More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1677 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1677  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 319 aa  630  1e-179  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  47.16 
 
 		 315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  46.53 
 
 		 310 aa  229  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  43.38 
 
 		 314 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2629  2-dehydropantoate 2-reductase  46.58 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2605  2-dehydropantoate 2-reductase  45.63 
 
 		 314 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2500  2-dehydropantoate 2-reductase  45.95 
 
 		 314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.637616 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5912  2-dehydropantoate 2-reductase  43.65 
 
 		 314 aa  209  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  43.73 
 
 		 312 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0707  2-dehydropantoate 2-reductase  45.54 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102156  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2482  2-dehydropantoate 2-reductase  45.81 
 
 		 318 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.386001  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0889  2-dehydropantoate 2-reductase  45.81 
 
 		 318 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.298016  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0095  2-dehydropantoate 2-reductase  45.81 
 
 		 318 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0453394  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0647  2-dehydropantoate 2-reductase  45.48 
 
 		 318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00836625  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1970  2-dehydropantoate 2-reductase  45.28 
 
 		 314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181266  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2581  2-dehydropantoate 2-reductase  45.28 
 
 		 314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.331281  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0348  2-dehydropantoate 2-reductase  45.87 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0892  2-dehydropantoate 2-reductase  45.16 
 
 		 318 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1051  2-dehydropantoate 2-reductase  45.21 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1893  2-dehydropantoate 2-reductase  41.56 
 
 		 310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00746651  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  33.88 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  33.88 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2951  2-dehydropantoate 2-reductase  33.88 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  33.88 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  33.88 
 
 		 305 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1351  2-dehydropantoate 2-reductase  29 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  28.71 
 
 		 309 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  28.38 
 
 		 309 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  32.67 
 
 		 306 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1855  2-dehydropantoate 2-reductase  29.75 
 
 		 316 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1445  2-dehydropantoate 2-reductase  28.52 
 
 		 312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.219462  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1477  ketopantoate reductase  27.6 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  27.12 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  30.79 
 
 		 335 aa  119  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  30.59 
 
 		 309 aa  119  7.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1285  2-dehydropantoate 2-reductase  26.86 
 
 		 311 aa  119  9e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0462  2-dehydropantoate 2-reductase  31.54 
 
 		 303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  31.19 
 
 		 329 aa  116  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  32.45 
 
 		 316 aa  116  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2518  2-dehydropantoate 2-reductase  28.3 
 
 		 311 aa  115  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254196  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2470  2-dehydropantoate 2-reductase  28.3 
 
 		 311 aa  115  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  32.47 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  34.11 
 
 		 315 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  33.78 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  32.23 
 
 		 341 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  31.79 
 
 		 316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  32.01 
 
 		 299 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  32.11 
 
 		 316 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  32.11 
 
 		 316 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  32.67 
 
 		 301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  32.24 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  31.91 
 
 		 298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  30.52 
 
 		 302 aa  110  5e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  32.49 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  32.68 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  31.41 
 
 		 300 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1115  2-dehydropantoate 2-reductase  29.06 
 
 		 309 aa  106  5e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.275273  normal  0.917906 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  32.8 
 
 		 317 aa  106  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  34.42 
 
 		 325 aa  105  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2022  2-dehydropantoate 2-reductase  26.92 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  31.75 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  31.67 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2858  2-dehydropantoate 2-reductase  30.62 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  35.81 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  34.88 
 
 		 319 aa  103  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  31.89 
 
 		 305 aa  102  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  31.19 
 
 		 313 aa  103  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  32 
 
 		 295 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1698  2-dehydropantoate 2-reductase  23.64 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.656315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  34.55 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  29.97 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  33.12 
 
 		 345 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  28.9 
 
 		 296 aa  99.4  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1422  2-dehydropantoate 2-reductase  30.29 
 
 		 322 aa  99.8  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0377  2-dehydropantoate 2-reductase  27.44 
 
 		 316 aa  99.8  6e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  32.11 
 
 		 316 aa  99  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  32.68 
 
 		 305 aa  98.2  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0349  2-dehydropantoate 2-reductase  24.92 
 
 		 321 aa  97.4  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  33.55 
 
 		 313 aa  97.1  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  31.44 
 
 		 302 aa  97.1  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  30.07 
 
 		 299 aa  97.1  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2865  2-dehydropantoate 2-reductase  29.49 
 
 		 311 aa  96.7  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03288  2-dehydropantoate 2-reductase  27.54 
 
 		 296 aa  96.7  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0708  2-dehydropantoate 2-reductase  30.2 
 
 		 311 aa  96.3  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1867  2-dehydropantoate 2-reductase  25.95 
 
 		 318 aa  95.9  7e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  31.46 
 
 		 337 aa  95.9  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  27.63 
 
 		 311 aa  95.5  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0816  2-dehydropantoate 2-reductase  26.77 
 
 		 320 aa  95.1  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1519  2-dehydropantoate 2-reductase  22.54 
 
 		 309 aa  95.5  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.982841  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  24.6 
 
 		 316 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0743  ketopantoate reductase ApbA/PanE  32.27 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  31.1 
 
 		 312 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.399113 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2147  2-dehydropantoate 2-reductase  31.62 
 
 		 303 aa  94.4  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3603  2-dehydropantoate 2-reductase  30.2 
 
 		 311 aa  93.6  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  23.57 
 
 		 318 aa  93.6  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57160  2-dehydropantoate 2-reductase  33.87 
 
 		 303 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3648  2-dehydropantoate 2-reductase  27.62 
 
 		 319 aa  93.2  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0849606  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0016  2-dehydropantoate 2-reductase  30.45 
 
 		 307 aa  92.8  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  30.1 
 
 		 312 aa  92.4  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0729  2-dehydropantoate 2-reductase  32.39 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.691763  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>