More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02788 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02788  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 312 aa  627  1e-179  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3883  2-dehydropantoate 2-reductase  71.94 
 
 		 312 aa  384  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535579 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0174  2-dehydropantoate 2-reductase  57 
 
 		 313 aa  287  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0059  2-dehydropantoate 2-reductase  55.77 
 
 		 321 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  49.68 
 
 		 312 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.399113 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0067  2-dehydropantoate 2-reductase  55.77 
 
 		 321 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5770  2-dehydropantoate 2-reductase  49.68 
 
 		 307 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2669  2-dehydropantoate 2-reductase  48.23 
 
 		 310 aa  263  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0588922  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0016  2-dehydropantoate 2-reductase  46.96 
 
 		 307 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  50 
 
 		 315 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4423  2-dehydropantoate 2-reductase  48.71 
 
 		 311 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.852681 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3545  2-dehydropantoate 2-reductase  49.68 
 
 		 315 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4822  2-dehydropantoate 2-reductase  49.68 
 
 		 315 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0743  ketopantoate reductase ApbA/PanE  48.39 
 
 		 311 aa  255  8e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0882  2-dehydropantoate 2-reductase  50 
 
 		 315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.277426 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3781  2-dehydropantoate 2-reductase  49.35 
 
 		 312 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0449567 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  49.03 
 
 		 315 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0186  2-dehydropantoate 2-reductase  45.69 
 
 		 306 aa  251  8.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6167  2-dehydropantoate 2-reductase  50.49 
 
 		 314 aa  248  7e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3118  2-dehydropantoate 2-reductase  47.56 
 
 		 312 aa  248  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2936  2-dehydropantoate 2-reductase  47.23 
 
 		 312 aa  248  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3162  2-dehydropantoate 2-reductase  47.56 
 
 		 312 aa  246  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0313  2-dehydropantoate 2-reductase  44.19 
 
 		 307 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.82281 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4203  2-dehydropantoate 2-reductase  49.68 
 
 		 315 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.379422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0163  2-dehydropantoate 2-reductase  45.81 
 
 		 306 aa  239  5.999999999999999e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0729  2-dehydropantoate 2-reductase  45.81 
 
 		 306 aa  235  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.691763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6687  2-dehydropantoate 2-reductase  50.35 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  40.85 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2967  2-dehydropantoate 2-reductase  44.94 
 
 		 311 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0021  2-dehydropantoate 2-reductase  45.02 
 
 		 306 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  47.76 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0018  2-dehydropantoate 2-reductase  44.95 
 
 		 306 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2600  2-dehydropantoate 2-reductase  45.98 
 
 		 311 aa  226  4e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0085  2-dehydropantoate 2-reductase  47.78 
 
 		 314 aa  223  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3518  2-dehydropantoate 2-reductase  47.28 
 
 		 305 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0600  2-dehydropantoate 2-reductase  40.45 
 
 		 314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000137771  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1405  2-dehydropantoate 2-reductase  40.65 
 
 		 307 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2980  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  46.58 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1964  2-dehydropantoate 2-reductase  36.21 
 
 		 314 aa  200  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00305796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1918  2-dehydropantoate 2-reductase  34.83 
 
 		 314 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000931177 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1738  2-dehydropantoate 2-reductase  36.21 
 
 		 314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0314725  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1746  2-dehydropantoate 2-reductase  35.86 
 
 		 314 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1696  2-dehydropantoate 2-reductase  35.17 
 
 		 314 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231571  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1884  2-dehydropantoate 2-reductase  35.86 
 
 		 314 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1991  2-dehydropantoate 2-reductase  35.17 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1877  2-dehydropantoate 2-reductase  35.17 
 
 		 314 aa  192  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3467  2-dehydropantoate 2-reductase  35.17 
 
 		 314 aa  192  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000905297  hitchhiker  8.32908e-18 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2408  2-dehydropantoate 2-reductase  39.61 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0790989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4116  2-dehydropantoate 2-reductase  37.79 
 
 		 308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.605632 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4737  ketopantoate reductase ApbA/PanE  43.27 
 
 		 310 aa  189  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1107  2-dehydropantoate 2-reductase  43.18 
 
 		 319 aa  186  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1913  ketopantoate reductase ApbA/PanE  41.11 
 
 		 304 aa  182  8.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4552  2-dehydropantoate 2-reductase  39.74 
 
 		 307 aa  175  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06250  2-dehydropantoate 2-reductase  40.97 
 
 		 305 aa  172  7.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  36.1 
 
 		 307 aa  162  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  35.74 
 
 		 307 aa  162  8.000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0294  2-dehydropantoate 2-reductase  32.87 
 
 		 307 aa  139  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.220777  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  35.02 
 
 		 315 aa  125  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  32.62 
 
 		 318 aa  123  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  32.62 
 
 		 302 aa  119  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  29.66 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  33.45 
 
 		 311 aa  116  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  31.56 
 
 		 302 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  29.83 
 
 		 305 aa  106  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  30.93 
 
 		 312 aa  103  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  27.97 
 
 		 309 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  28.21 
 
 		 301 aa  99.4  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  28.27 
 
 		 307 aa  95.5  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1979  2-dehydropantoate 2-reductase  28.22 
 
 		 313 aa  92.8  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0057409  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  28.98 
 
 		 300 aa  92.4  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  29.77 
 
 		 335 aa  92  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  30.37 
 
 		 312 aa  90.9  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2981  2-dehydropantoate 2-reductase  27.52 
 
 		 319 aa  90.9  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  24.03 
 
 		 316 aa  90.1  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  28.79 
 
 		 325 aa  90.1  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  28.75 
 
 		 331 aa  89.7  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0839  2-dehydropantoate 2-reductase  26.15 
 
 		 307 aa  88.6  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1293  2-dehydropantoate 2-reductase  26.76 
 
 		 312 aa  88.6  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.519384  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  28.8 
 
 		 326 aa  88.2  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41900  2-dehydropantoate 2-reductase  29.17 
 
 		 315 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  27.36 
 
 		 299 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2865  2-dehydropantoate 2-reductase  27.7 
 
 		 311 aa  86.3  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  26.77 
 
 		 336 aa  85.5  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0557  ketopantoate reductase ApbA/PanE  33.78 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.302954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1861  2-dehydropantoate 2-reductase  29.37 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  28.36 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1673  ketopantoate reductase ApbA/PanE  33.78 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  28.17 
 
 		 325 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1695  ketopantoate reductase ApbA/PanE-like protein  33.78 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1723  ketopantoate reductase ApbA/PanE  33.78 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.711694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1739  ketopantoate reductase ApbA/PanE  33.78 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1046  2-dehydropantoate 2-reductase  32.75 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0275779 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  27.85 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0533  ketopantoate reductase ApbA/PanE  32.9 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1766  2-dehydropantoate 2-reductase  29.01 
 
 		 315 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.411691  hitchhiker  0.000000000967397 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  29.53 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  26.67 
 
 		 335 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  29.1 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  26.35 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  26.35 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>