More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2487 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2487  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
329 aa  630  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1471  2-dehydropantoate 2-reductase  99.39 
 
 
329 aa  627  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1964  2-dehydropantoate 2-reductase  99.39 
 
 
329 aa  627  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.734659  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1238  2-dehydropantoate 2-reductase  99.39 
 
 
329 aa  627  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3341  2-dehydropantoate 2-reductase  99.07 
 
 
324 aa  616  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2371  2-dehydropantoate 2-reductase  98.5 
 
 
333 aa  608  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2330  2-dehydropantoate 2-reductase  97.33 
 
 
337 aa  607  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.787912  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2115  2-dehydropantoate 2-reductase  91.19 
 
 
329 aa  565  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5228  2-dehydropantoate 2-reductase  75.62 
 
 
332 aa  463  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1345  2-dehydropantoate 2-reductase  75 
 
 
332 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162184  normal  0.0787128 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6152  2-dehydropantoate 2-reductase  74.38 
 
 
332 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1927  2-dehydropantoate 2-reductase  74.38 
 
 
332 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193569  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1950  2-dehydropantoate 2-reductase  73.46 
 
 
332 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0818482  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1915  2-dehydropantoate 2-reductase  73.46 
 
 
332 aa  447  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1845  2-dehydropantoate 2-reductase  71.6 
 
 
332 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.995272  normal  0.0110748 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  55.56 
 
 
326 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  55.25 
 
 
326 aa  322  4e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3234  2-dehydropantoate 2-reductase  53.85 
 
 
325 aa  319  5e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  54.94 
 
 
326 aa  318  9e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3558  2-dehydropantoate 2-reductase  53.23 
 
 
325 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  52.65 
 
 
331 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  52.16 
 
 
325 aa  295  9e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0135  2-dehydropantoate 2-reductase  50.46 
 
 
324 aa  285  5e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878184  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5382  2-dehydropantoate 2-reductase  48.46 
 
 
327 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324063  normal  0.227406 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  48.15 
 
 
327 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1224  2-dehydropantoate 2-reductase  48.46 
 
 
327 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.318793 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1724  2-dehydropantoate 2-reductase  46.52 
 
 
331 aa  279  4e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  47.84 
 
 
324 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1796  2-dehydropantoate 2-reductase  48.33 
 
 
341 aa  274  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.275897 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0153  2-dehydropantoate 2-reductase  51.27 
 
 
351 aa  273  4.0000000000000004e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0197  2-dehydropantoate 2-reductase  47.08 
 
 
324 aa  265  5.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431306  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  43.08 
 
 
325 aa  262  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  43.38 
 
 
353 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  44.03 
 
 
335 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  46.3 
 
 
324 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0234  2-dehydropantoate 2-reductase  46.25 
 
 
325 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  41.54 
 
 
324 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  42.15 
 
 
324 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  42.99 
 
 
335 aa  246  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  41.46 
 
 
333 aa  246  4e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  41.05 
 
 
346 aa  246  4e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  42.45 
 
 
332 aa  245  8e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  41.64 
 
 
337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  41.51 
 
 
342 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  42.9 
 
 
325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  41.64 
 
 
332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  43.49 
 
 
336 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  41.9 
 
 
326 aa  239  5.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  42.01 
 
 
325 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  40.37 
 
 
326 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  43.3 
 
 
323 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  39.46 
 
 
336 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  40.44 
 
 
325 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  39.37 
 
 
335 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  39.05 
 
 
335 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  39.05 
 
 
335 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  38.28 
 
 
339 aa  218  8.999999999999998e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00418767  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1558  2-dehydropantoate 2-reductase  47.81 
 
 
447 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4110  2-dehydropantoate 2-reductase  39.87 
 
 
336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal  0.957383 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1818  2-dehydropantoate 2-reductase  33.12 
 
 
327 aa  187  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1471  2-dehydropantoate 2-reductase  37.07 
 
 
334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45590  hypothetical protein  37.78 
 
 
359 aa  172  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3657  ketopantoate reductase ApbA/PanE  47.43 
 
 
223 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7671 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3888  2-dehydropantoate 2-reductase  38.36 
 
 
324 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0769062  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  29.5 
 
 
329 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03720  2-dehydropantoate 2-reductase  32.92 
 
 
314 aa  98.6  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2699  2-dehydropantoate 2-reductase  36.27 
 
 
322 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122985  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  29.81 
 
 
302 aa  95.1  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1979  2-dehydropantoate 2-reductase  28.98 
 
 
313 aa  94  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0057409  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  31.54 
 
 
312 aa  92  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  25.78 
 
 
316 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  29.15 
 
 
305 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  29.25 
 
 
307 aa  87.4  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  29.9 
 
 
311 aa  87  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  29.97 
 
 
306 aa  86.7  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  29.81 
 
 
302 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0791  2-dehydropantoate 2-reductase  29.14 
 
 
303 aa  85.5  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  28.97 
 
 
316 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  28.97 
 
 
316 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2858  2-dehydropantoate 2-reductase  27.95 
 
 
322 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  28.97 
 
 
316 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  28.25 
 
 
298 aa  83.6  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  31.06 
 
 
315 aa  83.2  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3892  2-dehydropantoate 2-reductase  26.83 
 
 
310 aa  83.2  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2981  2-dehydropantoate 2-reductase  26.54 
 
 
319 aa  83.2  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.3758  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  28.76 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10126  2-dehydropantoate 2-reductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00740)  25.55 
 
 
367 aa  82  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00458095  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1422  2-dehydropantoate 2-reductase  27.33 
 
 
322 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  28.97 
 
 
341 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  30 
 
 
319 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  28.43 
 
 
307 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  29.94 
 
 
319 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  26.73 
 
 
312 aa  80.1  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  28.7 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  28.26 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  29.64 
 
 
345 aa  80.5  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  29.6 
 
 
323 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2991  2-dehydropantoate 2-reductase  32.17 
 
 
337 aa  80.1  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.1296  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  26.58 
 
 
309 aa  80.1  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  27.42 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>