More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3569 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 296 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  57.63 
 
 		 301 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  57.14 
 
 		 299 aa  332  6e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  60.68 
 
 		 345 aa  322  7e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  57 
 
 		 300 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  59.52 
 
 		 298 aa  318  5e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  56.61 
 
 		 295 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  58.64 
 
 		 319 aa  311  1e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  58.64 
 
 		 319 aa  310  2e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  58 
 
 		 317 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  57.77 
 
 		 299 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  55.81 
 
 		 305 aa  304  9.000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  56.71 
 
 		 313 aa  294  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  59.26 
 
 		 325 aa  294  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  50 
 
 		 301 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  49.66 
 
 		 301 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  38.82 
 
 		 311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  39.09 
 
 		 316 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  39.09 
 
 		 316 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  39.54 
 
 		 316 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  38.69 
 
 		 316 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  38.69 
 
 		 316 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  36.33 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02678  2-dehydropantoate 2-reductase  33.75 
 
 		 339 aa  151  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.321227  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  39.94 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  38.49 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  36.3 
 
 		 309 aa  149  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  38.91 
 
 		 335 aa  148  9e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  37.42 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  37.82 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  38.19 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  33.81 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  36.51 
 
 		 315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  36.51 
 
 		 315 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  38.08 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  34.67 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  31.77 
 
 		 302 aa  132  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  38.61 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  31.02 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  33.67 
 
 		 296 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  31.02 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  31.65 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  31.02 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  33.12 
 
 		 329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  39.29 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  30.03 
 
 		 305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2951  2-dehydropantoate 2-reductase  30.69 
 
 		 305 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  34.38 
 
 		 306 aa  125  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1100  2-dehydropantoate 2-reductase  38.94 
 
 		 302 aa  125  6e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0140808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  31.23 
 
 		 302 aa  125  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  30.1 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  33.21 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4737  2-dehydropantoate 2-reductase  35.53 
 
 		 330 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03188  2-dehydropantoate 2-reductase  33.85 
 
 		 338 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  33.21 
 
 		 307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002696  2-dehydropantoate 2-reductase  28.33 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  31.46 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  32.28 
 
 		 315 aa  116  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  33.22 
 
 		 311 aa  116  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  31.58 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0707  2-dehydropantoate 2-reductase  35.71 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102156  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  32.18 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  33.75 
 
 		 326 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  29.33 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0708  2-dehydropantoate 2-reductase  34.09 
 
 		 311 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  31.82 
 
 		 314 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1115  2-dehydropantoate 2-reductase  31.49 
 
 		 309 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.275273  normal  0.917906 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4708  2-dehydropantoate 2-reductase  32.88 
 
 		 289 aa  112  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.392544 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2518  2-dehydropantoate 2-reductase  27.12 
 
 		 311 aa  112  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254196  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2470  2-dehydropantoate 2-reductase  27.12 
 
 		 311 aa  112  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3726  2-dehydropantoate 2-reductase  32.36 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3603  2-dehydropantoate 2-reductase  33.77 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  33.44 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  31.13 
 
 		 331 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3535  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 		 311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40675  hitchhiker  0.0000949952 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  33.12 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  24.83 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0377  2-dehydropantoate 2-reductase  26.77 
 
 		 316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  32.79 
 
 		 310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  29.91 
 
 		 332 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  29.55 
 
 		 312 aa  109  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  28.79 
 
 		 326 aa  108  8.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2074  2-dehydropantoate 2-reductase  32.09 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.136591  normal  0.0111283 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0383  2-dehydropantoate 2-reductase  33.11 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1293  2-dehydropantoate 2-reductase  24.42 
 
 		 312 aa  108  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.519384  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1861  2-dehydropantoate 2-reductase  31.16 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2865  2-dehydropantoate 2-reductase  30.59 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  30.5 
 
 		 333 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  29.41 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1477  ketopantoate reductase  28.48 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  29.41 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  32.33 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  28.53 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  33.12 
 
 		 325 aa  107  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45590  hypothetical protein  28.66 
 
 		 359 aa  107  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  29.7 
 
 		 307 aa  106  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  28 
 
 		 311 aa  106  5e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1979  2-dehydropantoate 2-reductase  27.74 
 
 		 313 aa  105  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0057409  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3558  2-dehydropantoate 2-reductase  31.01 
 
 		 325 aa  105  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2858  2-dehydropantoate 2-reductase  27.3 
 
 		 322 aa  105  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>