285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3175 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3175  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 344 aa  667    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4737  2-dehydropantoate 2-reductase  54.19 
 
 		 330 aa  257  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03188  2-dehydropantoate 2-reductase  49.68 
 
 		 338 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2457  2-dehydropantoate 2-reductase  52.41 
 
 		 351 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000431048 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2563  2-dehydropantoate 2-reductase  51.75 
 
 		 351 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0895867  normal  0.0341922 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2587  2-dehydropantoate 2-reductase  52.41 
 
 		 351 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.438378  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02678  2-dehydropantoate 2-reductase  42.01 
 
 		 339 aa  245  8e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.321227  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4857  2-dehydropantoate 2-reductase  49.52 
 
 		 337 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3780  2-dehydropantoate 2-reductase  49.52 
 
 		 337 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.146686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5870  2-dehydropantoate 2-reductase  52.41 
 
 		 348 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166245  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1927  2-dehydropantoate 2-reductase  52.12 
 
 		 370 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.795027  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2539  2-dehydropantoate 2-reductase  52.12 
 
 		 376 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0470171  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0936  2-dehydropantoate 2-reductase  47.42 
 
 		 340 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.235019  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2264  2-dehydropantoate 2-reductase  47.42 
 
 		 340 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.584343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1092  2-dehydropantoate 2-reductase  47.42 
 
 		 340 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.109673  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0561  2-dehydropantoate 2-reductase  47.42 
 
 		 340 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0940  2-dehydropantoate 2-reductase  47.42 
 
 		 340 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2141  2-dehydropantoate 2-reductase  47.42 
 
 		 340 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3493  2-dehydropantoate 2-reductase  44.11 
 
 		 336 aa  215  8e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.240886  normal  0.0518644 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0749  2-dehydropantoate 2-reductase  45.34 
 
 		 340 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.770799  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1772  2-dehydropantoate 2-reductase  33.73 
 
 		 355 aa  166  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1081  2-dehydropantoate 2-reductase  36.25 
 
 		 337 aa  145  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.117992  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0800  2-dehydropantoate 2-reductase  29.5 
 
 		 321 aa  143  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  32.6 
 
 		 295 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  30.89 
 
 		 301 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  30.79 
 
 		 301 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  30.79 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  31.82 
 
 		 325 aa  105  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  30.19 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  33.04 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  32.32 
 
 		 317 aa  102  9e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  31.05 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  30.94 
 
 		 299 aa  99  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  32.69 
 
 		 319 aa  98.6  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  30.07 
 
 		 300 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  32.69 
 
 		 319 aa  96.7  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  26.23 
 
 		 311 aa  95.5  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  30.6 
 
 		 298 aa  93.2  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  30.06 
 
 		 345 aa  92  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1115  2-dehydropantoate 2-reductase  28.26 
 
 		 309 aa  89.7  7e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.275273  normal  0.917906 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  30.31 
 
 		 315 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  30.53 
 
 		 315 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  32.24 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1861  2-dehydropantoate 2-reductase  30.1 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  26.41 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0382  2-dehydropantoate 2-reductase  31.08 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3535  2-dehydropantoate 2-reductase  25.87 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40675  hitchhiker  0.0000949952 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  24.31 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  25.31 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  25.15 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  27.83 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0708  2-dehydropantoate 2-reductase  25.3 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1698  2-dehydropantoate 2-reductase  25.88 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.656315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3603  2-dehydropantoate 2-reductase  25.53 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  27.3 
 
 		 337 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2052  2-dehydropantoate 2-reductase  27.81 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3116  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  27.99 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1677  2-dehydropantoate 2-reductase  29.73 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  28.22 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  27.52 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3648  2-dehydropantoate 2-reductase  24.4 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0849606  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  29.27 
 
 		 294 aa  69.3  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  27.64 
 
 		 316 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  29.32 
 
 		 309 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4530  2-dehydropantoate 2-reductase  27.43 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.247613 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0557  ketopantoate reductase ApbA/PanE  27.69 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.302954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  30.75 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3116  2-dehydropantoate 2-reductase  24.85 
 
 		 343 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  27.08 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3726  2-dehydropantoate 2-reductase  24.64 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0533  ketopantoate reductase ApbA/PanE  27.69 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6340  2-dehydropantoate 2-reductase  26.35 
 
 		 347 aa  67  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1673  ketopantoate reductase ApbA/PanE  27.69 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1695  ketopantoate reductase ApbA/PanE-like protein  27.69 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2605  2-dehydropantoate 2-reductase  27.02 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4927  2-dehydropantoate 2-reductase  28.8 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332007  normal  0.934837 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1723  ketopantoate reductase ApbA/PanE  27.69 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.711694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1739  ketopantoate reductase ApbA/PanE  27.69 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  26.02 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  29.38 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  26.63 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  26.63 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3557  2-dehydropantoate 2-reductase  25.66 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2382  2-dehydropantoate 2-reductase  26.65 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  29.36 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1893  2-dehydropantoate 2-reductase  25.57 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00746651  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0791  2-dehydropantoate 2-reductase  26.48 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  26.49 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  25.99 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  25.73 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1979  2-dehydropantoate 2-reductase  29.95 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0057409  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  27 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  26.49 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  28.04 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  26.69 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1224  2-dehydropantoate 2-reductase  27.3 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  25.52 
 
 		 332 aa  62.8  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57160  2-dehydropantoate 2-reductase  29.28 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4968  2-dehydropantoate 2-reductase  30.96 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>