More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3162 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3162  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 312 aa  617  1e-176  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2936  2-dehydropantoate 2-reductase  97.12 
 
 		 312 aa  580  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3118  2-dehydropantoate 2-reductase  89.42 
 
 		 312 aa  550  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0085  2-dehydropantoate 2-reductase  69.75 
 
 		 314 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6687  2-dehydropantoate 2-reductase  66.56 
 
 		 312 aa  371  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6167  2-dehydropantoate 2-reductase  66.23 
 
 		 314 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0016  2-dehydropantoate 2-reductase  57 
 
 		 307 aa  346  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0163  2-dehydropantoate 2-reductase  56.35 
 
 		 306 aa  337  9.999999999999999e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0186  2-dehydropantoate 2-reductase  55.7 
 
 		 306 aa  332  6e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  56.51 
 
 		 312 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.399113 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0729  2-dehydropantoate 2-reductase  57 
 
 		 306 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.691763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0018  2-dehydropantoate 2-reductase  56.03 
 
 		 306 aa  328  6e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0021  2-dehydropantoate 2-reductase  54.72 
 
 		 306 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0313  2-dehydropantoate 2-reductase  54.69 
 
 		 307 aa  318  9e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.82281 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2600  2-dehydropantoate 2-reductase  57.23 
 
 		 311 aa  316  4e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5770  2-dehydropantoate 2-reductase  54.19 
 
 		 307 aa  314  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2967  2-dehydropantoate 2-reductase  51.27 
 
 		 311 aa  309  5e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2669  2-dehydropantoate 2-reductase  55.34 
 
 		 310 aa  302  6.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0588922  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3545  2-dehydropantoate 2-reductase  54.09 
 
 		 315 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4822  2-dehydropantoate 2-reductase  54.09 
 
 		 315 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  53.77 
 
 		 315 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4423  2-dehydropantoate 2-reductase  52.87 
 
 		 311 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.852681 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0743  ketopantoate reductase ApbA/PanE  52.87 
 
 		 311 aa  299  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0882  2-dehydropantoate 2-reductase  52.55 
 
 		 315 aa  296  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.277426 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  52.87 
 
 		 315 aa  295  7e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3781  2-dehydropantoate 2-reductase  52.3 
 
 		 312 aa  288  6e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0449567 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4203  2-dehydropantoate 2-reductase  52.72 
 
 		 315 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.379422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  55.16 
 
 		 305 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  45.75 
 
 		 306 aa  271  9e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2980  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  46.32 
 
 		 323 aa  268  7e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0174  2-dehydropantoate 2-reductase  51.29 
 
 		 313 aa  267  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0059  2-dehydropantoate 2-reductase  47 
 
 		 321 aa  248  9e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0067  2-dehydropantoate 2-reductase  47.32 
 
 		 321 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4552  2-dehydropantoate 2-reductase  44.84 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3883  2-dehydropantoate 2-reductase  49.36 
 
 		 312 aa  236  3e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535579 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3518  2-dehydropantoate 2-reductase  47.28 
 
 		 305 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1405  2-dehydropantoate 2-reductase  43.18 
 
 		 307 aa  235  6e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0600  2-dehydropantoate 2-reductase  41.1 
 
 		 314 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000137771  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02788  2-dehydropantoate 2-reductase  47.56 
 
 		 312 aa  229  5e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2408  2-dehydropantoate 2-reductase  44.41 
 
 		 306 aa  225  9e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0790989 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1964  2-dehydropantoate 2-reductase  39.42 
 
 		 314 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00305796  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4116  2-dehydropantoate 2-reductase  41.88 
 
 		 308 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.605632 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1746  2-dehydropantoate 2-reductase  39.14 
 
 		 314 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1884  2-dehydropantoate 2-reductase  39.14 
 
 		 314 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1696  2-dehydropantoate 2-reductase  38.14 
 
 		 314 aa  210  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231571  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1918  2-dehydropantoate 2-reductase  39.47 
 
 		 314 aa  209  5e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000931177 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1107  2-dehydropantoate 2-reductase  44.52 
 
 		 319 aa  208  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1738  2-dehydropantoate 2-reductase  39.42 
 
 		 314 aa  207  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0314725  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1991  2-dehydropantoate 2-reductase  39.14 
 
 		 314 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1913  ketopantoate reductase ApbA/PanE  41.98 
 
 		 304 aa  205  9e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1877  2-dehydropantoate 2-reductase  38.82 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3467  2-dehydropantoate 2-reductase  38.82 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000905297  hitchhiker  8.32908e-18 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06250  2-dehydropantoate 2-reductase  45.16 
 
 		 305 aa  202  8e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4737  ketopantoate reductase ApbA/PanE  44.87 
 
 		 310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0294  2-dehydropantoate 2-reductase  32.79 
 
 		 307 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.220777  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  38.31 
 
 		 307 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  37.99 
 
 		 307 aa  166  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  36.39 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  34.77 
 
 		 311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  29.86 
 
 		 309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  33.66 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  31.45 
 
 		 337 aa  119  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  30.38 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  29.43 
 
 		 332 aa  113  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  30.03 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  30.15 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  30.15 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  31.17 
 
 		 333 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  28.91 
 
 		 306 aa  108  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  30.03 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  29.45 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  31.75 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  29.06 
 
 		 335 aa  102  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  29.75 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  31.01 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  31.37 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  28.52 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  31.37 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  31.01 
 
 		 315 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  30.87 
 
 		 345 aa  99.8  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  29.28 
 
 		 316 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  30.52 
 
 		 341 aa  99  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  25.9 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  29.28 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  30.54 
 
 		 324 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  30.5 
 
 		 316 aa  96.7  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  30.31 
 
 		 312 aa  95.9  9e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  29.93 
 
 		 336 aa  95.5  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  29.17 
 
 		 331 aa  94.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2865  2-dehydropantoate 2-reductase  26.76 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  28.48 
 
 		 335 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  29.49 
 
 		 326 aa  93.2  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  28.9 
 
 		 299 aa  93.2  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  29.17 
 
 		 326 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  26.61 
 
 		 325 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  27.58 
 
 		 324 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  28.95 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  29.11 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  27.78 
 
 		 325 aa  91.7  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  28.09 
 
 		 319 aa  90.5  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>