More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4203 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4203  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 315 aa  619  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.379422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  98.73 
 
 		 315 aa  610  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  93.02 
 
 		 315 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3545  2-dehydropantoate 2-reductase  92.38 
 
 		 315 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4822  2-dehydropantoate 2-reductase  92.38 
 
 		 315 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0882  2-dehydropantoate 2-reductase  91.75 
 
 		 315 aa  568  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.277426 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3781  2-dehydropantoate 2-reductase  92.03 
 
 		 312 aa  550  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0449567 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0743  ketopantoate reductase ApbA/PanE  68.49 
 
 		 311 aa  425  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4423  2-dehydropantoate 2-reductase  68.81 
 
 		 311 aa  425  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.852681 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  66.35 
 
 		 312 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.399113 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2967  2-dehydropantoate 2-reductase  58.47 
 
 		 311 aa  348  7e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0729  2-dehydropantoate 2-reductase  58.42 
 
 		 306 aa  329  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.691763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0018  2-dehydropantoate 2-reductase  58.75 
 
 		 306 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0016  2-dehydropantoate 2-reductase  56.39 
 
 		 307 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0021  2-dehydropantoate 2-reductase  57.05 
 
 		 306 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0313  2-dehydropantoate 2-reductase  59.08 
 
 		 307 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.82281 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0186  2-dehydropantoate 2-reductase  55.41 
 
 		 306 aa  316  3e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2600  2-dehydropantoate 2-reductase  56.23 
 
 		 311 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5770  2-dehydropantoate 2-reductase  52.6 
 
 		 307 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6687  2-dehydropantoate 2-reductase  56.77 
 
 		 312 aa  300  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0163  2-dehydropantoate 2-reductase  54.1 
 
 		 306 aa  299  5e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2669  2-dehydropantoate 2-reductase  53.67 
 
 		 310 aa  299  5e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0588922  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  54.4 
 
 		 305 aa  296  4e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6167  2-dehydropantoate 2-reductase  57.57 
 
 		 314 aa  294  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3118  2-dehydropantoate 2-reductase  52.72 
 
 		 312 aa  293  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2936  2-dehydropantoate 2-reductase  52.72 
 
 		 312 aa  288  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3162  2-dehydropantoate 2-reductase  52.72 
 
 		 312 aa  287  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0085  2-dehydropantoate 2-reductase  54.14 
 
 		 314 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3518  2-dehydropantoate 2-reductase  52.22 
 
 		 305 aa  268  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2980  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  46.13 
 
 		 323 aa  252  6e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0059  2-dehydropantoate 2-reductase  50.47 
 
 		 321 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0174  2-dehydropantoate 2-reductase  51.44 
 
 		 313 aa  250  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  44.59 
 
 		 306 aa  245  8e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0067  2-dehydropantoate 2-reductase  49.84 
 
 		 321 aa  245  8e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0600  2-dehydropantoate 2-reductase  42.57 
 
 		 314 aa  239  5e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000137771  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1405  2-dehydropantoate 2-reductase  45.07 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02788  2-dehydropantoate 2-reductase  49.68 
 
 		 312 aa  231  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3883  2-dehydropantoate 2-reductase  49.35 
 
 		 312 aa  221  9e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535579 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2408  2-dehydropantoate 2-reductase  42.05 
 
 		 306 aa  209  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0790989 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1913  ketopantoate reductase ApbA/PanE  42.07 
 
 		 304 aa  209  7e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4552  2-dehydropantoate 2-reductase  43.69 
 
 		 307 aa  203  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4737  ketopantoate reductase ApbA/PanE  44.37 
 
 		 310 aa  198  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1696  2-dehydropantoate 2-reductase  35.37 
 
 		 314 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231571  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1107  2-dehydropantoate 2-reductase  44.23 
 
 		 319 aa  194  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1964  2-dehydropantoate 2-reductase  35.37 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00305796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1918  2-dehydropantoate 2-reductase  36.01 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000931177 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1738  2-dehydropantoate 2-reductase  35.37 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0314725  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1746  2-dehydropantoate 2-reductase  36.36 
 
 		 314 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1991  2-dehydropantoate 2-reductase  36.36 
 
 		 314 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1884  2-dehydropantoate 2-reductase  36.36 
 
 		 314 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4116  2-dehydropantoate 2-reductase  40.72 
 
 		 308 aa  189  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.605632 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1877  2-dehydropantoate 2-reductase  35.66 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3467  2-dehydropantoate 2-reductase  35.66 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000905297  hitchhiker  8.32908e-18 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06250  2-dehydropantoate 2-reductase  43.42 
 
 		 305 aa  153  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0294  2-dehydropantoate 2-reductase  32.57 
 
 		 307 aa  152  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.220777  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  36.07 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  36.07 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  29.86 
 
 		 309 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  34.98 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  34.29 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  35.1 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  31.56 
 
 		 335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  28.82 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  28.82 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  28.53 
 
 		 335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  31.76 
 
 		 337 aa  109  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  32.33 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  28.52 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  32.01 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  29.75 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  34.76 
 
 		 323 aa  99.8  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  29.41 
 
 		 312 aa  99  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  31.03 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  29.47 
 
 		 315 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  31.17 
 
 		 310 aa  97.4  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  29.81 
 
 		 306 aa  97.1  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  29.12 
 
 		 315 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  28.72 
 
 		 316 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  27.67 
 
 		 333 aa  96.7  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  28.29 
 
 		 315 aa  96.3  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  30 
 
 		 335 aa  95.9  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  29.62 
 
 		 312 aa  95.5  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  33.02 
 
 		 316 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  32.09 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1861  2-dehydropantoate 2-reductase  29.26 
 
 		 317 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  30.9 
 
 		 327 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  28.72 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  28.32 
 
 		 339 aa  93.6  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00418767  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2865  2-dehydropantoate 2-reductase  29.39 
 
 		 311 aa  92.8  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  26.84 
 
 		 311 aa  92.4  8e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  28.67 
 
 		 332 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  28.32 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  28.94 
 
 		 312 aa  91.7  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2981  2-dehydropantoate 2-reductase  24.92 
 
 		 319 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  32.08 
 
 		 316 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  32.08 
 
 		 316 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  28.86 
 
 		 332 aa  90.5  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  26.07 
 
 		 342 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  27.24 
 
 		 307 aa  89.7  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  27.91 
 
 		 325 aa  89.7  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>