More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2525 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
326 aa  658    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  62.19 
 
 
332 aa  394  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  60.75 
 
 
332 aa  391  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  54.97 
 
 
324 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  56.56 
 
 
333 aa  362  6e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  56.6 
 
 
324 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  54.52 
 
 
336 aa  346  2e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  54.52 
 
 
335 aa  345  8e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  54.04 
 
 
325 aa  342  7e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  52.02 
 
 
337 aa  338  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  51.86 
 
 
342 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  53.75 
 
 
335 aa  334  1e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  51.86 
 
 
325 aa  332  4e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  53.44 
 
 
335 aa  330  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  53.44 
 
 
335 aa  330  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  52.06 
 
 
346 aa  328  6e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  51.24 
 
 
335 aa  328  8e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  50.32 
 
 
324 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  49.38 
 
 
353 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  50.32 
 
 
336 aa  322  6e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  49.68 
 
 
324 aa  321  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  49.68 
 
 
326 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  49.38 
 
 
325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  49.07 
 
 
325 aa  318  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  49.69 
 
 
323 aa  317  2e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  47.52 
 
 
339 aa  305  5.0000000000000004e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00418767  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1558  2-dehydropantoate 2-reductase  57.94 
 
 
447 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4110  2-dehydropantoate 2-reductase  52.19 
 
 
336 aa  293  4e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal  0.957383 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  44.27 
 
 
326 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  43.03 
 
 
326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  42.72 
 
 
326 aa  265  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  43.89 
 
 
331 aa  260  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1724  2-dehydropantoate 2-reductase  42.72 
 
 
331 aa  260  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  43.71 
 
 
325 aa  249  4e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  41.61 
 
 
327 aa  249  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1224  2-dehydropantoate 2-reductase  41.05 
 
 
327 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.318793 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3558  2-dehydropantoate 2-reductase  42.77 
 
 
325 aa  246  4e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3234  2-dehydropantoate 2-reductase  43.26 
 
 
325 aa  242  5e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0135  2-dehydropantoate 2-reductase  41.8 
 
 
324 aa  241  9e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878184  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5382  2-dehydropantoate 2-reductase  39.25 
 
 
327 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324063  normal  0.227406 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3341  2-dehydropantoate 2-reductase  42.22 
 
 
324 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1238  2-dehydropantoate 2-reductase  41.9 
 
 
329 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1471  2-dehydropantoate 2-reductase  41.9 
 
 
329 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2487  2-dehydropantoate 2-reductase  41.9 
 
 
329 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1964  2-dehydropantoate 2-reductase  41.9 
 
 
329 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.734659  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1796  2-dehydropantoate 2-reductase  40.55 
 
 
341 aa  236  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.275897 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0197  2-dehydropantoate 2-reductase  41.1 
 
 
324 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431306  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2371  2-dehydropantoate 2-reductase  41.19 
 
 
333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2330  2-dehydropantoate 2-reductase  40.68 
 
 
337 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.787912  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1345  2-dehydropantoate 2-reductase  41.27 
 
 
332 aa  230  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162184  normal  0.0787128 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2115  2-dehydropantoate 2-reductase  41.27 
 
 
329 aa  225  9e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0234  2-dehydropantoate 2-reductase  41.61 
 
 
325 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5228  2-dehydropantoate 2-reductase  40.32 
 
 
332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1845  2-dehydropantoate 2-reductase  40.32 
 
 
332 aa  219  7e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.995272  normal  0.0110748 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1471  2-dehydropantoate 2-reductase  41.83 
 
 
334 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6152  2-dehydropantoate 2-reductase  40.63 
 
 
332 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1915  2-dehydropantoate 2-reductase  40 
 
 
332 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1927  2-dehydropantoate 2-reductase  40.63 
 
 
332 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193569  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1950  2-dehydropantoate 2-reductase  40.32 
 
 
332 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0818482  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0153  2-dehydropantoate 2-reductase  38.19 
 
 
351 aa  202  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45590  hypothetical protein  39.06 
 
 
359 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1818  2-dehydropantoate 2-reductase  33.96 
 
 
327 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3888  2-dehydropantoate 2-reductase  37.46 
 
 
324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0769062  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3657  ketopantoate reductase ApbA/PanE  37.1 
 
 
223 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2699  2-dehydropantoate 2-reductase  34.29 
 
 
322 aa  126  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122985  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  31.56 
 
 
309 aa  122  9e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  32.34 
 
 
306 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  29.5 
 
 
299 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03720  2-dehydropantoate 2-reductase  32.81 
 
 
314 aa  119  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  33.77 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  30.37 
 
 
314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  31.9 
 
 
315 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3118  2-dehydropantoate 2-reductase  30.7 
 
 
312 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  29.6 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  31.68 
 
 
335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  35.6 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  31.5 
 
 
315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  30.79 
 
 
312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  29.1 
 
 
309 aa  110  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  31.9 
 
 
316 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  31 
 
 
310 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0313  2-dehydropantoate 2-reductase  28.48 
 
 
307 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.82281 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  31.6 
 
 
316 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  31.6 
 
 
341 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  29.47 
 
 
307 aa  106  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  31.1 
 
 
315 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  27.73 
 
 
301 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2936  2-dehydropantoate 2-reductase  29.07 
 
 
312 aa  105  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.178942 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2669  2-dehydropantoate 2-reductase  29.43 
 
 
310 aa  105  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0588922  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  32.09 
 
 
318 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0839  2-dehydropantoate 2-reductase  28.53 
 
 
307 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0016  2-dehydropantoate 2-reductase  29.81 
 
 
307 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  31.29 
 
 
316 aa  102  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3162  2-dehydropantoate 2-reductase  29.07 
 
 
312 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  30.12 
 
 
312 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0186  2-dehydropantoate 2-reductase  26.42 
 
 
306 aa  101  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3545  2-dehydropantoate 2-reductase  29.61 
 
 
315 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  31.21 
 
 
316 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4822  2-dehydropantoate 2-reductase  29.61 
 
 
315 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  31.21 
 
 
316 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>