More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1546 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 312 aa  621  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  49.04 
 
 		 314 aa  276  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  50.17 
 
 		 315 aa  258  7e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  51.5 
 
 		 310 aa  258  9e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2629  2-dehydropantoate 2-reductase  50 
 
 		 314 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2500  2-dehydropantoate 2-reductase  50.99 
 
 		 314 aa  245  8e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.637616 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2605  2-dehydropantoate 2-reductase  49.35 
 
 		 314 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0889  2-dehydropantoate 2-reductase  51.32 
 
 		 318 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.298016  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0095  2-dehydropantoate 2-reductase  51.32 
 
 		 318 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0453394  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2482  2-dehydropantoate 2-reductase  51.32 
 
 		 318 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.386001  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0647  2-dehydropantoate 2-reductase  50.99 
 
 		 318 aa  238  9e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00836625  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0348  2-dehydropantoate 2-reductase  50.99 
 
 		 313 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0892  2-dehydropantoate 2-reductase  51.66 
 
 		 318 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5912  2-dehydropantoate 2-reductase  49.35 
 
 		 314 aa  235  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1051  2-dehydropantoate 2-reductase  51.32 
 
 		 310 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0707  2-dehydropantoate 2-reductase  50.17 
 
 		 310 aa  232  5e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102156  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1970  2-dehydropantoate 2-reductase  48.04 
 
 		 314 aa  231  9e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181266  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2581  2-dehydropantoate 2-reductase  48.04 
 
 		 314 aa  231  9e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.331281  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1677  2-dehydropantoate 2-reductase  43.73 
 
 		 319 aa  192  4e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1893  2-dehydropantoate 2-reductase  38.31 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00746651  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1855  2-dehydropantoate 2-reductase  30.79 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  33.22 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  32.89 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  33.22 
 
 		 305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  33.22 
 
 		 305 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2951  2-dehydropantoate 2-reductase  32.89 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1351  2-dehydropantoate 2-reductase  30.49 
 
 		 307 aa  133  5e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  34.2 
 
 		 341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  27.76 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  27.42 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  31.72 
 
 		 335 aa  126  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  34 
 
 		 295 aa  125  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  32.78 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  33.22 
 
 		 316 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  32.46 
 
 		 313 aa  122  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  31.58 
 
 		 302 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  27.54 
 
 		 307 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  32.57 
 
 		 316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  34.22 
 
 		 323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1477  ketopantoate reductase  29.51 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  32.57 
 
 		 316 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2022  2-dehydropantoate 2-reductase  27.78 
 
 		 310 aa  119  7.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1445  2-dehydropantoate 2-reductase  30.03 
 
 		 312 aa  119  9e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.219462  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  32.78 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  31.86 
 
 		 309 aa  116  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  32.21 
 
 		 299 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  32.44 
 
 		 315 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  32.56 
 
 		 316 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  32.56 
 
 		 316 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1285  2-dehydropantoate 2-reductase  28.48 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  33.11 
 
 		 312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  31.49 
 
 		 319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  32.24 
 
 		 316 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  32.34 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2470  2-dehydropantoate 2-reductase  26.64 
 
 		 311 aa  109  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2518  2-dehydropantoate 2-reductase  26.64 
 
 		 311 aa  109  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254196  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  30.54 
 
 		 298 aa  109  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  31.77 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  31.12 
 
 		 335 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  32.67 
 
 		 299 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  30.56 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  33.79 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  30.77 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  31.42 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  29.77 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  30.51 
 
 		 335 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  30.51 
 
 		 335 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  29.43 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  30.33 
 
 		 311 aa  102  7e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  29.13 
 
 		 336 aa  102  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  31.77 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  31.72 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  29.52 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  31.49 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  30.12 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  31.1 
 
 		 313 aa  100  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  30.82 
 
 		 332 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 329 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  26.13 
 
 		 318 aa  99.8  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  28.62 
 
 		 307 aa  99  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  28.67 
 
 		 306 aa  97.1  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  29.39 
 
 		 335 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1100  2-dehydropantoate 2-reductase  33.67 
 
 		 302 aa  96.3  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0140808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  29.47 
 
 		 305 aa  96.7  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  30.92 
 
 		 345 aa  96.7  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  30.7 
 
 		 312 aa  96.7  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1979  2-dehydropantoate 2-reductase  27.21 
 
 		 313 aa  96.3  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0057409  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  30.43 
 
 		 323 aa  95.9  9e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  33.1 
 
 		 315 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  30.65 
 
 		 324 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0349  2-dehydropantoate 2-reductase  24.68 
 
 		 321 aa  93.6  4e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  27.76 
 
 		 336 aa  93.6  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  26.63 
 
 		 311 aa  93.2  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  27.4 
 
 		 296 aa  93.2  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  29.12 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0839  2-dehydropantoate 2-reductase  26.94 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  26.73 
 
 		 333 aa  91.7  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  31.56 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  28.77 
 
 		 307 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2874  2-dehydropantoate 2-reductase  36.1 
 
 		 336 aa  91.7  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>