More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2643 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 302 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  82.45 
 
 		 302 aa  499  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  65.1 
 
 		 305 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2981  2-dehydropantoate 2-reductase  42.38 
 
 		 319 aa  239  5.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  42.11 
 
 		 311 aa  236  4e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1293  2-dehydropantoate 2-reductase  39.8 
 
 		 312 aa  229  5e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.519384  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1979  2-dehydropantoate 2-reductase  40.59 
 
 		 313 aa  224  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0057409  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41900  2-dehydropantoate 2-reductase  43.23 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  44.97 
 
 		 312 aa  209  5e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2276  2-dehydropantoate 2-reductase  40.97 
 
 		 323 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00122842  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3556  2-dehydropantoate 2-reductase  41.58 
 
 		 315 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2074  2-dehydropantoate 2-reductase  39.58 
 
 		 323 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.136591  normal  0.0111283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3445  2-dehydropantoate 2-reductase  37.8 
 
 		 349 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00422056  hitchhiker  0.00254132 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1926  2-dehydropantoate 2-reductase  37.06 
 
 		 315 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000062548  hitchhiker  0.000000000000153659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2325  2-dehydropantoate 2-reductase  37.8 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.79299  hitchhiker  0.0000420215 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1766  2-dehydropantoate 2-reductase  39.51 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.411691  hitchhiker  0.000000000967397 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4006  2-dehydropantoate 2-reductase  38.54 
 
 		 317 aa  189  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143749  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2549  2-dehydropantoate 2-reductase  40.42 
 
 		 317 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0215033  hitchhiker  0.00000000817655 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  32.67 
 
 		 312 aa  156  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39578  predicted protein  33.03 
 
 		 414 aa  153  2.9999999999999998e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  34.74 
 
 		 306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  35.31 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0552  2-dehydropantoate 2-reductase  32.45 
 
 		 319 aa  141  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  31.83 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  33.44 
 
 		 315 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  31.23 
 
 		 329 aa  125  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  29.57 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  30.31 
 
 		 325 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  32.61 
 
 		 309 aa  122  7e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  30.09 
 
 		 342 aa  122  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  29.06 
 
 		 346 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  29.41 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  30.82 
 
 		 331 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02389  ketopantoate reductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14497)  31 
 
 		 426 aa  119  7e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  30.23 
 
 		 306 aa  119  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  32.24 
 
 		 310 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  30.31 
 
 		 335 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  30.13 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  28.75 
 
 		 324 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  29.8 
 
 		 319 aa  115  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  28.76 
 
 		 314 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  29.24 
 
 		 309 aa  115  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  34.32 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  28.75 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  29.06 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1818  2-dehydropantoate 2-reductase  29.65 
 
 		 327 aa  113  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  29.73 
 
 		 335 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4110  2-dehydropantoate 2-reductase  31.97 
 
 		 336 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal  0.957383 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  33.19 
 
 		 312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.399113 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  28.12 
 
 		 337 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  32.34 
 
 		 312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  28.1 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0294  2-dehydropantoate 2-reductase  29.24 
 
 		 307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.220777  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  32.76 
 
 		 315 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  29.25 
 
 		 325 aa  108  8.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  27.49 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  27.49 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  28.67 
 
 		 345 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1405  2-dehydropantoate 2-reductase  30.85 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  30.28 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  28.26 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  30.6 
 
 		 316 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0600  2-dehydropantoate 2-reductase  29.52 
 
 		 314 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000137771  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3781  2-dehydropantoate 2-reductase  32.76 
 
 		 312 aa  106  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0449567 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  28.62 
 
 		 327 aa  105  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5770  2-dehydropantoate 2-reductase  31.02 
 
 		 307 aa  106  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  31.62 
 
 		 311 aa  106  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4423  2-dehydropantoate 2-reductase  32.19 
 
 		 311 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.852681 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2408  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0790989 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  27.02 
 
 		 325 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  27.27 
 
 		 325 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2967  2-dehydropantoate 2-reductase  34.78 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  28.09 
 
 		 332 aa  102  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0016  2-dehydropantoate 2-reductase  29.57 
 
 		 307 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  31.06 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0882  2-dehydropantoate 2-reductase  31.49 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.277426 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  27.48 
 
 		 305 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  27.48 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02788  2-dehydropantoate 2-reductase  30.3 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  28.52 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2605  2-dehydropantoate 2-reductase  32.7 
 
 		 314 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  26.33 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4203  2-dehydropantoate 2-reductase  31.9 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.379422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  27.48 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  27.49 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3545  2-dehydropantoate 2-reductase  31.06 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  27.49 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  27.48 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4822  2-dehydropantoate 2-reductase  31.06 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  29.45 
 
 		 301 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  30.41 
 
 		 324 aa  99.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  35.29 
 
 		 305 aa  99.8  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0839  2-dehydropantoate 2-reductase  29.05 
 
 		 307 aa  99.4  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2022  2-dehydropantoate 2-reductase  25.33 
 
 		 310 aa  99.4  7e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2629  2-dehydropantoate 2-reductase  32.59 
 
 		 314 aa  99  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  28.86 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  29.3 
 
 		 326 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0743  ketopantoate reductase ApbA/PanE  30.9 
 
 		 311 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786977  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>