More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1051 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1051  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
310 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0892  2-dehydropantoate 2-reductase  99.03 
 
 
318 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0647  2-dehydropantoate 2-reductase  98.39 
 
 
318 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00836625  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2482  2-dehydropantoate 2-reductase  98.71 
 
 
318 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.386001  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0095  2-dehydropantoate 2-reductase  98.71 
 
 
318 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0453394  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0889  2-dehydropantoate 2-reductase  98.71 
 
 
318 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.298016  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0348  2-dehydropantoate 2-reductase  98.39 
 
 
313 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0707  2-dehydropantoate 2-reductase  89.35 
 
 
310 aa  479  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102156  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  73.23 
 
 
310 aa  427  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2605  2-dehydropantoate 2-reductase  72.12 
 
 
314 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5912  2-dehydropantoate 2-reductase  70.51 
 
 
314 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2500  2-dehydropantoate 2-reductase  71.15 
 
 
314 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.637616 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2629  2-dehydropantoate 2-reductase  71.15 
 
 
314 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  65.79 
 
 
315 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1970  2-dehydropantoate 2-reductase  71.79 
 
 
314 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181266  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2581  2-dehydropantoate 2-reductase  71.79 
 
 
314 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.331281  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  57.28 
 
 
314 aa  351  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  51.32 
 
 
312 aa  255  7e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1677  2-dehydropantoate 2-reductase  43.46 
 
 
319 aa  194  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  37.9 
 
 
305 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  37.9 
 
 
305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2951  2-dehydropantoate 2-reductase  37.9 
 
 
305 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  37.9 
 
 
305 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  37.9 
 
 
305 aa  182  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  34.43 
 
 
309 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1893  2-dehydropantoate 2-reductase  39.6 
 
 
310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00746651  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1351  2-dehydropantoate 2-reductase  35.06 
 
 
307 aa  169  7e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  34.1 
 
 
309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1477  ketopantoate reductase  35.14 
 
 
337 aa  166  5e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1855  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 
316 aa  161  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  38.64 
 
 
316 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  38.64 
 
 
316 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  39.87 
 
 
341 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1445  2-dehydropantoate 2-reductase  34.64 
 
 
312 aa  157  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.219462  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  30.92 
 
 
307 aa  151  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  40.33 
 
 
316 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  40.33 
 
 
316 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  36.77 
 
 
335 aa  148  9e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  37.62 
 
 
316 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  37.99 
 
 
315 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1285  2-dehydropantoate 2-reductase  32.43 
 
 
311 aa  143  4e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  37.66 
 
 
315 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  39.61 
 
 
316 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  35.78 
 
 
300 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  34.3 
 
 
299 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  34.73 
 
 
306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  36.16 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  36.42 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2022  2-dehydropantoate 2-reductase  31.85 
 
 
310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  34.29 
 
 
295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  34.81 
 
 
313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  39.55 
 
 
323 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2518  2-dehydropantoate 2-reductase  28.8 
 
 
311 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254196  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2470  2-dehydropantoate 2-reductase  28.8 
 
 
311 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  31.07 
 
 
329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  36.94 
 
 
310 aa  122  6e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  32.28 
 
 
299 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  33.86 
 
 
301 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  33.55 
 
 
302 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  34.42 
 
 
312 aa  115  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  35.26 
 
 
313 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  31.65 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  32.42 
 
 
337 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  36.63 
 
 
302 aa  113  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0377  2-dehydropantoate 2-reductase  27.39 
 
 
316 aa  114  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  31.8 
 
 
326 aa  112  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  34.82 
 
 
345 aa  110  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0296  2-dehydropantoate 2-reductase  36.6 
 
 
309 aa  109  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.961677  normal  0.11487 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0126  2-dehydropantoate 2-reductase  26.37 
 
 
318 aa  109  5e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00267865  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  35.74 
 
 
307 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  30.82 
 
 
309 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  32.58 
 
 
301 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  28.01 
 
 
316 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  32.26 
 
 
301 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  29.18 
 
 
333 aa  105  8e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  32.04 
 
 
302 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  34.19 
 
 
319 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  32.81 
 
 
305 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1100  2-dehydropantoate 2-reductase  36.93 
 
 
302 aa  104  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0140808  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1979  2-dehydropantoate 2-reductase  30.67 
 
 
313 aa  104  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0057409  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  34.08 
 
 
319 aa  104  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1333  2-dehydropantoate 2-reductase  28.18 
 
 
322 aa  104  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.782684 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0349  2-dehydropantoate 2-reductase  27.49 
 
 
321 aa  103  5e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  35.92 
 
 
294 aa  102  9e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  31.35 
 
 
336 aa  102  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  34.63 
 
 
325 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1867  2-dehydropantoate 2-reductase  27.15 
 
 
318 aa  100  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  31.61 
 
 
305 aa  97.1  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  30.36 
 
 
331 aa  96.3  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0258  ketopantoate reductase  27.5 
 
 
331 aa  95.9  8e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.466283  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0729  2-dehydropantoate 2-reductase  32.17 
 
 
306 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.691763  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  30.33 
 
 
335 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  30.58 
 
 
332 aa  94  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  29.55 
 
 
311 aa  93.2  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  24.44 
 
 
318 aa  93.2  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  29.82 
 
 
335 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  29.82 
 
 
335 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  29.49 
 
 
336 aa  92.4  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2858  2-dehydropantoate 2-reductase  25.56 
 
 
322 aa  92.4  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  28.83 
 
 
335 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>