More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1107 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1107  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 319 aa  618  1e-176  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3118  2-dehydropantoate 2-reductase  45.25 
 
 		 312 aa  229  7e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0882  2-dehydropantoate 2-reductase  46.39 
 
 		 315 aa  216  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.277426 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  41.61 
 
 		 306 aa  216  5e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3162  2-dehydropantoate 2-reductase  44.62 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2936  2-dehydropantoate 2-reductase  44.3 
 
 		 312 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178942 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0313  2-dehydropantoate 2-reductase  46.13 
 
 		 307 aa  212  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.82281 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  45.14 
 
 		 315 aa  212  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0021  2-dehydropantoate 2-reductase  43.73 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0186  2-dehydropantoate 2-reductase  44.87 
 
 		 306 aa  211  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3545  2-dehydropantoate 2-reductase  44.83 
 
 		 315 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4822  2-dehydropantoate 2-reductase  44.83 
 
 		 315 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0016  2-dehydropantoate 2-reductase  43 
 
 		 307 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0163  2-dehydropantoate 2-reductase  43.23 
 
 		 306 aa  207  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  44.2 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4552  2-dehydropantoate 2-reductase  45.83 
 
 		 307 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  42.68 
 
 		 312 aa  203  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.399113 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0729  2-dehydropantoate 2-reductase  43.41 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.691763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2967  2-dehydropantoate 2-reductase  42.77 
 
 		 311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2408  2-dehydropantoate 2-reductase  43.55 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0790989 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2669  2-dehydropantoate 2-reductase  41.61 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0588922  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3781  2-dehydropantoate 2-reductase  43.51 
 
 		 312 aa  196  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0449567 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4203  2-dehydropantoate 2-reductase  44.51 
 
 		 315 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.379422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5770  2-dehydropantoate 2-reductase  40.71 
 
 		 307 aa  195  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0085  2-dehydropantoate 2-reductase  44.34 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0018  2-dehydropantoate 2-reductase  42.35 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4116  2-dehydropantoate 2-reductase  43.45 
 
 		 308 aa  192  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.605632 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2600  2-dehydropantoate 2-reductase  44.34 
 
 		 311 aa  192  6e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6687  2-dehydropantoate 2-reductase  46.13 
 
 		 312 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0600  2-dehydropantoate 2-reductase  36.69 
 
 		 314 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000137771  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6167  2-dehydropantoate 2-reductase  44.59 
 
 		 314 aa  186  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0743  ketopantoate reductase ApbA/PanE  40.58 
 
 		 311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  45.28 
 
 		 305 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4423  2-dehydropantoate 2-reductase  39.37 
 
 		 311 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.852681 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02788  2-dehydropantoate 2-reductase  43.18 
 
 		 312 aa  176  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0174  2-dehydropantoate 2-reductase  41.67 
 
 		 313 aa  169  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3518  2-dehydropantoate 2-reductase  41.44 
 
 		 305 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0059  2-dehydropantoate 2-reductase  40.5 
 
 		 321 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3883  2-dehydropantoate 2-reductase  42.68 
 
 		 312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535579 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0067  2-dehydropantoate 2-reductase  40.19 
 
 		 321 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2980  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  40.07 
 
 		 323 aa  159  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4737  ketopantoate reductase ApbA/PanE  40.13 
 
 		 310 aa  155  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1405  2-dehydropantoate 2-reductase  34.52 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06250  2-dehydropantoate 2-reductase  42.09 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1991  2-dehydropantoate 2-reductase  28.28 
 
 		 314 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3467  2-dehydropantoate 2-reductase  27.93 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000905297  hitchhiker  8.32908e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1877  2-dehydropantoate 2-reductase  27.93 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1964  2-dehydropantoate 2-reductase  26.99 
 
 		 314 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00305796  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1696  2-dehydropantoate 2-reductase  26.99 
 
 		 314 aa  142  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231571  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1738  2-dehydropantoate 2-reductase  27.52 
 
 		 314 aa  142  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0314725  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1918  2-dehydropantoate 2-reductase  26.76 
 
 		 314 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000931177 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1746  2-dehydropantoate 2-reductase  27.34 
 
 		 314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1884  2-dehydropantoate 2-reductase  27.34 
 
 		 314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1913  ketopantoate reductase ApbA/PanE  34.83 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0294  2-dehydropantoate 2-reductase  28.48 
 
 		 307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.220777  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  31.06 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  30.92 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  34.03 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  32.47 
 
 		 307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  32.47 
 
 		 307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  30.77 
 
 		 337 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  31.1 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  33.1 
 
 		 311 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  29.62 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  28.14 
 
 		 326 aa  97.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  30.19 
 
 		 305 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  26.45 
 
 		 325 aa  97.1  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  27.33 
 
 		 324 aa  96.7  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  27.81 
 
 		 336 aa  92.8  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  27.27 
 
 		 325 aa  93.2  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  27.1 
 
 		 335 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  27.1 
 
 		 335 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  31.97 
 
 		 316 aa  92.8  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  32.38 
 
 		 316 aa  92.4  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  30.03 
 
 		 310 aa  92.4  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  32.11 
 
 		 316 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  32.11 
 
 		 316 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  27.27 
 
 		 335 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  25.8 
 
 		 332 aa  89.7  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  26.03 
 
 		 339 aa  89.7  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00418767  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  27.81 
 
 		 324 aa  89.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  28.43 
 
 		 311 aa  89.4  9e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  26.98 
 
 		 333 aa  88.6  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45590  hypothetical protein  30.63 
 
 		 359 aa  87.8  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  25.6 
 
 		 325 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  32.03 
 
 		 310 aa  88.2  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  31.43 
 
 		 335 aa  87.8  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  32.11 
 
 		 323 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  32.88 
 
 		 316 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  27.91 
 
 		 299 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  26.56 
 
 		 342 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  28.29 
 
 		 300 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  31.15 
 
 		 319 aa  85.9  9e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  23.81 
 
 		 324 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  26.26 
 
 		 325 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  25.75 
 
 		 307 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  24.62 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1558  2-dehydropantoate 2-reductase  28.24 
 
 		 447 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  31.46 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>