More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4016 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
317 aa  630  1e-180  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  84.77 
 
 
313 aa  499  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  73.75 
 
 
298 aa  432  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  70.67 
 
 
295 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  70.43 
 
 
299 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  66.67 
 
 
345 aa  393  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  64.38 
 
 
305 aa  366  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  55.81 
 
 
301 aa  328  6e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  62.79 
 
 
319 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  63.12 
 
 
319 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  62.79 
 
 
325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  55.15 
 
 
299 aa  316  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  54.82 
 
 
300 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  55.15 
 
 
301 aa  299  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  54.82 
 
 
301 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  57.29 
 
 
296 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  41.45 
 
 
311 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  37.62 
 
 
316 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  37.62 
 
 
316 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  37.38 
 
 
316 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  37.38 
 
 
316 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  37.05 
 
 
316 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  35.06 
 
 
341 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  34.21 
 
 
313 aa  152  5e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  37.38 
 
 
316 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 
307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  35.35 
 
 
335 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  35.64 
 
 
315 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  34.63 
 
 
307 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  33.76 
 
 
314 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  31.8 
 
 
305 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  35.08 
 
 
315 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  31.48 
 
 
305 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02678  2-dehydropantoate 2-reductase  30.93 
 
 
339 aa  142  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.321227  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2951  2-dehydropantoate 2-reductase  31.8 
 
 
305 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  31.48 
 
 
305 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  35.31 
 
 
315 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  35.31 
 
 
323 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  31.15 
 
 
305 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0707  2-dehydropantoate 2-reductase  36.94 
 
 
310 aa  139  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102156  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  34.73 
 
 
312 aa  138  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  32.14 
 
 
329 aa  136  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  35.12 
 
 
307 aa  135  7.000000000000001e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  35.09 
 
 
306 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  32.37 
 
 
310 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  35.39 
 
 
310 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  31.8 
 
 
309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  32.78 
 
 
312 aa  129  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2605  2-dehydropantoate 2-reductase  33.86 
 
 
314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0889  2-dehydropantoate 2-reductase  36.48 
 
 
318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.298016  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2482  2-dehydropantoate 2-reductase  36.48 
 
 
318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.386001  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0095  2-dehydropantoate 2-reductase  36.48 
 
 
318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0453394  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0348  2-dehydropantoate 2-reductase  36.86 
 
 
313 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0647  2-dehydropantoate 2-reductase  36.16 
 
 
318 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00836625  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  33.44 
 
 
306 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  29.8 
 
 
296 aa  126  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  29.37 
 
 
309 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  30.36 
 
 
309 aa  123  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4708  2-dehydropantoate 2-reductase  33.56 
 
 
289 aa  123  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.392544 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0892  2-dehydropantoate 2-reductase  36.54 
 
 
318 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  28.8 
 
 
318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1051  2-dehydropantoate 2-reductase  36.54 
 
 
310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  29.77 
 
 
316 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03188  2-dehydropantoate 2-reductase  32.83 
 
 
338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  29.04 
 
 
309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1351  2-dehydropantoate 2-reductase  26.49 
 
 
307 aa  119  6e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5912  2-dehydropantoate 2-reductase  31.96 
 
 
314 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1970  2-dehydropantoate 2-reductase  34.17 
 
 
314 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181266  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2581  2-dehydropantoate 2-reductase  34.17 
 
 
314 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.331281  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2500  2-dehydropantoate 2-reductase  33.23 
 
 
314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.637616 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  29.06 
 
 
342 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  31.4 
 
 
336 aa  116  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03288  2-dehydropantoate 2-reductase  25.99 
 
 
296 aa  116  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1519  2-dehydropantoate 2-reductase  28.04 
 
 
309 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.982841  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  28.43 
 
 
302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  34.64 
 
 
302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3892  2-dehydropantoate 2-reductase  30.62 
 
 
310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  25.08 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2865  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 
311 aa  112  8.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2629  2-dehydropantoate 2-reductase  33.23 
 
 
314 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  31.37 
 
 
332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002696  2-dehydropantoate 2-reductase  25.57 
 
 
296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1115  2-dehydropantoate 2-reductase  31.33 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.275273  normal  0.917906 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  31.06 
 
 
332 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  34 
 
 
294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0377  2-dehydropantoate 2-reductase  25.08 
 
 
316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  27.76 
 
 
325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  26.67 
 
 
312 aa  109  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  29.11 
 
 
346 aa  110  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  29.07 
 
 
318 aa  109  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1698  2-dehydropantoate 2-reductase  25.96 
 
 
306 aa  109  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.656315  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4110  2-dehydropantoate 2-reductase  30.96 
 
 
336 aa  109  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal  0.957383 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  28.25 
 
 
324 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1477  ketopantoate reductase  27.48 
 
 
337 aa  109  7.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3780  2-dehydropantoate 2-reductase  32.09 
 
 
337 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.146686  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4857  2-dehydropantoate 2-reductase  32.09 
 
 
337 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  28.39 
 
 
353 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1224  2-dehydropantoate 2-reductase  31.13 
 
 
327 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.318793 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  28.83 
 
 
331 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2382  2-dehydropantoate 2-reductase  32.92 
 
 
314 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>