More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2074 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2074  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
323 aa  658    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.136591  normal  0.0111283 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2276  2-dehydropantoate 2-reductase  85.45 
 
 
323 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00122842  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4006  2-dehydropantoate 2-reductase  68.69 
 
 
317 aa  424  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143749  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1766  2-dehydropantoate 2-reductase  67.09 
 
 
315 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.411691  hitchhiker  0.000000000967397 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2325  2-dehydropantoate 2-reductase  66.04 
 
 
315 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.79299  hitchhiker  0.0000420215 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41900  2-dehydropantoate 2-reductase  64.42 
 
 
315 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1926  2-dehydropantoate 2-reductase  66.25 
 
 
315 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000062548  hitchhiker  0.000000000000153659 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3445  2-dehydropantoate 2-reductase  65.83 
 
 
349 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00422056  hitchhiker  0.00254132 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3556  2-dehydropantoate 2-reductase  64.43 
 
 
315 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2549  2-dehydropantoate 2-reductase  64.72 
 
 
317 aa  371  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0215033  hitchhiker  0.00000000817655 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1979  2-dehydropantoate 2-reductase  44.16 
 
 
313 aa  262  8e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0057409  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1293  2-dehydropantoate 2-reductase  41.08 
 
 
312 aa  249  6e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.519384  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2981  2-dehydropantoate 2-reductase  41.35 
 
 
319 aa  244  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.3758  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  41.53 
 
 
302 aa  218  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  40 
 
 
302 aa  216  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  37.22 
 
 
305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  40.91 
 
 
312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  36.18 
 
 
311 aa  187  2e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  32.68 
 
 
312 aa  176  5e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0552  2-dehydropantoate 2-reductase  35.71 
 
 
319 aa  160  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39578  predicted protein  29.31 
 
 
414 aa  149  7e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  30.23 
 
 
345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  32.4 
 
 
311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  27.89 
 
 
307 aa  112  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02389  ketopantoate reductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14497)  26.91 
 
 
426 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  27.89 
 
 
307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  26.81 
 
 
301 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  32.18 
 
 
315 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  26.71 
 
 
295 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  28.43 
 
 
313 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 
318 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  25.97 
 
 
299 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08494  conserved hypothetical protein  28.48 
 
 
389 aa  102  8e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  30.1 
 
 
319 aa  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34207  2-dehydropantoate 2-reductase (Ketopantoate reductase) (KPA reductase) (KPR)  23.33 
 
 
351 aa  100  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391649  normal  0.984982 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  28.34 
 
 
317 aa  100  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 
298 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  29.77 
 
 
319 aa  99.4  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  27.33 
 
 
300 aa  99  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08718  2-dehydropantoate 2-reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02620)  23.82 
 
 
711 aa  97.4  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  26.36 
 
 
337 aa  97.4  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  29.64 
 
 
299 aa  97.4  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  25.55 
 
 
335 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 
326 aa  96.7  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  24.84 
 
 
335 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  24.84 
 
 
335 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  24.85 
 
 
335 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  29.33 
 
 
325 aa  96.3  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  31.76 
 
 
296 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0882  2-dehydropantoate 2-reductase  30.03 
 
 
315 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.277426 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3781  2-dehydropantoate 2-reductase  28.62 
 
 
312 aa  93.2  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0449567 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  29.29 
 
 
324 aa  92.8  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  28.28 
 
 
315 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  26.67 
 
 
336 aa  92.4  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  26.67 
 
 
314 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10126  2-dehydropantoate 2-reductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00740)  24.41 
 
 
367 aa  90.9  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00458095  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  29.84 
 
 
312 aa  91.3  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  28.71 
 
 
305 aa  91.7  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  26.43 
 
 
329 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  26.4 
 
 
333 aa  91.3  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  27.48 
 
 
310 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  29.01 
 
 
315 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  29.19 
 
 
327 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  26.89 
 
 
309 aa  89.4  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  25.93 
 
 
325 aa  89.4  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0021  2-dehydropantoate 2-reductase  26.67 
 
 
306 aa  89.4  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2967  2-dehydropantoate 2-reductase  30.58 
 
 
311 aa  88.6  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4110  2-dehydropantoate 2-reductase  27.24 
 
 
336 aa  88.6  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal  0.957383 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4423  2-dehydropantoate 2-reductase  29.27 
 
 
311 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.852681 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  25.42 
 
 
353 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3545  2-dehydropantoate 2-reductase  28.67 
 
 
315 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  25.08 
 
 
332 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4822  2-dehydropantoate 2-reductase  28.67 
 
 
315 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0294  2-dehydropantoate 2-reductase  25.24 
 
 
307 aa  87  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.220777  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  26.74 
 
 
306 aa  87  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  27.97 
 
 
315 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  25.75 
 
 
346 aa  86.3  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0186  2-dehydropantoate 2-reductase  26.21 
 
 
306 aa  85.9  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01220  conserved hypothetical protein  26.28 
 
 
295 aa  85.9  8e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  24.51 
 
 
307 aa  85.5  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4203  2-dehydropantoate 2-reductase  27.93 
 
 
315 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.379422  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  23.81 
 
 
311 aa  84.3  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  25.08 
 
 
325 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  25.08 
 
 
335 aa  84.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  29.53 
 
 
324 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  25.08 
 
 
325 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0743  ketopantoate reductase ApbA/PanE  28.32 
 
 
311 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786977  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0729  2-dehydropantoate 2-reductase  28.08 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.691763  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4927  2-dehydropantoate 2-reductase  28.71 
 
 
306 aa  84  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332007  normal  0.934837 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  27.95 
 
 
325 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0163  2-dehydropantoate 2-reductase  27.45 
 
 
306 aa  83.2  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0016  2-dehydropantoate 2-reductase  27.16 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2482  2-dehydropantoate 2-reductase  28.97 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.386001  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0889  2-dehydropantoate 2-reductase  28.97 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.298016  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0095  2-dehydropantoate 2-reductase  28.97 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0453394  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0018  2-dehydropantoate 2-reductase  27.16 
 
 
306 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0647  2-dehydropantoate 2-reductase  28.66 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00836625  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0348  2-dehydropantoate 2-reductase  29.62 
 
 
313 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  27.27 
 
 
323 aa  80.9  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1796  2-dehydropantoate 2-reductase  27.86 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.275897 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>