More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0313 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0313  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 307 aa  620  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.82281 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0186  2-dehydropantoate 2-reductase  71.24 
 
 		 306 aa  456  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0016  2-dehydropantoate 2-reductase  66.67 
 
 		 307 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0163  2-dehydropantoate 2-reductase  66.99 
 
 		 306 aa  424  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0729  2-dehydropantoate 2-reductase  68.54 
 
 		 306 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.691763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0018  2-dehydropantoate 2-reductase  67.65 
 
 		 306 aa  417  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0021  2-dehydropantoate 2-reductase  65.69 
 
 		 306 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  58.55 
 
 		 312 aa  350  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.399113 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2967  2-dehydropantoate 2-reductase  55.99 
 
 		 311 aa  341  8e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5770  2-dehydropantoate 2-reductase  53.42 
 
 		 307 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  59.41 
 
 		 315 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3118  2-dehydropantoate 2-reductase  54.37 
 
 		 312 aa  328  6e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3781  2-dehydropantoate 2-reductase  57.95 
 
 		 312 aa  323  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0449567 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6167  2-dehydropantoate 2-reductase  56.44 
 
 		 314 aa  322  4e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6687  2-dehydropantoate 2-reductase  54.69 
 
 		 312 aa  321  8e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0882  2-dehydropantoate 2-reductase  57.52 
 
 		 315 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.277426 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4203  2-dehydropantoate 2-reductase  59.08 
 
 		 315 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.379422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  56.54 
 
 		 315 aa  316  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3162  2-dehydropantoate 2-reductase  54.69 
 
 		 312 aa  316  3e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3545  2-dehydropantoate 2-reductase  56.54 
 
 		 315 aa  315  4e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2936  2-dehydropantoate 2-reductase  54.05 
 
 		 312 aa  316  4e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178942 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4822  2-dehydropantoate 2-reductase  56.54 
 
 		 315 aa  315  4e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2669  2-dehydropantoate 2-reductase  52.75 
 
 		 310 aa  315  6e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0588922  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0085  2-dehydropantoate 2-reductase  55.63 
 
 		 314 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4423  2-dehydropantoate 2-reductase  53.27 
 
 		 311 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.852681 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0743  ketopantoate reductase ApbA/PanE  53.92 
 
 		 311 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2600  2-dehydropantoate 2-reductase  52.12 
 
 		 311 aa  310  2e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  53.77 
 
 		 305 aa  299  4e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  47.04 
 
 		 306 aa  275  6e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0174  2-dehydropantoate 2-reductase  52.4 
 
 		 313 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3518  2-dehydropantoate 2-reductase  49.31 
 
 		 305 aa  265  7e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0067  2-dehydropantoate 2-reductase  51.94 
 
 		 321 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0600  2-dehydropantoate 2-reductase  43.93 
 
 		 314 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000137771  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0059  2-dehydropantoate 2-reductase  51.61 
 
 		 321 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2980  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  45.48 
 
 		 323 aa  259  3e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3883  2-dehydropantoate 2-reductase  50.16 
 
 		 312 aa  258  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535579 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1405  2-dehydropantoate 2-reductase  44.92 
 
 		 307 aa  248  8e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2408  2-dehydropantoate 2-reductase  42.48 
 
 		 306 aa  242  7e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0790989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4552  2-dehydropantoate 2-reductase  44.55 
 
 		 307 aa  236  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1913  ketopantoate reductase ApbA/PanE  44.06 
 
 		 304 aa  229  5e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4116  2-dehydropantoate 2-reductase  41.72 
 
 		 308 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.605632 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02788  2-dehydropantoate 2-reductase  44.69 
 
 		 312 aa  227  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1964  2-dehydropantoate 2-reductase  40.42 
 
 		 314 aa  225  6e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00305796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1918  2-dehydropantoate 2-reductase  39.72 
 
 		 314 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000931177 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3467  2-dehydropantoate 2-reductase  40.07 
 
 		 314 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000905297  hitchhiker  8.32908e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1746  2-dehydropantoate 2-reductase  39.72 
 
 		 314 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1991  2-dehydropantoate 2-reductase  40.07 
 
 		 314 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1884  2-dehydropantoate 2-reductase  39.72 
 
 		 314 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1877  2-dehydropantoate 2-reductase  39.72 
 
 		 314 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1696  2-dehydropantoate 2-reductase  39.02 
 
 		 314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231571  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1738  2-dehydropantoate 2-reductase  40.42 
 
 		 314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0314725  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4737  ketopantoate reductase ApbA/PanE  44.44 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1107  2-dehydropantoate 2-reductase  46.13 
 
 		 319 aa  212  5.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06250  2-dehydropantoate 2-reductase  43.93 
 
 		 305 aa  199  6e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0294  2-dehydropantoate 2-reductase  32.79 
 
 		 307 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.220777  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  33.77 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  33.11 
 
 		 307 aa  146  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  31.83 
 
 		 315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  33.55 
 
 		 318 aa  119  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  31.83 
 
 		 311 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  27.05 
 
 		 309 aa  112  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  28.48 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2865  2-dehydropantoate 2-reductase  27.46 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  30.94 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  27.38 
 
 		 332 aa  106  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  29.24 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  28.35 
 
 		 332 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  27.85 
 
 		 336 aa  102  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  28 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  28.34 
 
 		 312 aa  99.8  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  25.16 
 
 		 307 aa  99.8  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  27.45 
 
 		 299 aa  99.4  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  26.82 
 
 		 335 aa  99  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  28.53 
 
 		 325 aa  98.6  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  27.45 
 
 		 345 aa  98.6  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  29 
 
 		 316 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  27.84 
 
 		 306 aa  97.4  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1861  2-dehydropantoate 2-reductase  27.3 
 
 		 317 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  28.09 
 
 		 325 aa  96.7  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  26.32 
 
 		 337 aa  95.5  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  25.62 
 
 		 335 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  27.8 
 
 		 312 aa  95.5  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  25.62 
 
 		 335 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  25.31 
 
 		 335 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  26.47 
 
 		 300 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  28.67 
 
 		 316 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  28.67 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  26.97 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  28.77 
 
 		 315 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  27.12 
 
 		 319 aa  92.4  9e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  28.3 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  25.61 
 
 		 335 aa  92  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  25.82 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  27.03 
 
 		 311 aa  90.1  5e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  29.55 
 
 		 323 aa  89.7  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  28.53 
 
 		 331 aa  89.7  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  27.05 
 
 		 315 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1677  2-dehydropantoate 2-reductase  30.45 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  29.29 
 
 		 316 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  29.29 
 
 		 316 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>