232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3657 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3657  ketopantoate reductase ApbA/PanE  100 
 
 		 223 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7671 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0153  2-dehydropantoate 2-reductase  62.7 
 
 		 351 aa  231  7.000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0197  2-dehydropantoate 2-reductase  58.82 
 
 		 324 aa  222  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0234  2-dehydropantoate 2-reductase  58.15 
 
 		 325 aa  218  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1724  2-dehydropantoate 2-reductase  57.84 
 
 		 331 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  57.98 
 
 		 326 aa  216  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  57.45 
 
 		 326 aa  215  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5382  2-dehydropantoate 2-reductase  56.61 
 
 		 327 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324063  normal  0.227406 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0135  2-dehydropantoate 2-reductase  55.56 
 
 		 324 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  58.38 
 
 		 326 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3558  2-dehydropantoate 2-reductase  58.92 
 
 		 325 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3234  2-dehydropantoate 2-reductase  58.92 
 
 		 325 aa  211  7e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  58.33 
 
 		 331 aa  210  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  55.14 
 
 		 327 aa  209  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1224  2-dehydropantoate 2-reductase  55.03 
 
 		 327 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318793 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  45.56 
 
 		 325 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1796  2-dehydropantoate 2-reductase  55.56 
 
 		 341 aa  189  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275897 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1845  2-dehydropantoate 2-reductase  49.44 
 
 		 332 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.995272  normal  0.0110748 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5228  2-dehydropantoate 2-reductase  48.88 
 
 		 332 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  46.37 
 
 		 324 aa  158  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1345  2-dehydropantoate 2-reductase  50.56 
 
 		 332 aa  157  9e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162184  normal  0.0787128 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6152  2-dehydropantoate 2-reductase  47.75 
 
 		 332 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1927  2-dehydropantoate 2-reductase  47.75 
 
 		 332 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193569  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1950  2-dehydropantoate 2-reductase  48.31 
 
 		 332 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0818482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1915  2-dehydropantoate 2-reductase  48.88 
 
 		 332 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  41.53 
 
 		 336 aa  154  9e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1471  2-dehydropantoate 2-reductase  47.43 
 
 		 329 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2487  2-dehydropantoate 2-reductase  47.43 
 
 		 329 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1238  2-dehydropantoate 2-reductase  47.43 
 
 		 329 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2330  2-dehydropantoate 2-reductase  47.43 
 
 		 337 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.787912  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  41.45 
 
 		 337 aa  153  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2371  2-dehydropantoate 2-reductase  47.43 
 
 		 333 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1964  2-dehydropantoate 2-reductase  47.43 
 
 		 329 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.734659  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3341  2-dehydropantoate 2-reductase  47.43 
 
 		 324 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  42.7 
 
 		 335 aa  152  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  44.13 
 
 		 324 aa  151  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  43.35 
 
 		 324 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  43.43 
 
 		 325 aa  149  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  43.41 
 
 		 323 aa  149  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  42.77 
 
 		 324 aa  148  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2115  2-dehydropantoate 2-reductase  48.57 
 
 		 329 aa  148  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  42.2 
 
 		 353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  43.72 
 
 		 335 aa  145  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  40.84 
 
 		 332 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  41.4 
 
 		 332 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  40.57 
 
 		 346 aa  143  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  39.31 
 
 		 326 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  39.89 
 
 		 333 aa  141  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  41.67 
 
 		 336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  36.11 
 
 		 339 aa  139  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00418767  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  37.1 
 
 		 326 aa  137  8.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  39.11 
 
 		 325 aa  136  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  39.11 
 
 		 325 aa  136  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  42.25 
 
 		 325 aa  135  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  39.34 
 
 		 335 aa  134  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  39.34 
 
 		 335 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  38.64 
 
 		 342 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  39.34 
 
 		 335 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1471  2-dehydropantoate 2-reductase  33.68 
 
 		 334 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1818  2-dehydropantoate 2-reductase  35.98 
 
 		 327 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1558  2-dehydropantoate 2-reductase  44.92 
 
 		 447 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45590  hypothetical protein  33.88 
 
 		 359 aa  102  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4110  2-dehydropantoate 2-reductase  31.64 
 
 		 336 aa  99.4  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal  0.957383 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  37.93 
 
 		 307 aa  85.9  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3888  2-dehydropantoate 2-reductase  34.24 
 
 		 324 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0769062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0839  2-dehydropantoate 2-reductase  36.55 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  34.66 
 
 		 316 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  34.09 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03720  2-dehydropantoate 2-reductase  32.61 
 
 		 314 aa  78.6  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  34.66 
 
 		 316 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  30.59 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  32.02 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  34.66 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  34.66 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2865  2-dehydropantoate 2-reductase  34.15 
 
 		 311 aa  71.6  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1790  2-dehydropantoate 2-reductase  38.85 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  37.58 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2159  2-dehydropantoate 2-reductase  36.17 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  34.16 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  34.76 
 
 		 316 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1719  2-dehydropantoate 2-reductase  38.13 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11731  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1786  2-dehydropantoate 2-reductase  29.7 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.43842 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2991  2-dehydropantoate 2-reductase  29.84 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.1296  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  28.9 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  29.25 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1422  2-dehydropantoate 2-reductase  30.88 
 
 		 322 aa  67  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02389  ketopantoate reductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14497)  28.33 
 
 		 426 aa  66.6  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  37.2 
 
 		 341 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  30.28 
 
 		 329 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  32.89 
 
 		 335 aa  65.1  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  33.77 
 
 		 315 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2858  2-dehydropantoate 2-reductase  30.15 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  31.58 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1979  2-dehydropantoate 2-reductase  26.64 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0057409  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  28.98 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2981  2-dehydropantoate 2-reductase  26.2 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  29.7 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2219  2-dehydropantoate 2-reductase  35.63 
 
 		 335 aa  62  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205933  normal  0.043559 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  26.7 
 
 		 302 aa  62  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  28.98 
 
 		 307 aa  62  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>