More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3139 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
319 aa  634    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  98.12 
 
 
319 aa  617  1e-176  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  75.59 
 
 
345 aa  426  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  73.49 
 
 
325 aa  387  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  67.46 
 
 
298 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  63.18 
 
 
295 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  63.58 
 
 
313 aa  347  1e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  61.13 
 
 
299 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  62.79 
 
 
317 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  57.24 
 
 
299 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  57.58 
 
 
300 aa  331  8e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  56.42 
 
 
301 aa  329  3e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  59.21 
 
 
305 aa  330  3e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  55.67 
 
 
301 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  56 
 
 
301 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  60.42 
 
 
296 aa  295  5e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  39.93 
 
 
311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  38.36 
 
 
313 aa  157  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  39.19 
 
 
307 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  39.19 
 
 
307 aa  152  8e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  36.51 
 
 
316 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  37.87 
 
 
307 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  35.42 
 
 
315 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  36.51 
 
 
316 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  34.51 
 
 
306 aa  144  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  36.88 
 
 
315 aa  143  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  31.49 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  34.8 
 
 
315 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  31.49 
 
 
305 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  37.3 
 
 
310 aa  139  8.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  31.49 
 
 
305 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  31.17 
 
 
305 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  35.16 
 
 
312 aa  136  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  36.18 
 
 
316 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  36.18 
 
 
316 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2951  2-dehydropantoate 2-reductase  31.17 
 
 
305 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  35.16 
 
 
335 aa  135  9e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  34.63 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  34.73 
 
 
314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  34.32 
 
 
309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  30.57 
 
 
309 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  32.12 
 
 
306 aa  129  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02678  2-dehydropantoate 2-reductase  29.85 
 
 
339 aa  129  6e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.321227  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  36.16 
 
 
294 aa  129  8.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 
341 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  29.8 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  30.29 
 
 
329 aa  125  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  29.31 
 
 
302 aa  125  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  28.4 
 
 
342 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  30.25 
 
 
309 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  32.46 
 
 
318 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  32.01 
 
 
309 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  35.64 
 
 
302 aa  123  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  36.18 
 
 
316 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  28.71 
 
 
324 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2518  2-dehydropantoate 2-reductase  28.43 
 
 
311 aa  123  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254196  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2470  2-dehydropantoate 2-reductase  28.43 
 
 
311 aa  123  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1100  2-dehydropantoate 2-reductase  38.08 
 
 
302 aa  123  5e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0140808  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  33.76 
 
 
310 aa  122  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  32.31 
 
 
323 aa  122  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_003296  RS03188  2-dehydropantoate 2-reductase  33.02 
 
 
338 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  30.19 
 
 
353 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  31.45 
 
 
324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1445  2-dehydropantoate 2-reductase  27.83 
 
 
312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.219462  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  28.48 
 
 
318 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 
296 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1796  2-dehydropantoate 2-reductase  31.48 
 
 
341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.275897 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2865  2-dehydropantoate 2-reductase  30.03 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  27.76 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1115  2-dehydropantoate 2-reductase  33.44 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.275273  normal  0.917906 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0377  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 
316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  32.61 
 
 
315 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  29.45 
 
 
335 aa  116  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  29.54 
 
 
335 aa  116  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1786  2-dehydropantoate 2-reductase  29.25 
 
 
278 aa  115  6.9999999999999995e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.43842 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2500  2-dehydropantoate 2-reductase  33.95 
 
 
314 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.637616 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  31.02 
 
 
311 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1351  2-dehydropantoate 2-reductase  28.67 
 
 
307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  31.77 
 
 
312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  27.9 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  27.76 
 
 
346 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  29.23 
 
 
335 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  29.23 
 
 
335 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2858  2-dehydropantoate 2-reductase  27.73 
 
 
322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  27.52 
 
 
325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  31.15 
 
 
327 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2022  2-dehydropantoate 2-reductase  27.87 
 
 
310 aa  113  5e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1698  2-dehydropantoate 2-reductase  26.89 
 
 
306 aa  113  5e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.656315  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  29.25 
 
 
333 aa  113  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  28.18 
 
 
311 aa  113  5e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2629  2-dehydropantoate 2-reductase  33.95 
 
 
314 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  30.46 
 
 
332 aa  112  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0382  2-dehydropantoate 2-reductase  34.69 
 
 
351 aa  112  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  26.09 
 
 
307 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  29.15 
 
 
335 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1293  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 
312 aa  112  8.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.519384  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  30.03 
 
 
323 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  26.94 
 
 
305 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  30.65 
 
 
331 aa  112  9e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  29.77 
 
 
325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>