantoate 2-reductase  33.76 
 
 		 327 aa  192  5e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45590  hypothetical protein  36.51 
 
 		 359 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1471  2-dehydropantoate 2-reductase  34.58 
 
 		 334 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3888  2-dehydropantoate 2-reductase  37.85 
 
 		 324 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0769062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3657  ketopantoate reductase ApbA/PanE  47.75 
 
 		 223 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7671 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03720  2-dehydropantoate 2-reductase  32.18 
 
 		 314 aa  116  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2699  2-dehydropantoate 2-reductase  36.07 
 
 		 322 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  30 
 
 		 329 aa  106  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  31.83 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  31.83 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  29.9 
 
 		 315 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  28.66 
 
 		 316 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 302 aa  93.6  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  30.45 
 
 		 315 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  29.56 
 
 		 316 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1422  2-dehydropantoate 2-reductase  27.69 
 
 		 322 aa  92.8  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2858  2-dehydropantoate 2-reductase  27.69 
 
 		 322 aa  92.4  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  29.36 
 
 		 319 aa  92.4  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  29.05 
 
 		 319 aa  92.4  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1979  2-dehydropantoate 2-reductase  27.47 
 
 		 313 aa  90.9  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0057409  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  29.06 
 
 		 312 aa  90.5  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  30.41 
 
 		 315 aa  89.7  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  27.24 
 
 		 309 aa  89  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  30.55 
 
 		 341 aa  88.6  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  28.88 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2991  2-dehydropantoate 2-reductase  31.19 
 
 		 337 aa  87.8  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.1296  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  29.56 
 
 		 307 aa  87  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1688  2-dehydropantoate 2-reductase  28.12 
 
 		 351 aa  86.3  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.754321  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  31.83 
 
 		 316 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  28.94 
 
 		 316 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  27.49 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  28.25 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  26.59 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  27.81 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  28.4 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  29.19 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2219  2-dehydropantoate 2-reductase  34.36 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205933  normal  0.043559 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  29.47 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  28.66 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  28.75 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  28.66 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>