More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_2330 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_2330  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
337 aa  646    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.787912  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1964  2-dehydropantoate 2-reductase  97.33 
 
 
329 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.734659  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1471  2-dehydropantoate 2-reductase  97.33 
 
 
329 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2487  2-dehydropantoate 2-reductase  97.33 
 
 
329 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1238  2-dehydropantoate 2-reductase  97.33 
 
 
329 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3341  2-dehydropantoate 2-reductase  96.99 
 
 
324 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2371  2-dehydropantoate 2-reductase  98.81 
 
 
333 aa  609  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2115  2-dehydropantoate 2-reductase  89.32 
 
 
329 aa  560  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5228  2-dehydropantoate 2-reductase  74.4 
 
 
332 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1345  2-dehydropantoate 2-reductase  73.8 
 
 
332 aa  455  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162184  normal  0.0787128 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6152  2-dehydropantoate 2-reductase  73.19 
 
 
332 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1927  2-dehydropantoate 2-reductase  73.19 
 
 
332 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193569  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1950  2-dehydropantoate 2-reductase  72.29 
 
 
332 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0818482  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1915  2-dehydropantoate 2-reductase  72.29 
 
 
332 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1845  2-dehydropantoate 2-reductase  70.48 
 
 
332 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.995272  normal  0.0110748 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  54.22 
 
 
326 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  53.92 
 
 
326 aa  319  5e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  53.61 
 
 
326 aa  315  6e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3234  2-dehydropantoate 2-reductase  52.41 
 
 
325 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3558  2-dehydropantoate 2-reductase  51.81 
 
 
325 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  51.37 
 
 
331 aa  297  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  50.6 
 
 
325 aa  290  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0135  2-dehydropantoate 2-reductase  49.7 
 
 
324 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878184  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5382  2-dehydropantoate 2-reductase  47.29 
 
 
327 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324063  normal  0.227406 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  46.99 
 
 
327 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1224  2-dehydropantoate 2-reductase  47.29 
 
 
327 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.318793 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1724  2-dehydropantoate 2-reductase  45.68 
 
 
331 aa  276  4e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  46.69 
 
 
324 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1796  2-dehydropantoate 2-reductase  47.18 
 
 
341 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.275897 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0153  2-dehydropantoate 2-reductase  49.69 
 
 
351 aa  266  4e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0197  2-dehydropantoate 2-reductase  45.89 
 
 
324 aa  263  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431306  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  42.02 
 
 
325 aa  259  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  42.34 
 
 
353 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  42.94 
 
 
335 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  45.18 
 
 
324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0234  2-dehydropantoate 2-reductase  44.76 
 
 
325 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  40.96 
 
 
324 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  41.57 
 
 
324 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  40.43 
 
 
333 aa  243  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  41.41 
 
 
332 aa  243  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  40.06 
 
 
346 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  40.74 
 
 
337 aa  242  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  40.74 
 
 
332 aa  241  9e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  41.74 
 
 
335 aa  241  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  40.49 
 
 
342 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  42.95 
 
 
336 aa  238  9e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  42.17 
 
 
325 aa  238  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  40.99 
 
 
326 aa  236  6e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  42.55 
 
 
323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  39.82 
 
 
326 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  40.98 
 
 
325 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  38.56 
 
 
336 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  39.45 
 
 
325 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  38.82 
 
 
335 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  38.51 
 
 
335 aa  219  7e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  38.51 
 
 
335 aa  219  7e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1558  2-dehydropantoate 2-reductase  46.33 
 
 
447 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  36.77 
 
 
339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00418767  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4110  2-dehydropantoate 2-reductase  38.85 
 
 
336 aa  199  7.999999999999999e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal  0.957383 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1818  2-dehydropantoate 2-reductase  32.29 
 
 
327 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1471  2-dehydropantoate 2-reductase  36.21 
 
 
334 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45590  hypothetical protein  36.53 
 
 
359 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3657  ketopantoate reductase ApbA/PanE  47.43 
 
 
223 aa  153  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7671 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3888  2-dehydropantoate 2-reductase  37.42 
 
 
324 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0769062  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  28.79 
 
 
329 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2699  2-dehydropantoate 2-reductase  35.02 
 
 
322 aa  95.9  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122985  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03720  2-dehydropantoate 2-reductase  32.13 
 
 
314 aa  94.7  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1979  2-dehydropantoate 2-reductase  30.03 
 
 
313 aa  92  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0057409  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  31.23 
 
 
312 aa  90.5  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  30 
 
 
302 aa  90.1  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  25.38 
 
 
316 aa  89.7  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  29.36 
 
 
305 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  28.53 
 
 
307 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2858  2-dehydropantoate 2-reductase  27.36 
 
 
322 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10126  2-dehydropantoate 2-reductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00740)  26.65 
 
 
367 aa  84  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00458095  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0791  2-dehydropantoate 2-reductase  28.74 
 
 
303 aa  82.8  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2981  2-dehydropantoate 2-reductase  26.51 
 
 
319 aa  82.8  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.3758  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  27.96 
 
 
316 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  27.96 
 
 
316 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  28.36 
 
 
306 aa  82  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  29.57 
 
 
311 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1422  2-dehydropantoate 2-reductase  26.3 
 
 
322 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  27.53 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  27.96 
 
 
316 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  28.27 
 
 
341 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3892  2-dehydropantoate 2-reductase  26.27 
 
 
310 aa  78.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  29.7 
 
 
302 aa  79  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  29.22 
 
 
319 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  29.27 
 
 
319 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  28.92 
 
 
315 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  28.03 
 
 
307 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  27.58 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 
323 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  26.73 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  28.95 
 
 
345 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  30.69 
 
 
315 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  26.4 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  27.71 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  25.23 
 
 
316 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  26.69 
 
 
299 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>