More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1979 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1979  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 313 aa  641    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0057409  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2981  2-dehydropantoate 2-reductase  54.07 
 
 		 319 aa  340  2e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1293  2-dehydropantoate 2-reductase  50 
 
 		 312 aa  324  1e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.519384  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2325  2-dehydropantoate 2-reductase  43.77 
 
 		 315 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.79299  hitchhiker  0.0000420215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1926  2-dehydropantoate 2-reductase  44 
 
 		 315 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000062548  hitchhiker  0.000000000000153659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2276  2-dehydropantoate 2-reductase  42.95 
 
 		 323 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00122842  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3445  2-dehydropantoate 2-reductase  44.11 
 
 		 349 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00422056  hitchhiker  0.00254132 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2074  2-dehydropantoate 2-reductase  42.81 
 
 		 323 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.136591  normal  0.0111283 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4006  2-dehydropantoate 2-reductase  44.15 
 
 		 317 aa  239  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143749  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1766  2-dehydropantoate 2-reductase  43.43 
 
 		 315 aa  238  9e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.411691  hitchhiker  0.000000000967397 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41900  2-dehydropantoate 2-reductase  41.99 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  40.59 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  41.56 
 
 		 312 aa  221  9e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  40.39 
 
 		 302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2549  2-dehydropantoate 2-reductase  41.55 
 
 		 317 aa  220  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0215033  hitchhiker  0.00000000817655 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3556  2-dehydropantoate 2-reductase  41.41 
 
 		 315 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  38.56 
 
 		 305 aa  210  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  35.35 
 
 		 311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  35.69 
 
 		 312 aa  178  8e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0552  2-dehydropantoate 2-reductase  34.1 
 
 		 319 aa  168  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39578  predicted protein  29.76 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  30.28 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  30 
 
 		 329 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0294  2-dehydropantoate 2-reductase  30.13 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.220777  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02389  ketopantoate reductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14497)  30.36 
 
 		 426 aa  116  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  26.06 
 
 		 301 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  31.68 
 
 		 315 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3234  2-dehydropantoate 2-reductase  31 
 
 		 325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  30.99 
 
 		 310 aa  110  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  29.18 
 
 		 325 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3888  2-dehydropantoate 2-reductase  29.14 
 
 		 324 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0769062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  26.91 
 
 		 333 aa  106  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0163  2-dehydropantoate 2-reductase  28.43 
 
 		 306 aa  106  6e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  26.14 
 
 		 300 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  25.72 
 
 		 299 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2605  2-dehydropantoate 2-reductase  30.94 
 
 		 314 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3558  2-dehydropantoate 2-reductase  30.4 
 
 		 325 aa  105  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  28.21 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5912  2-dehydropantoate 2-reductase  32.51 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1855  2-dehydropantoate 2-reductase  28.16 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  26.96 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0186  2-dehydropantoate 2-reductase  27.1 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0707  2-dehydropantoate 2-reductase  31.96 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102156  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  28.11 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  25.8 
 
 		 298 aa  103  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  28.11 
 
 		 307 aa  103  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  27.81 
 
 		 331 aa  102  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  28.3 
 
 		 316 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  26.95 
 
 		 325 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  30.87 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2500  2-dehydropantoate 2-reductase  29.84 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.637616 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2629  2-dehydropantoate 2-reductase  30.7 
 
 		 314 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  27.18 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  25.89 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2858  2-dehydropantoate 2-reductase  28.66 
 
 		 322 aa  99.4  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  26.62 
 
 		 319 aa  99  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0095  2-dehydropantoate 2-reductase  30.67 
 
 		 318 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0453394  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2482  2-dehydropantoate 2-reductase  30.67 
 
 		 318 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.386001  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1422  2-dehydropantoate 2-reductase  28.34 
 
 		 322 aa  98.2  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  28.98 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0889  2-dehydropantoate 2-reductase  30.67 
 
 		 318 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.298016  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  26.86 
 
 		 301 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  27.21 
 
 		 312 aa  96.3  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  27.52 
 
 		 324 aa  96.3  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0348  2-dehydropantoate 2-reductase  30.67 
 
 		 313 aa  95.9  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  24.85 
 
 		 337 aa  96.3  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0647  2-dehydropantoate 2-reductase  30.35 
 
 		 318 aa  95.9  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00836625  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  29.09 
 
 		 326 aa  95.9  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  29.08 
 
 		 315 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3545  2-dehydropantoate 2-reductase  29.08 
 
 		 315 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0021  2-dehydropantoate 2-reductase  25.8 
 
 		 306 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4822  2-dehydropantoate 2-reductase  29.08 
 
 		 315 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3341  2-dehydropantoate 2-reductase  29.87 
 
 		 324 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  25.91 
 
 		 335 aa  94  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2487  2-dehydropantoate 2-reductase  28.98 
 
 		 329 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2371  2-dehydropantoate 2-reductase  29.56 
 
 		 333 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1964  2-dehydropantoate 2-reductase  28.98 
 
 		 329 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.734659  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1471  2-dehydropantoate 2-reductase  28.98 
 
 		 329 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1238  2-dehydropantoate 2-reductase  28.98 
 
 		 329 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  28.94 
 
 		 316 aa  93.2  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  25.24 
 
 		 299 aa  92.8  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1970  2-dehydropantoate 2-reductase  28.92 
 
 		 314 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181266  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2581  2-dehydropantoate 2-reductase  28.92 
 
 		 314 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.331281  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1051  2-dehydropantoate 2-reductase  30.67 
 
 		 310 aa  92.4  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  27.33 
 
 		 326 aa  92.4  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08494  conserved hypothetical protein  25.79 
 
 		 389 aa  92  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0882  2-dehydropantoate 2-reductase  27.76 
 
 		 315 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.277426 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  28.3 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  28.3 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  27.05 
 
 		 312 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.399113 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 		 313 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  26.52 
 
 		 345 aa  91.7  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  26.06 
 
 		 332 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  25.3 
 
 		 335 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  27.27 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3781  2-dehydropantoate 2-reductase  25.9 
 
 		 312 aa  90.9  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0449567 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0018  2-dehydropantoate 2-reductase  25.24 
 
 		 306 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0892  2-dehydropantoate 2-reductase  30.35 
 
 		 318 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1796  2-dehydropantoate 2-reductase  25.94 
 
 		 341 aa  90.5  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275897 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  25.57 
 
 		 309 aa  90.5  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>