More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0707 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I0707  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
310 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102156  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0095  2-dehydropantoate 2-reductase  90 
 
 
318 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0453394  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0889  2-dehydropantoate 2-reductase  90 
 
 
318 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.298016  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2482  2-dehydropantoate 2-reductase  90 
 
 
318 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.386001  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0348  2-dehydropantoate 2-reductase  89.68 
 
 
313 aa  484  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0647  2-dehydropantoate 2-reductase  89.68 
 
 
318 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00836625  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0892  2-dehydropantoate 2-reductase  89.03 
 
 
318 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1051  2-dehydropantoate 2-reductase  89.35 
 
 
310 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  72.9 
 
 
310 aa  425  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2605  2-dehydropantoate 2-reductase  71.97 
 
 
314 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5912  2-dehydropantoate 2-reductase  70.7 
 
 
314 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2629  2-dehydropantoate 2-reductase  72.2 
 
 
314 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2500  2-dehydropantoate 2-reductase  70.93 
 
 
314 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.637616 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1970  2-dehydropantoate 2-reductase  72.12 
 
 
314 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181266  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2581  2-dehydropantoate 2-reductase  72.12 
 
 
314 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.331281  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  67.11 
 
 
315 aa  378  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  59.09 
 
 
314 aa  363  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  50.17 
 
 
312 aa  255  8e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1677  2-dehydropantoate 2-reductase  45.54 
 
 
319 aa  205  7e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  34.97 
 
 
309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  36.94 
 
 
305 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2951  2-dehydropantoate 2-reductase  38.22 
 
 
305 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  38.22 
 
 
305 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  36.94 
 
 
305 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  38.22 
 
 
305 aa  185  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  34.97 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  40.58 
 
 
316 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  40.58 
 
 
316 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1855  2-dehydropantoate 2-reductase  34.62 
 
 
316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1351  2-dehydropantoate 2-reductase  34.87 
 
 
307 aa  179  4e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  42.17 
 
 
341 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  42.3 
 
 
316 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  42.3 
 
 
316 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1477  ketopantoate reductase  35.95 
 
 
337 aa  175  9.999999999999999e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1893  2-dehydropantoate 2-reductase  40.59 
 
 
310 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00746651  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  40.58 
 
 
335 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  41.88 
 
 
316 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  40.91 
 
 
315 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1445  2-dehydropantoate 2-reductase  34.64 
 
 
312 aa  168  9e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.219462  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  40.58 
 
 
315 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  32.13 
 
 
307 aa  163  3e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  40.91 
 
 
316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  42.44 
 
 
323 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1285  2-dehydropantoate 2-reductase  32.47 
 
 
311 aa  152  7e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  36.56 
 
 
317 aa  151  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  37.26 
 
 
300 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2022  2-dehydropantoate 2-reductase  32.36 
 
 
310 aa  149  6e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  34.54 
 
 
299 aa  148  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  33.22 
 
 
329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2470  2-dehydropantoate 2-reductase  30.61 
 
 
311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2518  2-dehydropantoate 2-reductase  30.61 
 
 
311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254196  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  35.39 
 
 
295 aa  146  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  38.31 
 
 
312 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  36.86 
 
 
309 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  34.91 
 
 
313 aa  143  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  36.13 
 
 
306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  33.23 
 
 
301 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  33.55 
 
 
298 aa  133  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  33.94 
 
 
337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  36.22 
 
 
345 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  33.88 
 
 
302 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  32.48 
 
 
299 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  33.44 
 
 
309 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  36.31 
 
 
310 aa  124  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  35.06 
 
 
313 aa  122  7e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0377  2-dehydropantoate 2-reductase  25.94 
 
 
316 aa  120  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  29.81 
 
 
316 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  30.46 
 
 
333 aa  119  9e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  31.02 
 
 
336 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  32.79 
 
 
301 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  37.54 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  33.01 
 
 
301 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  35.22 
 
 
319 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1979  2-dehydropantoate 2-reductase  31.96 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0057409  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  35.76 
 
 
307 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1333  2-dehydropantoate 2-reductase  29.29 
 
 
322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.782684 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  33.54 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  34.81 
 
 
319 aa  113  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  35.64 
 
 
302 aa  112  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  31.19 
 
 
326 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  32.26 
 
 
302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  32.33 
 
 
332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  31.6 
 
 
331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  31.94 
 
 
305 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  33.84 
 
 
332 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  31.42 
 
 
335 aa  109  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3896  ketopantoate reductase ApbA/PanE  30.38 
 
 
337 aa  108  8.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  34.19 
 
 
325 aa  108  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  25.89 
 
 
318 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1100  2-dehydropantoate 2-reductase  36.57 
 
 
302 aa  108  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0140808  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0126  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 
318 aa  108  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00267865  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0349  2-dehydropantoate 2-reductase  27.16 
 
 
321 aa  108  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4530  2-dehydropantoate 2-reductase  33.43 
 
 
355 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.247613 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  30.63 
 
 
335 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  30.63 
 
 
335 aa  107  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0296  2-dehydropantoate 2-reductase  34.97 
 
 
309 aa  106  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.961677  normal  0.11487 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  32.48 
 
 
302 aa  106  4e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  32.42 
 
 
336 aa  106  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  30.37 
 
 
335 aa  106  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2858  2-dehydropantoate 2-reductase  27.01 
 
 
322 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>