239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6340 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6340  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 347 aa  691    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3557  2-dehydropantoate 2-reductase  27.03 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1688  2-dehydropantoate 2-reductase  24.93 
 
 		 351 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.754321  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2991  2-dehydropantoate 2-reductase  29.65 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.1296  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4530  2-dehydropantoate 2-reductase  27.05 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.247613 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2022  2-dehydropantoate 2-reductase  26.46 
 
 		 310 aa  97.4  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2470  2-dehydropantoate 2-reductase  25.38 
 
 		 311 aa  96.3  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2518  2-dehydropantoate 2-reductase  25.38 
 
 		 311 aa  96.3  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254196  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1698  2-dehydropantoate 2-reductase  26.77 
 
 		 306 aa  94.4  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.656315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  27.24 
 
 		 302 aa  92.4  9e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  28.22 
 
 		 335 aa  92  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  28.18 
 
 		 316 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  28.18 
 
 		 316 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1519  2-dehydropantoate 2-reductase  26.87 
 
 		 309 aa  86.7  6e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.982841  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  26.37 
 
 		 314 aa  85.9  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1115  2-dehydropantoate 2-reductase  27.44 
 
 		 309 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.275273  normal  0.917906 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  26.9 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  27.78 
 
 		 316 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  26.65 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34380  ketopantoate reductase  32.77 
 
 		 368 aa  79.3  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0495871  normal  0.346815 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  27.76 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  26.16 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  27.03 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  25.93 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  25.93 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  23.64 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  26.85 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  26.88 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  27.91 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  26.23 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  25.72 
 
 		 346 aa  72.4  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  27.27 
 
 		 319 aa  72  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  25.85 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  24.84 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1445  2-dehydropantoate 2-reductase  22.46 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.219462  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  26.98 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0382  2-dehydropantoate 2-reductase  28.89 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  26.22 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  27.27 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1477  ketopantoate reductase  22.26 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  20.55 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  22.75 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03288  2-dehydropantoate 2-reductase  25.29 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  26.32 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  23.03 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5912  2-dehydropantoate 2-reductase  26.5 
 
 		 314 aa  67  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  26.14 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  21.5 
 
 		 309 aa  67  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0791  2-dehydropantoate 2-reductase  27.04 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  23.78 
 
 		 298 aa  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  25.38 
 
 		 324 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  21.18 
 
 		 309 aa  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  25.52 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  24.85 
 
 		 345 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  24.46 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3165  2-dehydropantoate 2-reductase  21.67 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0839  2-dehydropantoate 2-reductase  26.1 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2605  2-dehydropantoate 2-reductase  26.42 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  24.64 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0600  2-dehydropantoate 2-reductase  21.39 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000137771  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  23.71 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  25.48 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  25.22 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  26.44 
 
 		 307 aa  62.4  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  22.39 
 
 		 339 aa  62  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00418767  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1293  2-dehydropantoate 2-reductase  26.75 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.519384  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  26.13 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  27.91 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  26.35 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  24.68 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  27.11 
 
 		 309 aa  62  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_003296  RS03188  2-dehydropantoate 2-reductase  27.27 
 
 		 338 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  24.4 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0193  2-dehydropantoate 2-reductase  24.41 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0380974  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  26.32 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  24.17 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4021  2-dehydropantoate 2-reductase  21.3 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  26.03 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02678  2-dehydropantoate 2-reductase  21.08 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.321227  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  25.39 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1677  2-dehydropantoate 2-reductase  27.5 
 
 		 319 aa  59.3  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1772  2-dehydropantoate 2-reductase  22.12 
 
 		 355 aa  59.3  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0126  2-dehydropantoate 2-reductase  20.66 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00267865  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  28.08 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  23.53 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  24.33 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  24.38 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3747  2-dehydropantoate 2-reductase  21.45 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684201  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  25.4 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1083  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208134 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  24.66 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002696  2-dehydropantoate 2-reductase  23.75 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  23.97 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1095  2-dehydropantoate 2-reductase  22.71 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.82934  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1926  2-dehydropantoate 2-reductase  26.73 
 
 		 315 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000062548  hitchhiker  0.000000000000153659 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  24.05 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  25.67 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  25.21 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  24.85 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>