More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0749 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I0749  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 340 aa  657    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.770799  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0561  2-dehydropantoate 2-reductase  89.41 
 
 		 340 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2264  2-dehydropantoate 2-reductase  89.41 
 
 		 340 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.584343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1092  2-dehydropantoate 2-reductase  89.12 
 
 		 340 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.109673  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2141  2-dehydropantoate 2-reductase  89.41 
 
 		 340 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0940  2-dehydropantoate 2-reductase  89.41 
 
 		 340 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0936  2-dehydropantoate 2-reductase  88.82 
 
 		 340 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.235019  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03188  2-dehydropantoate 2-reductase  68.93 
 
 		 338 aa  434  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4857  2-dehydropantoate 2-reductase  69.73 
 
 		 337 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3780  2-dehydropantoate 2-reductase  69.73 
 
 		 337 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.146686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2457  2-dehydropantoate 2-reductase  68.93 
 
 		 351 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000431048 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2587  2-dehydropantoate 2-reductase  69.82 
 
 		 351 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.438378  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2563  2-dehydropantoate 2-reductase  68.05 
 
 		 351 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0895867  normal  0.0341922 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5870  2-dehydropantoate 2-reductase  68.07 
 
 		 348 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166245  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2539  2-dehydropantoate 2-reductase  67.67 
 
 		 376 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0470171  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1927  2-dehydropantoate 2-reductase  67.67 
 
 		 370 aa  346  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.795027  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3493  2-dehydropantoate 2-reductase  56.68 
 
 		 336 aa  332  5e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.240886  normal  0.0518644 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02678  2-dehydropantoate 2-reductase  38.82 
 
 		 339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.321227  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4737  2-dehydropantoate 2-reductase  48.05 
 
 		 330 aa  225  9e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3175  2-dehydropantoate 2-reductase  45.34 
 
 		 344 aa  202  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1081  2-dehydropantoate 2-reductase  38.32 
 
 		 337 aa  185  9e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.117992  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0800  2-dehydropantoate 2-reductase  33.75 
 
 		 321 aa  181  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1772  2-dehydropantoate 2-reductase  34.69 
 
 		 355 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  35.62 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  35.62 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  33.86 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  32.69 
 
 		 301 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  34.41 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  32.04 
 
 		 295 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  33.55 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  32.04 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  35.46 
 
 		 317 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  31.38 
 
 		 315 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  29.52 
 
 		 335 aa  108  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  32.52 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  33.23 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  33.23 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  32.04 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  31.9 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  32.82 
 
 		 319 aa  107  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  31.55 
 
 		 299 aa  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  31.71 
 
 		 312 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  33.75 
 
 		 305 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  31.76 
 
 		 325 aa  99.8  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  32.93 
 
 		 316 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  31.08 
 
 		 316 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  31.11 
 
 		 345 aa  96.7  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  35.08 
 
 		 296 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  30.79 
 
 		 309 aa  89.4  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  32.14 
 
 		 310 aa  86.3  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  30.34 
 
 		 323 aa  85.9  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  28.92 
 
 		 307 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  29.18 
 
 		 326 aa  85.9  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  30.57 
 
 		 311 aa  85.5  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  27.13 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  30.46 
 
 		 341 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  26.01 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  33.96 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4530  2-dehydropantoate 2-reductase  28.37 
 
 		 355 aa  79.3  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.247613 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1115  2-dehydropantoate 2-reductase  28.04 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.275273  normal  0.917906 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0382  2-dehydropantoate 2-reductase  32.41 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  29.69 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3545  2-dehydropantoate 2-reductase  28.92 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4822  2-dehydropantoate 2-reductase  28.92 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  29.69 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  29.23 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  26.62 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0791  2-dehydropantoate 2-reductase  28.35 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  32.2 
 
 		 305 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3888  2-dehydropantoate 2-reductase  30.88 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0769062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  22.98 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  30.63 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  29.86 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  29.97 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  29.66 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2981  2-dehydropantoate 2-reductase  24.6 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0882  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.277426 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  26.19 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1979  2-dehydropantoate 2-reductase  24.6 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0057409  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  25.86 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  25.85 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1558  2-dehydropantoate 2-reductase  30.94 
 
 		 447 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  29.88 
 
 		 336 aa  69.3  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  32.29 
 
 		 312 aa  69.3  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  27.05 
 
 		 335 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  24.07 
 
 		 302 aa  69.3  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  25.21 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  25.21 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3781  2-dehydropantoate 2-reductase  28.22 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0449567 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0707  2-dehydropantoate 2-reductase  30.31 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102156  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5912  2-dehydropantoate 2-reductase  32.66 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  29.41 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  24.93 
 
 		 335 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  26.71 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1405  2-dehydropantoate 2-reductase  24.41 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0839  2-dehydropantoate 2-reductase  25.77 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1688  2-dehydropantoate 2-reductase  26.21 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.754321  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1818  2-dehydropantoate 2-reductase  22.02 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  30.84 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>