More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2600 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2600  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 311 aa  622  1e-177  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2967  2-dehydropantoate 2-reductase  58.06 
 
 		 311 aa  371  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5770  2-dehydropantoate 2-reductase  56.68 
 
 		 307 aa  341  7e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0186  2-dehydropantoate 2-reductase  56.07 
 
 		 306 aa  334  9e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0016  2-dehydropantoate 2-reductase  53.77 
 
 		 307 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3118  2-dehydropantoate 2-reductase  56.91 
 
 		 312 aa  329  3e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0163  2-dehydropantoate 2-reductase  54.1 
 
 		 306 aa  321  8e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0729  2-dehydropantoate 2-reductase  53.64 
 
 		 306 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.691763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2669  2-dehydropantoate 2-reductase  53.59 
 
 		 310 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0588922  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  56.23 
 
 		 315 aa  318  5e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3162  2-dehydropantoate 2-reductase  57.23 
 
 		 312 aa  318  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0018  2-dehydropantoate 2-reductase  53.11 
 
 		 306 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6687  2-dehydropantoate 2-reductase  56.31 
 
 		 312 aa  315  5e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2936  2-dehydropantoate 2-reductase  56.13 
 
 		 312 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178942 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6167  2-dehydropantoate 2-reductase  56.77 
 
 		 314 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  55.74 
 
 		 305 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4203  2-dehydropantoate 2-reductase  56.23 
 
 		 315 aa  308  5e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.379422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0313  2-dehydropantoate 2-reductase  52.77 
 
 		 307 aa  308  6.999999999999999e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.82281 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3518  2-dehydropantoate 2-reductase  56.36 
 
 		 305 aa  305  6e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3781  2-dehydropantoate 2-reductase  54.97 
 
 		 312 aa  305  6e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0449567 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  52.26 
 
 		 312 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.399113 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0882  2-dehydropantoate 2-reductase  54.49 
 
 		 315 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.277426 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  54.17 
 
 		 315 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0021  2-dehydropantoate 2-reductase  51.15 
 
 		 306 aa  299  4e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4423  2-dehydropantoate 2-reductase  51.92 
 
 		 311 aa  299  5e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.852681 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3545  2-dehydropantoate 2-reductase  53.85 
 
 		 315 aa  298  6e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4822  2-dehydropantoate 2-reductase  53.85 
 
 		 315 aa  298  6e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0085  2-dehydropantoate 2-reductase  55.59 
 
 		 314 aa  298  9e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0743  ketopantoate reductase ApbA/PanE  50.96 
 
 		 311 aa  292  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786977  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2980  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  49.53 
 
 		 323 aa  285  5.999999999999999e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  45.72 
 
 		 306 aa  261  2e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0059  2-dehydropantoate 2-reductase  47.17 
 
 		 321 aa  249  5e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0067  2-dehydropantoate 2-reductase  46.86 
 
 		 321 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0174  2-dehydropantoate 2-reductase  46.65 
 
 		 313 aa  240  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3883  2-dehydropantoate 2-reductase  46.15 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535579 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1405  2-dehydropantoate 2-reductase  42.81 
 
 		 307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4552  2-dehydropantoate 2-reductase  44.81 
 
 		 307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2408  2-dehydropantoate 2-reductase  40.72 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0790989 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02788  2-dehydropantoate 2-reductase  45.98 
 
 		 312 aa  212  5.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0600  2-dehydropantoate 2-reductase  40.51 
 
 		 314 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000137771  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1913  ketopantoate reductase ApbA/PanE  39.66 
 
 		 304 aa  199  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4737  ketopantoate reductase ApbA/PanE  42.39 
 
 		 310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4116  2-dehydropantoate 2-reductase  39.22 
 
 		 308 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.605632 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1107  2-dehydropantoate 2-reductase  44.84 
 
 		 319 aa  187  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1918  2-dehydropantoate 2-reductase  38.41 
 
 		 314 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000931177 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06250  2-dehydropantoate 2-reductase  39.87 
 
 		 305 aa  182  9.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1746  2-dehydropantoate 2-reductase  38.94 
 
 		 314 aa  178  9e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1884  2-dehydropantoate 2-reductase  38.94 
 
 		 314 aa  178  9e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1696  2-dehydropantoate 2-reductase  38.28 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231571  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3467  2-dehydropantoate 2-reductase  37.75 
 
 		 314 aa  176  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000905297  hitchhiker  8.32908e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1877  2-dehydropantoate 2-reductase  37.75 
 
 		 314 aa  175  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1964  2-dehydropantoate 2-reductase  37.95 
 
 		 314 aa  175  8e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00305796  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1991  2-dehydropantoate 2-reductase  37.91 
 
 		 314 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1738  2-dehydropantoate 2-reductase  37.58 
 
 		 314 aa  172  9e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0314725  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0294  2-dehydropantoate 2-reductase  33.99 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.220777  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  30.56 
 
 		 307 aa  115  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  30.56 
 
 		 307 aa  115  7.999999999999999e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  30.14 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  30.58 
 
 		 311 aa  99.4  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  26.64 
 
 		 309 aa  99  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  27.92 
 
 		 345 aa  96.3  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  26.62 
 
 		 305 aa  95.9  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  27.21 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  27.21 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  27.21 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  30.51 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  28.25 
 
 		 312 aa  94  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2951  2-dehydropantoate 2-reductase  26.62 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  27.46 
 
 		 299 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  34.39 
 
 		 305 aa  92.8  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  28.42 
 
 		 319 aa  92.8  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  28.03 
 
 		 311 aa  92.4  9e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  28.25 
 
 		 300 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  29.04 
 
 		 318 aa  90.9  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  28.42 
 
 		 319 aa  91.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  26.32 
 
 		 306 aa  90.1  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  28.12 
 
 		 331 aa  89  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1477  ketopantoate reductase  27.19 
 
 		 337 aa  87.4  3e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  29.63 
 
 		 302 aa  86.3  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3881  2-dehydropantoate 2-reductase  29.53 
 
 		 310 aa  86.3  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.564166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0839  2-dehydropantoate 2-reductase  26.13 
 
 		 307 aa  86.3  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  26.65 
 
 		 332 aa  85.9  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  27.57 
 
 		 325 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  26.14 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2981  2-dehydropantoate 2-reductase  24.1 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2865  2-dehydropantoate 2-reductase  27.61 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  26.67 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  27.33 
 
 		 337 aa  84.3  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3888  2-dehydropantoate 2-reductase  30.72 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0769062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  28.19 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  26.79 
 
 		 332 aa  82.8  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  29.07 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  27.41 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  27.19 
 
 		 335 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  24.76 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1677  2-dehydropantoate 2-reductase  29.68 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1293  2-dehydropantoate 2-reductase  23.32 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.519384  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  25.89 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  27.38 
 
 		 336 aa  79.3  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>