More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0902 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
294 aa  582  1.0000000000000001e-165  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1100  2-dehydropantoate 2-reductase  64.98 
 
 
302 aa  313  1.9999999999999998e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0140808  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  59.8 
 
 
302 aa  306  3e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  55.37 
 
 
310 aa  287  2e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0296  2-dehydropantoate 2-reductase  57.19 
 
 
309 aa  270  2e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.961677  normal  0.11487 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  39.55 
 
 
309 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0193  2-dehydropantoate 2-reductase  32.98 
 
 
285 aa  156  3e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0380974  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  35.81 
 
 
313 aa  136  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  36.36 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  36.39 
 
 
315 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  35.29 
 
 
300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  35.45 
 
 
319 aa  129  6e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  35.12 
 
 
319 aa  126  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  33.44 
 
 
299 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  32.89 
 
 
325 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  34.75 
 
 
314 aa  122  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  36.04 
 
 
316 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  36.04 
 
 
316 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  37.13 
 
 
307 aa  121  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  34.1 
 
 
299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  32.89 
 
 
313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  36.6 
 
 
310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  32.46 
 
 
298 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  32.89 
 
 
345 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  33.22 
 
 
315 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  36.74 
 
 
323 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  36.3 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  34.49 
 
 
335 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  35.06 
 
 
316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  35.06 
 
 
316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0462  2-dehydropantoate 2-reductase  35.79 
 
 
303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2605  2-dehydropantoate 2-reductase  38.91 
 
 
314 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  33.99 
 
 
295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  28.76 
 
 
311 aa  116  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  33.79 
 
 
312 aa  115  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  35.42 
 
 
312 aa  115  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  34.95 
 
 
341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0383  2-dehydropantoate 2-reductase  36.82 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 
317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3116  2-dehydropantoate 2-reductase  31.65 
 
 
343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  27.48 
 
 
307 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  33.44 
 
 
315 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0707  2-dehydropantoate 2-reductase  36.77 
 
 
310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102156  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  34.42 
 
 
316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5912  2-dehydropantoate 2-reductase  35.81 
 
 
314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  36.16 
 
 
316 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1855  2-dehydropantoate 2-reductase  30.16 
 
 
316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  27.97 
 
 
318 aa  109  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1970  2-dehydropantoate 2-reductase  38.26 
 
 
314 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181266  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2581  2-dehydropantoate 2-reductase  38.26 
 
 
314 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.331281  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  32.73 
 
 
306 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  28.71 
 
 
309 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2500  2-dehydropantoate 2-reductase  38.1 
 
 
314 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.637616 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1009  2-dehydropantoate 2-reductase  32.33 
 
 
307 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2629  2-dehydropantoate 2-reductase  36.19 
 
 
314 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  38.72 
 
 
296 aa  106  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2147  2-dehydropantoate 2-reductase  32.73 
 
 
303 aa  106  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3603  2-dehydropantoate 2-reductase  30.63 
 
 
311 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  30.98 
 
 
296 aa  105  9e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3535  2-dehydropantoate 2-reductase  30.96 
 
 
311 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40675  hitchhiker  0.0000949952 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0708  2-dehydropantoate 2-reductase  30.37 
 
 
311 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0791  2-dehydropantoate 2-reductase  32.78 
 
 
303 aa  104  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0816  2-dehydropantoate 2-reductase  29.76 
 
 
320 aa  103  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  31 
 
 
302 aa  102  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2874  2-dehydropantoate 2-reductase  34.12 
 
 
336 aa  103  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4373  2-dehydropantoate 2-reductase  33.7 
 
 
305 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0586836 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  28.06 
 
 
309 aa  102  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0839  2-dehydropantoate 2-reductase  31.44 
 
 
307 aa  102  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  31.25 
 
 
307 aa  102  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  28.81 
 
 
302 aa  102  8e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2382  2-dehydropantoate 2-reductase  32.32 
 
 
314 aa  101  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1881  2-dehydropantoate 2-reductase  35.82 
 
 
306 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0768  2-dehydropantoate 2-reductase  31.78 
 
 
324 aa  101  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000150905  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57160  2-dehydropantoate 2-reductase  31.75 
 
 
303 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4968  2-dehydropantoate 2-reductase  32.75 
 
 
303 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3445  2-dehydropantoate 2-reductase  29 
 
 
310 aa  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137485  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1351  2-dehydropantoate 2-reductase  32.96 
 
 
305 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.144072 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2895  2-dehydropantoate 2-reductase  29.9 
 
 
306 aa  100  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0400281  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1095  2-dehydropantoate 2-reductase  29.05 
 
 
312 aa  99.8  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.82934  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0348  2-dehydropantoate 2-reductase  35.6 
 
 
313 aa  99  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2482  2-dehydropantoate 2-reductase  35.6 
 
 
318 aa  99  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.386001  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0889  2-dehydropantoate 2-reductase  35.6 
 
 
318 aa  99  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.298016  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0095  2-dehydropantoate 2-reductase  35.6 
 
 
318 aa  99  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0453394  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0647  2-dehydropantoate 2-reductase  35.6 
 
 
318 aa  99  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00836625  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  27.44 
 
 
316 aa  99  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1362  2-dehydropantoate 2-reductase  26.33 
 
 
294 aa  99  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  31.27 
 
 
301 aa  99  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3726  2-dehydropantoate 2-reductase  28.01 
 
 
312 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  31.27 
 
 
301 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  25.57 
 
 
305 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03288  2-dehydropantoate 2-reductase  28.09 
 
 
296 aa  96.3  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  25.57 
 
 
305 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0509  2-dehydropantoate 2-reductase  31.9 
 
 
303 aa  95.9  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.632143  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2262  2-dehydropantoate 2-reductase  28.72 
 
 
299 aa  95.9  7e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 
305 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.774811  normal  0.6393 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00373  2-dehydropantoate 2-reductase  32.26 
 
 
303 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1051  2-dehydropantoate 2-reductase  35.28 
 
 
310 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00377  hypothetical protein  32.26 
 
 
303 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  25.25 
 
 
305 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3208  2-dehydropantoate 2-reductase  31.9 
 
 
303 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000640508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>