More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02678 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02678  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 339 aa  698    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.321227  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03188  2-dehydropantoate 2-reductase  40.59 
 
 		 338 aa  241  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3493  2-dehydropantoate 2-reductase  45.96 
 
 		 336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.240886  normal  0.0518644 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3780  2-dehydropantoate 2-reductase  42.46 
 
 		 337 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.146686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4857  2-dehydropantoate 2-reductase  42.46 
 
 		 337 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2563  2-dehydropantoate 2-reductase  42.28 
 
 		 351 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0895867  normal  0.0341922 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0561  2-dehydropantoate 2-reductase  42.01 
 
 		 340 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2264  2-dehydropantoate 2-reductase  42.01 
 
 		 340 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.584343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1092  2-dehydropantoate 2-reductase  42.01 
 
 		 340 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.109673  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0940  2-dehydropantoate 2-reductase  42.01 
 
 		 340 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2141  2-dehydropantoate 2-reductase  42.01 
 
 		 340 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2457  2-dehydropantoate 2-reductase  40.65 
 
 		 351 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000431048 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0936  2-dehydropantoate 2-reductase  41.69 
 
 		 340 aa  225  9e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.235019  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2587  2-dehydropantoate 2-reductase  40.06 
 
 		 351 aa  222  6e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.438378  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3175  2-dehydropantoate 2-reductase  42.01 
 
 		 344 aa  212  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5870  2-dehydropantoate 2-reductase  40.74 
 
 		 348 aa  209  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166245  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0749  2-dehydropantoate 2-reductase  39.63 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.770799  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1927  2-dehydropantoate 2-reductase  40.43 
 
 		 370 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.795027  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2539  2-dehydropantoate 2-reductase  40.43 
 
 		 376 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0470171  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4737  2-dehydropantoate 2-reductase  39.02 
 
 		 330 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0800  2-dehydropantoate 2-reductase  36.62 
 
 		 321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1081  2-dehydropantoate 2-reductase  35.98 
 
 		 337 aa  179  8e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.117992  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1772  2-dehydropantoate 2-reductase  32.53 
 
 		 355 aa  172  9e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  31.06 
 
 		 301 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  31.68 
 
 		 301 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  31.46 
 
 		 301 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  30.37 
 
 		 299 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  33.02 
 
 		 299 aa  137  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  30.77 
 
 		 300 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  30.93 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  30.86 
 
 		 313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  30.09 
 
 		 295 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0382  2-dehydropantoate 2-reductase  30.51 
 
 		 351 aa  129  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  32.9 
 
 		 296 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  30.18 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  29.85 
 
 		 319 aa  122  7e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  29.45 
 
 		 345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  29.85 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  29.69 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  29.28 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  26.55 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  25.37 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1115  2-dehydropantoate 2-reductase  30.09 
 
 		 309 aa  106  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.275273  normal  0.917906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  26.44 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  27.27 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  27.27 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1519  2-dehydropantoate 2-reductase  29.09 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.982841  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  28.15 
 
 		 335 aa  92.4  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  25.87 
 
 		 323 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  28.01 
 
 		 302 aa  90.9  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  24.92 
 
 		 311 aa  90.9  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  27.89 
 
 		 318 aa  90.5  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  25.73 
 
 		 316 aa  89.7  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1095  2-dehydropantoate 2-reductase  32.13 
 
 		 312 aa  89.4  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.82934  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  26.22 
 
 		 315 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  27.03 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1698  2-dehydropantoate 2-reductase  28.53 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.656315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  24.55 
 
 		 341 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  28.51 
 
 		 313 aa  87.8  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2382  2-dehydropantoate 2-reductase  31.86 
 
 		 314 aa  88.2  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  25.3 
 
 		 315 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  27.93 
 
 		 316 aa  86.7  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  26.89 
 
 		 316 aa  86.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  28.53 
 
 		 312 aa  85.9  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0833  2-dehydropantoate 2-reductase  28.18 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476059 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2865  2-dehydropantoate 2-reductase  25.55 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  26.69 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2165  2-dehydropantoate 2-reductase  26.09 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2858  2-dehydropantoate 2-reductase  26.99 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4530  2-dehydropantoate 2-reductase  24.93 
 
 		 355 aa  81.6  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.247613 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4927  2-dehydropantoate 2-reductase  25.31 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332007  normal  0.934837 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1422  2-dehydropantoate 2-reductase  26.7 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  24.32 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0791  2-dehydropantoate 2-reductase  26.67 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  24.85 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2500  2-dehydropantoate 2-reductase  24.32 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.637616 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0377  2-dehydropantoate 2-reductase  26.8 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  24.58 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  25.9 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  25.9 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0296  2-dehydropantoate 2-reductase  27.74 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.961677  normal  0.11487 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  25.9 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  25.9 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5912  2-dehydropantoate 2-reductase  25.45 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2605  2-dehydropantoate 2-reductase  24.55 
 
 		 314 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4708  2-dehydropantoate 2-reductase  25.55 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.392544 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2951  2-dehydropantoate 2-reductase  25.9 
 
 		 305 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3116  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  25.3 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1677  2-dehydropantoate 2-reductase  26.19 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2629  2-dehydropantoate 2-reductase  24.32 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1719  2-dehydropantoate 2-reductase  26.22 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11731  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6133  2-dehydropantoate 2-reductase  26.05 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  25.23 
 
 		 314 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1861  2-dehydropantoate 2-reductase  21.88 
 
 		 317 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1790  2-dehydropantoate 2-reductase  25.87 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  25.3 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2003  2-dehydropantoate 2-reductase  27 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  21.79 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  24.21 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>