More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2793 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 336 aa  689    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  79.17 
 
 		 337 aa  554  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  65.48 
 
 		 336 aa  456  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  63.77 
 
 		 335 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  62.8 
 
 		 335 aa  427  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  62.5 
 
 		 335 aa  425  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  62.5 
 
 		 335 aa  425  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  60.18 
 
 		 333 aa  420  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  62.85 
 
 		 332 aa  413  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  61.92 
 
 		 332 aa  412  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  57.37 
 
 		 339 aa  393  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00418767  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  56.15 
 
 		 335 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  55.06 
 
 		 353 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  53.7 
 
 		 324 aa  354  8.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  55.52 
 
 		 325 aa  348  6e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  54.09 
 
 		 342 aa  347  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  53.94 
 
 		 346 aa  345  7e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  52.02 
 
 		 324 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  51.4 
 
 		 326 aa  342  5e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  52.32 
 
 		 326 aa  338  5e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  51.4 
 
 		 324 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  54.06 
 
 		 324 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  54.04 
 
 		 325 aa  332  5e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  52.2 
 
 		 325 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  51.26 
 
 		 325 aa  323  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  46.25 
 
 		 323 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1558  2-dehydropantoate 2-reductase  47.24 
 
 		 447 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  43.61 
 
 		 326 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4110  2-dehydropantoate 2-reductase  45.82 
 
 		 336 aa  271  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal  0.957383 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  43.3 
 
 		 326 aa  269  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  43.61 
 
 		 326 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3234  2-dehydropantoate 2-reductase  44.41 
 
 		 325 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  42.99 
 
 		 327 aa  263  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3558  2-dehydropantoate 2-reductase  43.79 
 
 		 325 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1724  2-dehydropantoate 2-reductase  42.14 
 
 		 331 aa  261  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  42.6 
 
 		 331 aa  260  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1224  2-dehydropantoate 2-reductase  43.34 
 
 		 327 aa  258  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318793 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5382  2-dehydropantoate 2-reductase  42.72 
 
 		 327 aa  252  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324063  normal  0.227406 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  43.17 
 
 		 325 aa  252  7e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2487  2-dehydropantoate 2-reductase  39.75 
 
 		 329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3341  2-dehydropantoate 2-reductase  39.75 
 
 		 324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1964  2-dehydropantoate 2-reductase  39.43 
 
 		 329 aa  241  9e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.734659  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1471  2-dehydropantoate 2-reductase  39.43 
 
 		 329 aa  241  9e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1238  2-dehydropantoate 2-reductase  39.43 
 
 		 329 aa  241  9e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0135  2-dehydropantoate 2-reductase  42.24 
 
 		 324 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1345  2-dehydropantoate 2-reductase  40.06 
 
 		 332 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162184  normal  0.0787128 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2371  2-dehydropantoate 2-reductase  39.38 
 
 		 333 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0197  2-dehydropantoate 2-reductase  42.99 
 
 		 324 aa  238  8e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2330  2-dehydropantoate 2-reductase  38.89 
 
 		 337 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.787912  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5228  2-dehydropantoate 2-reductase  39.43 
 
 		 332 aa  235  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2115  2-dehydropantoate 2-reductase  38.17 
 
 		 329 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1950  2-dehydropantoate 2-reductase  39.12 
 
 		 332 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0818482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6152  2-dehydropantoate 2-reductase  39.12 
 
 		 332 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1927  2-dehydropantoate 2-reductase  39.12 
 
 		 332 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193569  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1915  2-dehydropantoate 2-reductase  39.43 
 
 		 332 aa  229  7e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1845  2-dehydropantoate 2-reductase  39.75 
 
 		 332 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.995272  normal  0.0110748 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1796  2-dehydropantoate 2-reductase  40.24 
 
 		 341 aa  223  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275897 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0234  2-dehydropantoate 2-reductase  42.95 
 
 		 325 aa  222  8e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1471  2-dehydropantoate 2-reductase  39.47 
 
 		 334 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0153  2-dehydropantoate 2-reductase  39.81 
 
 		 351 aa  209  6e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45590  hypothetical protein  34.06 
 
 		 359 aa  177  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1818  2-dehydropantoate 2-reductase  32.81 
 
 		 327 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3657  ketopantoate reductase ApbA/PanE  41.53 
 
 		 223 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7671 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3888  2-dehydropantoate 2-reductase  31.13 
 
 		 324 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0769062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  31.46 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  32.72 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  31.94 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  32.01 
 
 		 335 aa  134  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  32.83 
 
 		 309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  30.72 
 
 		 316 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  31.34 
 
 		 316 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  31.34 
 
 		 316 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  31.83 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  31.31 
 
 		 300 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  29.71 
 
 		 316 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  31.23 
 
 		 315 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  29.78 
 
 		 302 aa  122  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  30.18 
 
 		 341 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3118  2-dehydropantoate 2-reductase  31.35 
 
 		 312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  30.09 
 
 		 299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  29.71 
 
 		 316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  32.62 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2699  2-dehydropantoate 2-reductase  30.42 
 
 		 322 aa  119  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  30.03 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  32.18 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  29.39 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03720  2-dehydropantoate 2-reductase  30.72 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  31 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  30.03 
 
 		 301 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6167  2-dehydropantoate 2-reductase  30.28 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  28.4 
 
 		 312 aa  114  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  30.92 
 
 		 306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  31.04 
 
 		 316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  29.1 
 
 		 311 aa  113  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2936  2-dehydropantoate 2-reductase  30.89 
 
 		 312 aa  113  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178942 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  28.26 
 
 		 311 aa  112  6e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  30.94 
 
 		 298 aa  112  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  28.21 
 
 		 302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  30.65 
 
 		 315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  30.12 
 
 		 329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>