More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4423 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4423  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 311 aa  632  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.852681 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0743  ketopantoate reductase ApbA/PanE  94.53 
 
 		 311 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  69.13 
 
 		 315 aa  428  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3781  2-dehydropantoate 2-reductase  69.97 
 
 		 312 aa  424  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0449567 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0882  2-dehydropantoate 2-reductase  68.27 
 
 		 315 aa  417  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.277426 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  68.27 
 
 		 315 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3545  2-dehydropantoate 2-reductase  67.95 
 
 		 315 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4822  2-dehydropantoate 2-reductase  67.95 
 
 		 315 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  65.81 
 
 		 312 aa  407  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.399113 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4203  2-dehydropantoate 2-reductase  68.81 
 
 		 315 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.379422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0016  2-dehydropantoate 2-reductase  56.49 
 
 		 307 aa  332  5e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0729  2-dehydropantoate 2-reductase  56.72 
 
 		 306 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.691763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5770  2-dehydropantoate 2-reductase  52.41 
 
 		 307 aa  322  4e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0018  2-dehydropantoate 2-reductase  55.19 
 
 		 306 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0186  2-dehydropantoate 2-reductase  54.87 
 
 		 306 aa  318  1e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6687  2-dehydropantoate 2-reductase  55.95 
 
 		 312 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2967  2-dehydropantoate 2-reductase  51.92 
 
 		 311 aa  311  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0021  2-dehydropantoate 2-reductase  53.9 
 
 		 306 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0313  2-dehydropantoate 2-reductase  53.27 
 
 		 307 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.82281 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0163  2-dehydropantoate 2-reductase  53.9 
 
 		 306 aa  305  5.0000000000000004e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3118  2-dehydropantoate 2-reductase  53.18 
 
 		 312 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2669  2-dehydropantoate 2-reductase  55.16 
 
 		 310 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0588922  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6167  2-dehydropantoate 2-reductase  54.93 
 
 		 314 aa  301  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  52.1 
 
 		 305 aa  298  8e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2936  2-dehydropantoate 2-reductase  53.18 
 
 		 312 aa  296  4e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3162  2-dehydropantoate 2-reductase  52.87 
 
 		 312 aa  290  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2600  2-dehydropantoate 2-reductase  51.92 
 
 		 311 aa  287  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0085  2-dehydropantoate 2-reductase  53.85 
 
 		 314 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3518  2-dehydropantoate 2-reductase  49.49 
 
 		 305 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2980  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  49.07 
 
 		 323 aa  271  1e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0059  2-dehydropantoate 2-reductase  48.44 
 
 		 321 aa  255  6e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0174  2-dehydropantoate 2-reductase  48.89 
 
 		 313 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0067  2-dehydropantoate 2-reductase  48.12 
 
 		 321 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1405  2-dehydropantoate 2-reductase  43.77 
 
 		 307 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  40.72 
 
 		 306 aa  239  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0600  2-dehydropantoate 2-reductase  43.23 
 
 		 314 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000137771  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02788  2-dehydropantoate 2-reductase  48.71 
 
 		 312 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3883  2-dehydropantoate 2-reductase  47.78 
 
 		 312 aa  229  6e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4116  2-dehydropantoate 2-reductase  41.42 
 
 		 308 aa  205  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.605632 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1913  ketopantoate reductase ApbA/PanE  40.61 
 
 		 304 aa  198  7.999999999999999e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2408  2-dehydropantoate 2-reductase  39.61 
 
 		 306 aa  195  9e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0790989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4552  2-dehydropantoate 2-reductase  39.55 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1918  2-dehydropantoate 2-reductase  39.67 
 
 		 314 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000931177 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4737  ketopantoate reductase ApbA/PanE  41.16 
 
 		 310 aa  192  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1746  2-dehydropantoate 2-reductase  39.67 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1884  2-dehydropantoate 2-reductase  39.67 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1964  2-dehydropantoate 2-reductase  39.02 
 
 		 314 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00305796  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1696  2-dehydropantoate 2-reductase  38.46 
 
 		 314 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231571  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3467  2-dehydropantoate 2-reductase  36.81 
 
 		 314 aa  189  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000905297  hitchhiker  8.32908e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1877  2-dehydropantoate 2-reductase  36.81 
 
 		 314 aa  189  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1991  2-dehydropantoate 2-reductase  36.11 
 
 		 314 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1738  2-dehydropantoate 2-reductase  38.03 
 
 		 314 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0314725  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0294  2-dehydropantoate 2-reductase  35.74 
 
 		 307 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.220777  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1107  2-dehydropantoate 2-reductase  39.3 
 
 		 319 aa  168  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06250  2-dehydropantoate 2-reductase  39.68 
 
 		 305 aa  162  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  34.16 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  34.16 
 
 		 307 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  25.26 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  32.24 
 
 		 315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  33.71 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 336 aa  110  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  31.25 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  32.65 
 
 		 315 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  30.45 
 
 		 312 aa  105  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  30.06 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  32.19 
 
 		 302 aa  104  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  30.3 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  29.56 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  31.8 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  32.28 
 
 		 316 aa  102  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  29.07 
 
 		 335 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  25.87 
 
 		 309 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  29.27 
 
 		 316 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  30.63 
 
 		 316 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  30.74 
 
 		 341 aa  99.8  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  30.63 
 
 		 316 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  28.43 
 
 		 332 aa  99.4  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  28.24 
 
 		 335 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  31.91 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  27.81 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2981  2-dehydropantoate 2-reductase  25.97 
 
 		 319 aa  96.7  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  27.65 
 
 		 345 aa  96.7  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  28.12 
 
 		 312 aa  96.7  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  28.92 
 
 		 316 aa  96.3  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1293  2-dehydropantoate 2-reductase  24.76 
 
 		 312 aa  95.5  9e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.519384  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  27.7 
 
 		 311 aa  95.5  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  28.05 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  25.52 
 
 		 309 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  27.56 
 
 		 307 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  27.02 
 
 		 299 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1818  2-dehydropantoate 2-reductase  25.76 
 
 		 327 aa  92.4  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  30.28 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  27.72 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  27.61 
 
 		 339 aa  90.9  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00418767  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  31.94 
 
 		 323 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  29.84 
 
 		 310 aa  90.1  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2865  2-dehydropantoate 2-reductase  27.72 
 
 		 311 aa  90.1  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  26.25 
 
 		 335 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  27.43 
 
 		 301 aa  89.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  26.58 
 
 		 335 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>