More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4116 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4116  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
308 aa  595  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.605632 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4552  2-dehydropantoate 2-reductase  54.75 
 
 
307 aa  295  9e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06250  2-dehydropantoate 2-reductase  51.8 
 
 
305 aa  249  3e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2408  2-dehydropantoate 2-reductase  46.18 
 
 
306 aa  243  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0790989 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  42.38 
 
 
306 aa  243  3e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0016  2-dehydropantoate 2-reductase  43.05 
 
 
307 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2967  2-dehydropantoate 2-reductase  41.56 
 
 
311 aa  226  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0313  2-dehydropantoate 2-reductase  41.72 
 
 
307 aa  225  8e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.82281 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0186  2-dehydropantoate 2-reductase  41.45 
 
 
306 aa  223  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3118  2-dehydropantoate 2-reductase  41.56 
 
 
312 aa  223  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2936  2-dehydropantoate 2-reductase  42.21 
 
 
312 aa  222  7e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.178942 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2669  2-dehydropantoate 2-reductase  41.25 
 
 
310 aa  220  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0588922  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  41.56 
 
 
312 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.399113 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0163  2-dehydropantoate 2-reductase  40.13 
 
 
306 aa  218  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0743  ketopantoate reductase ApbA/PanE  41.69 
 
 
311 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786977  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5770  2-dehydropantoate 2-reductase  40.26 
 
 
307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0729  2-dehydropantoate 2-reductase  40.66 
 
 
306 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.691763  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3162  2-dehydropantoate 2-reductase  41.88 
 
 
312 aa  215  8e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6167  2-dehydropantoate 2-reductase  43.89 
 
 
314 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0018  2-dehydropantoate 2-reductase  41.12 
 
 
306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4423  2-dehydropantoate 2-reductase  41.42 
 
 
311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.852681 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0021  2-dehydropantoate 2-reductase  41.45 
 
 
306 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6687  2-dehydropantoate 2-reductase  42.63 
 
 
312 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0085  2-dehydropantoate 2-reductase  43.87 
 
 
314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3781  2-dehydropantoate 2-reductase  41.79 
 
 
312 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0449567 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  40.39 
 
 
315 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2600  2-dehydropantoate 2-reductase  39.22 
 
 
311 aa  194  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0174  2-dehydropantoate 2-reductase  41.04 
 
 
313 aa  193  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1107  2-dehydropantoate 2-reductase  43.27 
 
 
319 aa  193  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3545  2-dehydropantoate 2-reductase  41.29 
 
 
315 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  40.52 
 
 
305 aa  193  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4822  2-dehydropantoate 2-reductase  41.29 
 
 
315 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  40.97 
 
 
315 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0600  2-dehydropantoate 2-reductase  34.22 
 
 
314 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000137771  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2980  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  37.58 
 
 
323 aa  192  6e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0882  2-dehydropantoate 2-reductase  40.65 
 
 
315 aa  192  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.277426 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1405  2-dehydropantoate 2-reductase  35.55 
 
 
307 aa  192  7e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4203  2-dehydropantoate 2-reductase  40.72 
 
 
315 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.379422  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3518  2-dehydropantoate 2-reductase  40.75 
 
 
305 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0059  2-dehydropantoate 2-reductase  39.1 
 
 
321 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0067  2-dehydropantoate 2-reductase  38.78 
 
 
321 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1964  2-dehydropantoate 2-reductase  32.52 
 
 
314 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00305796  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1746  2-dehydropantoate 2-reductase  33.22 
 
 
314 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1884  2-dehydropantoate 2-reductase  33.22 
 
 
314 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1877  2-dehydropantoate 2-reductase  33.92 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3467  2-dehydropantoate 2-reductase  33.92 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000905297  hitchhiker  8.32908e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1991  2-dehydropantoate 2-reductase  32.87 
 
 
314 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4737  ketopantoate reductase ApbA/PanE  38.11 
 
 
310 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02788  2-dehydropantoate 2-reductase  37.79 
 
 
312 aa  172  6.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1696  2-dehydropantoate 2-reductase  32.17 
 
 
314 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231571  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1918  2-dehydropantoate 2-reductase  32.52 
 
 
314 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000931177 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1738  2-dehydropantoate 2-reductase  32.42 
 
 
314 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0314725  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1913  ketopantoate reductase ApbA/PanE  35.99 
 
 
304 aa  166  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0294  2-dehydropantoate 2-reductase  31.46 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.220777  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3883  2-dehydropantoate 2-reductase  36.16 
 
 
312 aa  145  9e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.535579 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  28.83 
 
 
309 aa  125  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  30.39 
 
 
306 aa  123  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  29.12 
 
 
307 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  29.47 
 
 
307 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  31.16 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  31.68 
 
 
299 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  30.92 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  31.49 
 
 
315 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1285  2-dehydropantoate 2-reductase  27.39 
 
 
311 aa  113  5e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  30.82 
 
 
345 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  30.8 
 
 
300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  29.9 
 
 
298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  29.55 
 
 
307 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  30.45 
 
 
319 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0557  ketopantoate reductase ApbA/PanE  29.91 
 
 
334 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.302954  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  28.48 
 
 
325 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0533  ketopantoate reductase ApbA/PanE  29.62 
 
 
334 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1673  ketopantoate reductase ApbA/PanE  29.62 
 
 
334 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662338  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1695  ketopantoate reductase ApbA/PanE-like protein  29.62 
 
 
334 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1723  ketopantoate reductase ApbA/PanE  29.62 
 
 
334 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.711694  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1739  ketopantoate reductase ApbA/PanE  29.62 
 
 
334 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  30.03 
 
 
319 aa  103  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  29.22 
 
 
312 aa  103  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0839  2-dehydropantoate 2-reductase  29.55 
 
 
307 aa  102  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  30.97 
 
 
335 aa  102  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  29.22 
 
 
301 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  29.9 
 
 
302 aa  102  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 
325 aa  102  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  29.41 
 
 
295 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  29.66 
 
 
302 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  28.66 
 
 
335 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  28.66 
 
 
335 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3558  2-dehydropantoate 2-reductase  28.88 
 
 
325 aa  99.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  26.88 
 
 
305 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2951  2-dehydropantoate 2-reductase  26.88 
 
 
305 aa  99.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  29.49 
 
 
313 aa  99.4  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  27.69 
 
 
332 aa  99  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  26.88 
 
 
305 aa  99  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  26.88 
 
 
305 aa  99  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  28.66 
 
 
335 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  26.52 
 
 
305 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  28.09 
 
 
336 aa  97.8  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3234  2-dehydropantoate 2-reductase  27.86 
 
 
325 aa  95.9  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  27.97 
 
 
311 aa  95.5  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  29.97 
 
 
316 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>