More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0211 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 324 aa  640    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  89.16 
 
 		 324 aa  560  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  79.32 
 
 		 325 aa  501  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1558  2-dehydropantoate 2-reductase  99.6 
 
 		 447 aa  494  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  63.16 
 
 		 325 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  62.93 
 
 		 335 aa  430  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  63.24 
 
 		 342 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  62.93 
 
 		 325 aa  420  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  62.23 
 
 		 346 aa  419  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  62.31 
 
 		 325 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  61.3 
 
 		 353 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  60.06 
 
 		 324 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  59.44 
 
 		 324 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  58.77 
 
 		 326 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  60.19 
 
 		 323 aa  390  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  57.86 
 
 		 332 aa  377  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  56.6 
 
 		 332 aa  370  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  54.97 
 
 		 326 aa  365  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  57.59 
 
 		 333 aa  363  3e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  55.14 
 
 		 336 aa  350  2e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  54.77 
 
 		 335 aa  343  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  54.97 
 
 		 335 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  52.73 
 
 		 336 aa  335  5e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  54.35 
 
 		 335 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  54.35 
 
 		 335 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  51.23 
 
 		 337 aa  331  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  47.48 
 
 		 339 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00418767  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3558  2-dehydropantoate 2-reductase  48.92 
 
 		 325 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  45.94 
 
 		 327 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3234  2-dehydropantoate 2-reductase  48.92 
 
 		 325 aa  279  6e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  47.37 
 
 		 326 aa  278  8e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  47.81 
 
 		 331 aa  277  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  47.37 
 
 		 326 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  47.06 
 
 		 326 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3341  2-dehydropantoate 2-reductase  47.84 
 
 		 324 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2487  2-dehydropantoate 2-reductase  47.84 
 
 		 329 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1471  2-dehydropantoate 2-reductase  47.53 
 
 		 329 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1964  2-dehydropantoate 2-reductase  47.53 
 
 		 329 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.734659  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1238  2-dehydropantoate 2-reductase  47.53 
 
 		 329 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  46.71 
 
 		 325 aa  270  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5382  2-dehydropantoate 2-reductase  43.96 
 
 		 327 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324063  normal  0.227406 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0197  2-dehydropantoate 2-reductase  46.77 
 
 		 324 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2371  2-dehydropantoate 2-reductase  46.95 
 
 		 333 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2330  2-dehydropantoate 2-reductase  46.39 
 
 		 337 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.787912  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4110  2-dehydropantoate 2-reductase  46.65 
 
 		 336 aa  263  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal  0.957383 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1224  2-dehydropantoate 2-reductase  43.34 
 
 		 327 aa  259  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318793 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2115  2-dehydropantoate 2-reductase  47.65 
 
 		 329 aa  258  7e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0135  2-dehydropantoate 2-reductase  46.3 
 
 		 324 aa  257  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1345  2-dehydropantoate 2-reductase  45.14 
 
 		 332 aa  255  6e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162184  normal  0.0787128 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1915  2-dehydropantoate 2-reductase  45.14 
 
 		 332 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1845  2-dehydropantoate 2-reductase  44.83 
 
 		 332 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.995272  normal  0.0110748 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5228  2-dehydropantoate 2-reductase  44.51 
 
 		 332 aa  250  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1724  2-dehydropantoate 2-reductase  40.56 
 
 		 331 aa  249  5e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6152  2-dehydropantoate 2-reductase  44.2 
 
 		 332 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1927  2-dehydropantoate 2-reductase  44.2 
 
 		 332 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193569  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1950  2-dehydropantoate 2-reductase  43.89 
 
 		 332 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0818482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1796  2-dehydropantoate 2-reductase  42.02 
 
 		 341 aa  238  6.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275897 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1471  2-dehydropantoate 2-reductase  44.65 
 
 		 334 aa  238  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0234  2-dehydropantoate 2-reductase  43.61 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0153  2-dehydropantoate 2-reductase  43.77 
 
 		 351 aa  231  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45590  hypothetical protein  39.05 
 
 		 359 aa  199  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1818  2-dehydropantoate 2-reductase  32.39 
 
 		 327 aa  188  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3888  2-dehydropantoate 2-reductase  35.29 
 
 		 324 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0769062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3657  ketopantoate reductase ApbA/PanE  46.37 
 
 		 223 aa  158  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7671 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  32.49 
 
 		 301 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  31.45 
 
 		 299 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  32.18 
 
 		 300 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  30.84 
 
 		 314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03720  2-dehydropantoate 2-reductase  33.54 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2699  2-dehydropantoate 2-reductase  34.52 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0294  2-dehydropantoate 2-reductase  29.75 
 
 		 307 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.220777  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  30.89 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  31.46 
 
 		 315 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  32.19 
 
 		 323 aa  113  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  32.19 
 
 		 341 aa  113  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  30.63 
 
 		 315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3892  2-dehydropantoate 2-reductase  30.79 
 
 		 310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  30.5 
 
 		 319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  31.17 
 
 		 306 aa  110  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  30.28 
 
 		 316 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  31.19 
 
 		 345 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  33.11 
 
 		 312 aa  108  9.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  32.29 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  29.32 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  30.96 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  29.65 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  30.96 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2981  2-dehydropantoate 2-reductase  27.68 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  28.66 
 
 		 309 aa  106  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  29.65 
 
 		 295 aa  105  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  31.99 
 
 		 318 aa  105  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  30.19 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  30 
 
 		 305 aa  103  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  30.19 
 
 		 325 aa  103  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  30.63 
 
 		 316 aa  102  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  31.27 
 
 		 312 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  30.38 
 
 		 311 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  28.53 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  28.93 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  29.73 
 
 		 311 aa  99.8  5e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>