More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1998 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
310 aa  607  9.999999999999999e-173  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  66.01 
 
 
302 aa  352  4e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0296  2-dehydropantoate 2-reductase  54.87 
 
 
309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.961677  normal  0.11487 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  55.37 
 
 
294 aa  263  2e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1100  2-dehydropantoate 2-reductase  57.28 
 
 
302 aa  257  2e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0140808  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  36.66 
 
 
309 aa  155  8e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  36.48 
 
 
299 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  35.83 
 
 
301 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  29.77 
 
 
311 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  34.63 
 
 
299 aa  139  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  35.46 
 
 
300 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  36.22 
 
 
314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  33.77 
 
 
298 aa  132  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  34.12 
 
 
307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  35.56 
 
 
315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  34.08 
 
 
345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  36.66 
 
 
319 aa  129  6e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1009  2-dehydropantoate 2-reductase  32.53 
 
 
307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  36.59 
 
 
319 aa  127  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  33.75 
 
 
310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0839  2-dehydropantoate 2-reductase  35.14 
 
 
307 aa  126  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0193  2-dehydropantoate 2-reductase  29.41 
 
 
285 aa  125  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0380974  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  35.39 
 
 
317 aa  124  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  35.53 
 
 
313 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 
307 aa  123  4e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  36.94 
 
 
316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  35.02 
 
 
305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  36.68 
 
 
316 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  36.94 
 
 
316 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  36.68 
 
 
316 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  36.91 
 
 
307 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0647  2-dehydropantoate 2-reductase  36.1 
 
 
318 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00836625  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0348  2-dehydropantoate 2-reductase  36.1 
 
 
313 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0095  2-dehydropantoate 2-reductase  36.1 
 
 
318 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0453394  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2482  2-dehydropantoate 2-reductase  36.1 
 
 
318 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.386001  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0889  2-dehydropantoate 2-reductase  36.1 
 
 
318 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.298016  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  32.79 
 
 
313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  32.36 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  27.38 
 
 
318 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  33.45 
 
 
306 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  34.63 
 
 
312 aa  116  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2262  2-dehydropantoate 2-reductase  29.32 
 
 
299 aa  115  6.9999999999999995e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  36.81 
 
 
296 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  32.79 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  33.44 
 
 
301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  33.44 
 
 
301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  35.09 
 
 
316 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1115  2-dehydropantoate 2-reductase  32.81 
 
 
309 aa  114  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.275273  normal  0.917906 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  35.56 
 
 
341 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2605  2-dehydropantoate 2-reductase  34.49 
 
 
314 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0707  2-dehydropantoate 2-reductase  35.78 
 
 
310 aa  112  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102156  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1051  2-dehydropantoate 2-reductase  35.67 
 
 
310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0892  2-dehydropantoate 2-reductase  36.1 
 
 
318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2874  2-dehydropantoate 2-reductase  34.71 
 
 
336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3603  2-dehydropantoate 2-reductase  32.2 
 
 
311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1881  2-dehydropantoate 2-reductase  34.83 
 
 
306 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  30.63 
 
 
316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  35.11 
 
 
316 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02768  2-dehydropantoate 2-reductase  36 
 
 
313 aa  109  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  31.07 
 
 
306 aa  109  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0791  2-dehydropantoate 2-reductase  31.73 
 
 
303 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  33.66 
 
 
294 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2500  2-dehydropantoate 2-reductase  34.81 
 
 
314 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.637616 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2003  2-dehydropantoate 2-reductase  33.44 
 
 
280 aa  107  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3080  2-dehydropantoate 2-reductase  31.23 
 
 
306 aa  106  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.850912  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  31.09 
 
 
296 aa  107  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  30.58 
 
 
333 aa  106  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  34.69 
 
 
335 aa  106  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  27.56 
 
 
309 aa  106  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  27.56 
 
 
309 aa  106  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0383  2-dehydropantoate 2-reductase  35.81 
 
 
280 aa  105  8e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1362  2-dehydropantoate 2-reductase  28.91 
 
 
294 aa  105  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1351  2-dehydropantoate 2-reductase  26.95 
 
 
307 aa  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3535  2-dehydropantoate 2-reductase  30.91 
 
 
311 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40675  hitchhiker  0.0000949952 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  28.84 
 
 
329 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2889  2-dehydropantoate 2-reductase  30.23 
 
 
302 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5912  2-dehydropantoate 2-reductase  33.86 
 
 
314 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  34.91 
 
 
323 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2629  2-dehydropantoate 2-reductase  33.02 
 
 
314 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57160  2-dehydropantoate 2-reductase  32.35 
 
 
303 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0462  2-dehydropantoate 2-reductase  32.9 
 
 
303 aa  104  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002696  2-dehydropantoate 2-reductase  28.3 
 
 
296 aa  104  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 
315 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3817  2-dehydropantoate 2-reductase  32.13 
 
 
327 aa  103  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3726  2-dehydropantoate 2-reductase  31.17 
 
 
312 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0708  2-dehydropantoate 2-reductase  30.96 
 
 
311 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  33.02 
 
 
315 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  28.62 
 
 
305 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3248  2-dehydropantoate 2-reductase  29.84 
 
 
303 aa  103  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3106  2-dehydropantoate 2-reductase  29.84 
 
 
303 aa  103  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3068  2-dehydropantoate 2-reductase  29.84 
 
 
303 aa  103  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1519  2-dehydropantoate 2-reductase  25.97 
 
 
309 aa  103  5e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.982841  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  29.17 
 
 
302 aa  102  8e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  28.62 
 
 
305 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1035  2-dehydropantoate 2-reductase  29.28 
 
 
302 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.324105  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1970  2-dehydropantoate 2-reductase  34.18 
 
 
314 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181266  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1855  2-dehydropantoate 2-reductase  26.28 
 
 
316 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2581  2-dehydropantoate 2-reductase  34.18 
 
 
314 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.331281  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1786  2-dehydropantoate 2-reductase  28.39 
 
 
278 aa  101  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.43842 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0809  2-dehydropantoate 2-reductase  30.67 
 
 
326 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>